萘普生和酵母DNA相互作用的荧光光谱研究

使用紫外和荧光光谱法研究了萘普生和酵母DNA之间的相互作用。酵母DNA对萘普生的荧光存在强烈的猝灭作用，其作用方式随DNA浓度的变化而发生转变。用Stern-Volmer方程与Scatchard方程两种方法得到相同结果：在较低的DNA浓度下，萘普生与DNA间的作用较弱，而在较高DNA浓度时，萘普生与DNA的作用较强，键合位点数也随着酵母DNA浓度的升高而在临界酵母DNA浓度100 mmol/L附近出现转变。紫外光谱、离子强度的影响和I^-猝灭等研究表明，DNA浓度的变化并不改变两者间的作用方式，它们之间始终是一种沟槽作用模式。     

儿茶素与DNA分子间的相互作用机制研究

采用荧光光谱法和紫外光谱法研究了在生理酸度(pH=7.4)条件下儿茶素与DNA的作用方式.通过研究DNA与儿茶素相互作用的荧光和紫外光谱,并结合溴化乙锭荧光探针、Ⅰ￣离子效应、DNA熔点效应及盐效应等实验,探讨儿茶素与DNA的作用模式.研究结果表明儿茶素与DNA主要以嵌插方式发生结合.根据DNA对儿茶素荧光的猝灭,计算出儿茶素与DNA的结合常数为9.44×10-4L·mol-1,结合位点数为1.18.     

新型1,8-萘酰亚胺类化合物与DNA相互作用的研究

用荧光光谱、紫外光谱、粘度法对两种新型1,8-萘酰亚胺类化合物N-羟乙基-3-硝基-4-溴-1,8-萘酰亚胺(B)和N-羟乙基-4-羟乙基-3-硝基-1,8-萘酰亚胺(N)与DNA的相互作用进行了研究,考察和比较了它们与DNA的作用模式和强度,求出了两种化合物的嵌入常数。结果表明,化合物N和B主要以插入方式与DNA作用,且化合物N与DNA的作用强于化合物B。     

1,4-二甲基-6,8-二甲氧基-9,10-蒽醌的合成及其与牛血清白蛋白和DNA的相互作用

合成了大黄素类蒽醌衍生物1,4-二甲基-6,8-二甲氧基-9,10-蒽醌(1)并应用紫外光谱、荧光光谱、圆二色谱等方法研究了其与牛血清白蛋白(BSA)和小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用.荧光光谱结果表明,化合物1与BSA的相互作用主要以静态猝灭方式使BSA的内源性荧光发生猝灭;圆二色谱表明,化合物1通过疏水作用及形成氢键破坏了α-螺旋结构,导致BSA分子中的α-螺旋含量下降.在pH 7.4时固定DNA的浓度,加入化合物1后,紫外光谱的最大吸收峰发生红移且吸光度加大.荧光光谱表明,化合物1与DNA-4S green NC的结合为竞争性抑制,并可使溶液体系荧光猝灭;圆二色谱表明,随着化合物1的加入,DNA碱基间作用能迅速减弱,表明化合物1与DNA之间为嵌插作用.此外,MTT方法的结果表明,化合物1对结肠癌细胞株HCT116增殖有明显的抑制作用.     

配合物[CO2(EGTB)Cl2]·(BF4)2·5H2O与DNA相互作用的研究

用紫外光谱法、荧光光谱法、黏度法、凝胶电泳法研究了双核钴(Ⅱ)配合物[Co2(EGTB)Cl2]·(BF4)2·5H2O和DNA的相互作用,在pH=7.2的缓冲体系中,求得配合物与DNA的结合常数.结果表明,配合物在接近生理条件下能有效地断裂pBR322DNA,同时可使DNA的粘度增加,使EB-DNA体系的荧光强度降低.配合物与DNA的荧光光谱和紫外光谱表明,配合物与DNA的作用既存在部分插入结合又存在静电结合模式.     

分子模拟及光谱法研究2-乙基-3-(3-硝基苯基)喹唑啉-4-酮与小牛胸腺DNA的相互作用

合成了2-乙基-3-(3-硝基苯基)喹唑啉-4-酮(ENPQO),用紫外光谱法、荧光光谱法、荧光偏振法、离子强度法及分子模拟法研究了ENPQO与小牛胸腺DNA(ct DNA)的相互作用。紫外光谱法显示ct DNA与ENPQO作用后,引起ENPQO紫外吸收光谱的增色效应;在以吖啶橙(AO)为荧光探针的实验中,随着ENPQO浓度的增加,ct DNA-AO体系的荧光被猝灭,其猝灭过程主要是静态猝灭,ENPQO对ct DNA-AO体系的荧光偏振基本无影响;不同浓度的Na Cl溶液未削弱ENPQO对ct DNA-AO的猝灭程度。以上结果均表明ENPQO与ct DNA之间的作用方式主要为沟槽结合。利用分子模拟对接技术预测了ENPQO与ct DNA的结合最优构象,与光谱实验结果一致。     

1,4-二甲基-6,8-二甲氧基-9,10-蒽醌的合成及其与BSA和ct-DNA的相互作用

合成了大黄素类蒽醌衍生物1,4-二甲基-6,8-二甲氧基-9,10-蒽醌(1)并应用紫外光谱、荧光光谱、圆二色谱等方法研究了其与牛血清白蛋白(BSA)和小牛胸腺DNA(ct-DNA)的相互作用。荧光光谱结果表明,化合物1与BSA的相互作用主要以静态猝灭方式使BSA的内源性荧光发生猝灭;圆二色谱表明,化合物1通过疏水作用及形成氢键破坏了α-螺旋结构,导致BSA分子中的α-螺旋含量下降。在p H 7.4时固定DNA的浓度,加入化合物1后,紫外光谱的最大吸收峰发生红移且吸光度加大。荧光光谱表明,化合物1与DNA-4S green NC的结合为竞争性抑制,并可使溶液体系荧光猝灭;圆二色谱表明,随着化合物1的加入,DNA碱基间作用能迅速减弱,表明化合物1与DNA之间为嵌插作用。此外,MTT方法的结果表明,化合物1对结肠癌细胞株HCT116增殖有明显的抑制作用。     

欧前胡素及同分异构体与DNA的作用机理及构效关系研究

在模拟人体生理条件下,采用紫外光谱法、荧光光谱法、DNA热变性及黏度法研究欧前胡素及同分异构体异欧前胡素与DNA的作用机制,并探讨其构效关系.紫外光谱表明,加入DNA后,欧前胡素和异欧前胡素的紫外光谱均呈现减色效应;荧光光谱显示,随着欧前胡素或异欧前胡素浓度的增大,DNA-BR的荧光被猝灭,表明欧前胡素和异欧前胡素对BR与DNA的结合存在竞争性抑制;盐效应、DNA热变性温度、黏度法等实验进一步证明欧前胡素和异欧前胡素与DNA的作用模式均为嵌插与静电混合作用模式.研究表明,欧前胡素和异欧前胡素均与DNA发生作用,且欧前胡素与DNA作用强于异欧前胡素.     

亚甲蓝作为光谱探针研究对-二甲氨甲基-杯[8]芳烃与DNA间的作用

亚甲蓝作为光谱探针研究对-二甲氨甲基-杯[8]芳烃与DNA间的作用;对二甲基杯[8]芳烃;小牛胸腺DNA;紫外光谱法;荧光探针     

荧光猝灭法研究氟比洛芬与DNA相互作用

采用荧光光谱法和紫外光谱法, 在生理条件下(pH=7.40)对氟比洛芬(FP)与脱氧核糖核酸(DNA)的作用方式进行了研究.证实了氟比洛芬通过沟槽结合方式与DNA发生相互作用.实验表明, DNA与氟比洛芬的相互作用为静态猝灭过程,测得结合常数为5.53×10~5 L·mol~(-1),结合位点数为1.12.     

酪氨酸四肽与ct-DNA的相互作用

采用Fmoc固相合成法合成了酪氨酸四肽(YYYY),经液相色谱-高效液相色谱(RP-HPLC)纯化,并用电喷雾质谱(ESI-MS)表征后,得到纯度大于90%的四肽,利用紫外光谱、圆二色光谱和荧光光谱研究了肽YYYY与ct-DNA的相互作用。结果表明,随着肽浓度的增加,ct-DNA的紫外吸收产生明显的增色效应,荧光猝灭显著,圆二色光谱发生红移。研究推测酪氨酸四肽以沟槽方式与ct-DNA发生相互作用,且酪氨酸四肽与ct-DNA的作用强于酪氨酸。     

二茂钛二甘氨酸盐酸盐与DNA作用机理的研究

二氯二茂钛是一种活性很高的抗肿瘤药物,对它的抗肿瘤机理目前尚无定论．我们用核磁共振方法研究二氯二茂钛与单核苷酸的成键特点时发现[1],二氯二茂钛与核苷酸的成键方式既不同于顺铂,又不同于二氯二茂钼、二氯二茂钒等,表明其抗肿瘤机理可能与顺铂有明显不同．由于二氯二茂钛在水中的溶解度不大,故妨碍了对它与DNA作用机理的进一步研究．最近,二氯二茂钛与甘氨酸形成的配合物──二茂钛二甘氨酸盐酸盐,已被成功地合成出来[2]．由于它极易溶于水,且其酸性配体为氨基酸,因此研究该化合物的抗肿瘤活性及其与DNA的作用特点,对了…     

1,4-二羟基蒽醌及其Y~(3+)配位聚合物与DNA相互作用研究

利用紫外-可见吸收光谱(UV-Vis)、核磁共振(1HNMR)、红外光谱(FTIR)研究了1,4-二羟基蒽醌(DHA)与Y3+的配位作用,结果表明Y3+与DHA能形成物质的量之比为1:1的一维链状配位聚合物Y-DHA.与DHA相比,Y-DHA在可见光区的吸收大幅增强,同时具有良好的水溶性.紫外-可见吸收光谱、荧光光谱及DNA熔链温度实验研究结果表明,Y-DHA与CTDNA可通过静电作用和沟槽结合的方式结合,而DHA与CTDNA的作用方式主要为沟槽结合.循环伏安法表明,Y-DHA的还原电位(-0.324VvsSCE)要高于DHA的还原电位(-0.387VvsSCE).无氧条件下,Y-DHA光损伤DNA的能力要明显高于DHA.     

光谱和分子模拟法研究乙硫异烟胺与木瓜蛋白酶的分子作用机制

利用荧光光谱、紫外光谱和分子模拟方法研究了乙硫异烟胺(TH1314)与木瓜蛋白酶之间的相互作用, 求得了不同温度下的结合常数K. 研究结果表明, 静态猝灭是导致乙硫异烟胺对木瓜蛋白酶荧光猝灭的主要原因. 通过计算热力学参数, 可知乙硫异烟胺与木瓜蛋白酶相互作用的吉布斯自由能表现为较大的负值, 并结合作用过程的焓变和熵变推断出乙硫异烟胺与木瓜蛋白酶之间的作用力是以疏水和氢键作用为主. 同时, 利用紫外光谱和同步荧光光谱定性讨论了乙硫异烟胺对木瓜蛋白酶构象的影响. 分子模拟研究表明, 乙硫异烟胺与木瓜蛋白酶的相互作用不仅存在疏水作用, 而且有氢键作用, 这与光谱及热力学研究结果是一致的.     

2,9-双甲基苯并噻唑乙烯基邻菲罗琳与DNA 的相互作用及应用研究

设计合成了基于2,9-双苯并噻唑乙烯基取代的邻菲罗琳荧光分子—PMBT。通过吸收光谱、荧光光谱、圆二色光谱探讨了PMBT与不同DNA的相互作用。发现PMBT与DNA存在两种不同的相互作用模式。 由于PMBT分子中带有两个正电荷,当PMBT与DNA的浓度比值较高（大于4）时,PMBT以DNA为模板按一定方向在DNA上聚集;当PMBT与DNA的浓度比小于2时,PMBT通过嵌插或末端堆积的方式分别与单/双链DNA和G-四链体DNA结合。PMBT与DNA结合导致其荧光淬灭,利用该特性将PMBT与DNA结合构建荧光增强型检测平台,可用于DNA酶活性以及DNA降解的动力学研究。     

儿茶酚胺衍生物与DNA之间相互作用的光谱和电化学法研究

用光谱和电化学方法研究了儿茶酚胺衍生物与小牛胸腺DNA之间的作用机制.结果表明,低浓度的多巴酚丁胺和肾上腺素与DNA之间主要为静电作用;而在高浓度时,则主要为插入作用.对于多巴胺,在5.00×10^-5～9.00×10^-4mol/L范围内,它与DNA之间主要为插入作用.同时,采用电化学方法测得多巴胺、肾上腺素和多巴酚丁胺与DNA之间的表观结合常数分别为1.55×10³,9.77×10³和1.74×10⁴L/mol.     

Spectral studies on the interaction of DNA and Ru(bipy)2(dppx)2+.

The interaction of Ru(bipy)2(dppx)2+ (bipy = 2.2'-bipyridine,dppx = 7,8-dimethyldipyrido phenazine) with the calfthymus DNA has been studied with fluorescence and ultraviolet visible absorption spectroscopy. The results of fluorescence quenching and salt effect show that Ru(bipy)2(dppx)2+ intercalate into the double helix of DNA. The ultraviolet visible absorption spectrum of Ru(bipy)2(dppx)2+, calfthymus DNA, and their interaction indicate that Ru(bipy)2(dppx)2+ intercalate into the double helix of DNA via the ligand dppx.     

甲基百里酚蓝-钐(III)配合物与鲱鱼精DNA的相互作用

在pH＝7.25的Tris-HCl缓冲溶液中, 以中性红(NR)作为光谱探针, 采用UV光谱、FS光谱、粘度等方法研究了甲基百里酚蓝(MTB)与稀土金属离子钐[Sm(III)]形成的配合物Sm(III)(MTB)₂与鲱鱼精DNA的作用机制. 确定了Sm(III)(MTB)₂与鲱鱼精DNA之间有嵌插作用方式存在, 说明Sm(III)(MTB)₂金属配合物能使鲱鱼精DNA的功能产生一定影响.     

Investigation of nitroxoline-human serum albumin interactions by spectroscopic methods

Nitroxoline is a wide spectrum antibacterial and is one of the most important urinary antiseptics.The interaction between nitroxoline and human serum albumin(HSA)has been investigated systematically by fluorescence spectroscopy,synchronous fluorescence,three-dimensional fluorescence,CD spectroscopy and UV-Vis absorption spectroscopy.The results indicated that the quenching of HSA by nitroxoline was static.The corresponding thermodynamic parameters △H,△S and △G calculated according to van’t Hoff equation revealed that the intermolecular forces acting between nitroxoline and HSA were mainly hydrogen bonding and van der Waals forces.The conformational changes in the interaction were studied by synchronous fluorescence,CD spectroscopy and three-dimensional fluorescence spectra which showed changes in the microenvironment and conformation of HSA.     

Determination of nucleic acids using calcein-neodymium complex as a fluorescence probe.

A novel fluorometric method has been developed for rapid determination of DNA and RNA with calcein-neodymium complex as a fluorescence probe. The method is based on the fluorescence enhancement of calcein-Nd(III) complex in the presence of DNA or RNA, with maximum excitation and emission wavelength at 489 nm and 514 nm, respectively. Under optimal conditions, the calibration graphs are linear over the range 0.5 - 3.0 microg/ml for both DNA and yeast RNA, 0.4 - 2.0 microg/ml for fish sperm DNA (FS DNA) and 0 - 3.0 microg/ml for calf thymus DNA (CT DNA). The corresponding detection limits are 15.1 ng/ml for DNA, 21.2 ng/ml for yeast RNA, 10.5 ng/ml for FS DNA and 8.9 ng/ml for CT DNA. The interaction mechanism for the binding of calcein-Nd(III) complex to DNA is also studied. The results of absorption spectra, fluorescence polarization measurements and thermal denaturation experiments, suggested that the interaction between calcein-Nd(III) complex and DNA is an electrostatic interaction.