配体间相互作用研究: 氨基酸与二肽配体形成 质子复合物的稳定性

用pH电位滴定法测定了苯丙氨酰亮氨酸(PL)与甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)、苯丙氨酸(Phe)在离子强度为0.1mol/L(NaNO~3),(25.0±0.1)℃时形成质子复合物的稳定常数,并对苯丙氨酰亮氨酸与六种氨基酸相互作用体系进行了量子化学和分子力学计算。从配体间弱相互作用的观点,讨论了二肽配体对氨基酸分子的识别。结果表明,二肽与氨基酸配体间的结合主要受到配体间静电、氢键作用的控制,同时受到范德华力和键间排斥能等弱相互作用的影响。     

298.15 K甘氨酰二肽在乙酸钠水溶液中的体积性质

测定了298.15 K三种甘氨酰二肽(甘氨酰甘氨酸、甘氨酰-L-缬氨酸和甘氨酰-L-亮氨酸)在0.5, 1.0, 1.5和2.0 mol•kg－1乙酸钠水溶液中的密度, 计算了这些肽在乙酸钠水溶液中的表观摩尔体积, 标准偏摩尔体积, 标准偏摩尔转移体积, 理论水化数和体积相互作用参数. 结果表明: 甘氨酰二肽的标准偏摩尔体积和标准偏摩尔转移体积均随乙酸钠浓度的增加而增大, 溶液中离子与肽带电基团/甘氨酰基团(CH2CONH)之间的相互作用大于离子与肽的非极性基团间的相互作用, 乙酸钠和甘氨酰二肽之间主要是对相互作用. 利用共球交盖模型对所研究的肽与乙酸钠之间的体积相互作用进行了解释. 利用氨基酸的标准偏摩尔体积值, 对二肽的标准偏摩尔体积进行了估算, 发现计算值与实验值一致.     

配位化合物中配体分子间的弱相互作用

配合物分子内和分了间的弱相互作用是从配位化学到超分子化学的桥梁，本文混配配合物中的配体间相互作用与其稳定性的关系入手，讨论了配合物中可能存在的各类非共价作用情况及其影响因素，关重讨论了配合物分子间的弱相互和与超分子化学的关系。     

高效液相色谱手性固定相的研究V——二肽叔丁酰胺型手性固定相拆分α-氨基酸、二茂铁基氨基酸及二肽衍生物对映异构体

本文应用高效液相色谱(L,L)-二肽叔丁酰胺型键合硅胶手性固定相拆分N-乙酰基-α-氨基酸甲酯、N-乙酰基-β-二茂铁基丙氨酸乙酯及N-叔丁氧羰基亮氨酰亮氨酸甲酯等对映异构体、结果表明:部分固定相对氨基酸衍生物对映异构体有拆分效果;大部分固定相对二茂铁基丙氨酸衍生物对映异构体有较好拆分效果;所有固定相对由(D,D)-及(L,L)-亮氨酰亮氨酸衍生物构成的外消旋体均有良好的拆分效果,分离系数最高达1.79。本文对部分化合物对映异构体的拆分机制进行了初步探讨。     

对氯化三甲铵基苯甲氧酰氯的合成及其用作水溶性氨基保护基团

由对二甲胺基苯甲醛(1)合成了对氯化三甲铵基苯甲氧酰氯(5a),并从而制备了苯胺,对溴苯胺、对乙酰胺基苯胺、甘氨酸、甘氨酸甲酯、甘氨酸乙酯、甘氨酸苯甲酯和L-亮氨酸甲酯的酰胺衍生物。考察了这个保护基的氢解特性。使用这个保护基在含水介质中合成了甘氨酰甘氨酸和甘氨酰-L-亮氨酸两个二肽。     

5-氟尿嘧啶短肽的合成及其抗肿瘤活性研究

5-氟尿嘧啶乙酸对-硝基苯酯和5-氟尿嘧啶丙酸对-硝基苯酯分别与三种二肽反应,制备了五个5-氟尿嘧啶二肽(4 a-e)。以5-氟尿嘧啶的氨基酸对-硝基苯酯(2 a-c)分别和三种二肽反应,制得四个5-氟尿嘧啶三肽(5 a-d)。产物经元素分析、NMR、IR和UV鉴定。初步动物试验表明:5-氟尿嘧啶丙酰甘-苯丙二肽,5-氟尿嘧啶乙酰甘-甘-苯丙三肽和5-氟尿嘧啶乙酰缬-亮-甘三肽对小白鼠移植性艾氏腹水癌有一定的抑制作用。     

高效液相色谱手性固定相的研究Ⅴ——二肽叔丁酰胺型手性固定相拆分α-氨基酸、二茂铁基氨基酸及二肽衍生物对映异构体

 ]本文应用高效液相色谱(L，L)-二肽叔丁酰胺型键合硅胶手性固定相拆分N-乙酰基--氨基酸甲酰、N-乙酰基--二茂铁基丙氨酸乙酯及N-叔丁氧羰驶基亮氨酰亮氨酸甲酯等对映异构体、结果表明：部分固定相对氨基酸衍生物对映异构体有拆分效果；大部分固定相对二茂铁基丙氨酸衍生物对映异构体有较好拆分效果；所有固定相对由（D，D）-及（L，L）-亮氨酰亮氨酸衍生物构成的外消旋体均有良好的拆分效果，分离系数最高达1.79。本文对部分化合物对映异构体的拆分机制进行了初步探讨。     

锌(Ⅱ)-芳香氮碱-氨基酸三元配合物中的配体间疏水缔合作用

用pH-电势法研究了锌(Ⅱ)-芳香氮碱(Ar)-氨基酸(Aa) 三元配合物在溶液中的稳定性,其中Ar为2,2'-联吡啶或1,10-邻菲咯啉,Aa为甘氨酸,丙氨酸,缬氨酸, 亮氨酸,苯丙氨酸和色氨酸,以稳定性数据为探针,结合^1H NMR谱的研究, 讨论了在上述某些三元配合物中可能发生的分子内配体间疏水缔合作用. 计算了这些配合物分子的异构化平衡常数及平衡时闭式分子的百分率.结果表明,在含有芳香侧基的氨基酸配体的三元配合物溶液中,闭式异构体已成为配合物的主要存在形式,初步研究了溶剂对配体间疏水缔合作用的影响     

高效液相色谱手性固定相的研究Ⅴ——二肽叔丁酰胺型手性固定相拆分α-氨基酸、二茂铁基氨基酸及二肽衍生物对映异构体

]本文应用高效液相色谱(L，L)-二肽叔丁酰胺型键合硅胶手性固定相拆分N-乙酰基--氨基酸甲酰、N-乙酰基--二茂铁基丙氨酸乙酯及N-叔丁氧羰驶基亮氨酰亮氨酸甲酯等对映异构体、结果表明：部分固定相对氨基酸衍生物对映异构体有拆分效果；大部分固定相对二茂铁基丙氨酸衍生物对映异构体有较好拆分效果；所有固定相对由（D，D）-及（L，L）-亮氨酰亮氨酸衍生物构成的外消旋体均有良好的拆分效果，分离系数最高达1.79。本文对部分化合物对映异构体的拆分机制进行了初步探讨。     

配位化合物分子内配体间的疏水缔合作用——Ⅲ.镉(Ⅱ)/ATP/氨基酸体系

应用 pH-电位滴定法测定了水溶液中 Cd(ATP)(Aa)^3-(ATP^4-为腺苷三磷酸根,Aa^-分别为丙氨酸 ala^-、蛋氮酸 met^-、苯丙氨酸 phe^-和色氨酸 trp^-)型混合配体配合物及相应的单配体配合物在离子强度为 KNO₃0.10 mol/L,温度为37℃时的稳定常数.混配配合物的稳定性与氨基酸配体的关系为 trp^->met^->phe^->ala^-.从分子内配体间的弱相互作用角度对促成上述序列规律进行了讨论.     

氨基酸和肽从水到多羟基化合物溶液的迁移焓研究

采用RD-496Ⅱ型精密微量热量计分别测定了甘氨酸、L-丙氨酸、L-丝氨酸、L-苏氨酸、甘氨酰甘氨酸和甘氨酰甘氨酰甘氨酸在纯水以及不同浓度甘露醇、山梨醇和肌醇水溶液中的溶解焓, 计算了这些氨基酸和肽从水到3种多元醇溶液中的迁移焓. 实验发现, 氨基酸和肽从水到多元醇溶液中的迁移焓均为负值, 且随多元醇浓度的增加而减小. 根据共球交盖模型分析了水溶液中氨基酸和肽分子与多元醇分子间的相互作用.     

配体活性构象搜寻方法及其应用研究——Ⅰ.搜寻方法及凝血酶抑制剂活性构象的搜寻

在综合系统构象搜寻和配体-生物大分子对接(Dock)方法的基础上,发展了根据受体活性部位三维结构搜寻配体活性构象的搜寻方法BCSPL.用此方法搜寻了凝血酶抑制剂PPACK的活性构象,结果与晶体结构非常吻合,又用此方法搜寻了膦酰肽类和二肽、三肽类凝血酶抑制剂与人体α凝血酶结合时的活性构象,并在此基础上用分子力学计算了抑制剂与凝血酶的结合能,结果表明结合能与活性有很好的相关性,计算结果能合理地解释抑制剂与凝血酶的相互作用方式及结构与活性的关系.     

ATP与氨基酸弱相互作用的质谱与理论计算研究

利用电喷雾质谱、荧光、核磁和理论计算研究了ATP与19种氨基酸的弱相互作用.在质谱中发现除甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)外,其它氨基酸均可观测到与ATP因弱相互作用形成的复合物离子.利用不同质谱锥孔电压下复合物稳定性的不同,分析了侧链基团对ATP与19种氨基酸弱相互作用的影响.并利用荧光光谱和核磁共振波谱法研究了芳香性氨基酸与ATP的弱相互作用.结果表明,氨基酸与ATP的弱相互作用强弱顺序为:色氨酸(Trp)＞苯丙氨酸(Phe)＞具有R‖C-NH2的氨基酸＞具有-RCOOH、-R-NH2的氨基酸＞具有-RSH、-ROH的氨基酸＞R为长链的氨基酸＞R为短链的氨基酸.不同官能团的氨基酸与ATP的弱相互作用的模拟计算也证实了此结论,并发现氨基酸的主侧链基团与ATP分子基团间的多个分子间因氢键作用使复合物能稳定存在.这一结果将为预测蛋白与ATP结合位点及研究ATP的识别机理提供依据.     

3,5-二甲基-DL-酪氨酸与铜(Ⅱ)和具极性侧基氨基酸配体配合物稳定性的研究

采用pH电位滴定法,研究了合成配体3,5-二甲基-DL-酪氨酸(DL-Dmtyr)与铜(Ⅱ)的二元配合物,及进一步与带正电荷或极性侧基的氨基酸配体形成三元混配配合物的稳定常数,考察了甲基对稳定性的贡献;用核磁共振研究了DL-Dmtyr与铜(Ⅱ)和L-Arg混配配合物中的配体间静电氢键作用.研究结果表明,甲基取代碘基后,混配配合物分子内的配体相互作用明显增强.     

5-氟尿嘧啶短钛的合成及其抗肿瘤活性研究

5-氟尿嘧啶乙酸对-硝基苯酯和5-氟尿嘧啶丙酸对-硝基苯酯分别与三种二肽反应,制备了五个5-氟尿嘧啶二肽(4aα-e).以5-氟尿嘧啶的氨基酸对-硝基苯酯(2a-c)分别和三种二肽反应,制得四个5-氟尿嘧啶三肽(5A-d).产物经元素分析,NMR,IR和UV鉴定.初步动物试验表明:5-氟尿嘧啶丙酰甘-苯丙二肽,5-氟尿嘧啶乙酰甘-甘-苯丙三肽和5-氟尿嘧啶乙酰缬-亮-甘三肽对小白鼠移植性艾氏腹水癌有一定的抑制作用.     

游离和膜固定化脂肪酶在双液相介质中催化二肽合成的研究

以N－乙酰－L－苯丙氨酸乙酯和L－亮氨酰胺、L－丙氨酰胺、L－苯丙氨酰胺 、L－缬氨酰胺等L－氨基酰胺为底物，以游离或膜固定化脂肪酶为催化剂，在水、 有机溶剂单相和水－有机相双相体系反应介质中，合成了N－乙酰－L－苯丙氨酰基 －L－亮氨酰胺、N－乙酰－L－苯丙氨酰基－L－丙氨酰胺、N－乙酰－L－苯丙氨酰 基－L－苯丙氨酰胺、N－乙酰－L－苯丙氨酰基－L－缬氨酰胺等二肽。研究证明， 由于反应和纯化的同步进行，二肽可以在双液相酶膜反应器中达到高纯度和高收率 合成。     

不对称卟啉化合物的合成及其与氨基酸甲酯的作用

本文合成了含有单取代酰胺基的不对称卟啉及其锌(Ⅱ)络合物Zn(m,2-CNTPP)及Zn(m,3-CNTPP).对三氯甲烷溶液中它们与谷氨酸二甲酯、亮氨酸甲酯以及苯丙氨酸甲酯的作用进行了系统的研究,讨论了卟啉化合物对氨基酸甲酯分子的结合能力、结合方式,以及二者之间的多种存在形式。结果表明,锌卟啉与氨基酸甲酯以1:1的化学计量结合,中心金属锌(Ⅱ)离子和氨基酸甲酯中的氨基配位,卟啉环上的取代基与氨基酸甲酯中的残基可形成氢键、范德华力等弱相互作用。在卟啉和氨基酸甲酯的作用中,氨基与金属离子直接配位,α-碳上的质子靠近卟啉环平面,而酯基中的甲氧基处于远离卟啉环平面的位置。     

超分子双膦配体的构筑及应用研究进展

超分子双膦配体是一类新兴起的基于非共价键作用构筑的双膦配体,近年来引起人们的重视.与传统的共价键连接的双膦配体相比,利用非共价相互作用的可逆性和选择性,超分子双膦配体具有合成简便,组合灵活,易于合成超分子配体库,并利用组合化学的方法对催化体系进行优化和筛选等优点.详细综述了近几年发展的基于氢键、配位键、主客体作用和静电作用等弱相互作用的超分子双膦配体,重点讨论了它们的构建方法以及在不对称催化反应中的应用,并对其发展前景进行了展望.     

半冠醚配体在Au(111)电极表面上的有序阵列的原位STM研究

利用电化学扫描隧道显微术(ECSTM)和循环伏安法, 研究了三个半冠醚配体在Au(111)表面上的吸附结构. 虽然配体分子的几何结构复杂、对称性较差, 但在Au(111)电极表面, 均形成了有序的阵列, 这是分子-分子间相互作用与分子-基底间相互作用平衡的结果. 高分辨率STM图像揭示了有序阵列中分子的内部结构、取向、排列方式等. 该研究为通过过渡金属调控的纳米结构制备提供了实验依据.     

胶束溶液中某些氨基酸和二肽的解离常数

用pH电位法测定了在SDS(十二烷基磺酸钠)胶束溶液中甘氨酰丙氨酸和六种氨基酸(甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸)的两级酸解离常数 pKa1 和 pKa2,发现与水溶液相比 ,pKa 值均显著增加 ,即SDS胶束形成强烈抑制质子解离.结合1HNMR测定结果 ,讨论了pKa1和 pKa2 随SDS浓度的变化规律以及与各配体自身结构的关系