大叶香茶菜庚素的晶体结构和分子结构研究

大叶庚(Rabdophyllin G)是从中草药中提取得到的抗癌有效药物.其晶体属正交晶系,空间群为P2_12_12_1;晶胞参数为:α=6.820(5),b=9.076(1),c=33.525(7)A;Z=4.用X射线衍射法测定该化合物的晶体结构和分子结构.R因子最终修正到0.0584.不久前借其他实验手段得出的分子结构式,本文对它作出一些订正.文中还讨论了分子中的某些结构和化学活性问题.     

豆荚内酯A的晶体结构和分子结构

本文报道软珊瑚提取物豆荚内酯 A 的晶体结构和分子结构.分子式为 C_(22)H_(30)O_5,M_r=374.5,晶体属正交晶系,空间群为,P2_12_12_1,a=8.753(2),b=8.887(3),c=54.247(14)(?),V=4220(2)(?)~3,Z=8,D_x=1.17Mg·m~(-3),F(000)=1616e.强度数据用 Cu Kα辐射、四圆衍射仪收集,结构用直接法解出.经最小二乘法修正,其偏离因子 R=0.064.分子骨架由无规则的[-+-+-++++-+--]型十三环二烯和“信封式”γ-内酯环组成,两者以顺式稠合.不对称单位两个分子构型基本相同.晶胞中分子堆积较疏松.     

正交晶系天花粉蛋白2.4分辨率的晶体结构和分子结构

在酸性条件下(pH=5.4)培养出正交晶系天花粉蛋白晶体。用面探测器收集了X射线衍射强度数据。以C2空间群天花粉蛋白2.6分辨率的晶体结构中的分子模型作为已知结构模型,用分子置换法解出正交晶系P2_12_12_1空间群天花粉蛋白的晶体结构。所得到的初始结构模型先后用模拟退火法和立体化学制约的最小二乘修正技术对原子坐标及温度因子进行修正。最后在2.4分辨率范围内模型的β因子为0.197,键长的均方根误差为0.021,键角距离的均方根误差为0.081。分子结构模型与(2Fo—Fc)为系数的电子云密度图吻合得很好。键长键角合理。结构测定结果表明,P2_12_12_1;空间群天花粉蛋白的分子的空间结构与单斜晶系C2空间群中的分子结构甚为相似。     

含有双齿配体二苯基膦基吡啶(Ph_2PPy)的羰基镍配合物——(Ph_2PPy)_2Ni(CO)_2的合成和分子结构

应用一个简单新方法,在锌粉存在和常温常压下,(Ph_2PPy)_2NiCl_2与CO作用得到新配合物(Ph_2PPy)_2Ni(CO)_2。对后者经X衍射测定了晶体及分子结构,该晶体属正交晶系P_(cab.)晶胞参数为:a=12。044(3),b=21。322(5),c=24.925(5),Z=8.R=0.051和R_w=0.055,该分子中的镍原子配位为四面体构型。     

鬼灯擎素的结构分析

本文报道了从鬼灯擎(Rodgersid aesculifolia Batal)中提取的鬼灯擎素(Bergenin)晶体的结构研究。鬼灯擎素晶体为正交晶系,C_(14)H_(18)O_(10),M_r=346.28,其晶胞参数a=7.468(9),b=13.899(4),c=14.228(0)A;空间群为P2_12_12_1;晶胞内分子数Z=4,D_c=1.5560g/cm~3,结构模型由SHELXTL程序解出;经Fourier合成和最小二乘修正,最后的偏离因子R=0.028。此外,利用晶体结构分析所得分子中各原子的坐标,以半经验分子轨道法CNDO/2程序计算了分子总能量、净电荷分布以及Wiberg键级等,并以此讨论了分子的反应活性中心。     

长小月二萜内酯(praelolide)的分子结构及其绝对构型

长小月二萜内酯(praelolide)是一个新化合物,由产自我国广东省湛江市(石匈)洲岛附近海域的长小月柳珊瑚中分离而得,分子式为C_(28)H_(35)O_(12)Cl。本文用X射线衍射法研究了其晶体结构。此化合物的晶体属正交晶系,空间群为P2_12_12,用直接法测定其结构,取2257个独立可观测反射经最小二乘修正后的R=0.055。分子以六元、八元、六元三个环为主体并以椅-椅船-椅式相拼接而成其主要构象,外接一个五元内酯环,一个氯取代原子,四个醋酸基和一个三元环氧环。用统计法(R因子比=1.012)和Bijvoet反射对观测确定了分子的绝对构型;对30个反常散射贡献最大的Bijvoet反射对,关于第一、第二个对映体的R因子分别为R′( )=0.0517,R′(-)=0.005,后者对应于分子的绝对构型。     

三岔共轭体系的结构研究——2-苯甲酰噻吩的晶体结构和构象

用X射线单晶衍射法测定了标题化合物的晶体结构,并用PCILO方法进行了构象分析。C_(11)H_8OS属于正交晶系,空间群P2_12_12_1,a=11.945(4),b=10.236(7),c=7.649(4),Z=4,Dc=1.37g/cm~3。由于分子内存在空间位阻,分子骨架不呈平面状。噻吩环与羰基骨架平面的二面角(θ_1)为21°,苯环与其的二面角(θ_2)为32°。计算得到的最低能量构象与晶态构象一致。文中讨论了分子的形状、空间位阻、基团共轭能力对构象的影响和孤立态分子在整个构象空间的势能变化。     

延胡索乙素的晶体及分子结构

本文报导用直接法测定延胡索乙素游离碱的晶体结构。晶体所属的空间群为P2_12_12_1,每个单胞中含有四个分子,晶胞参数为a=22.296,b=11.795,c=7·452。用块对角矩阵最小二乘方对全部非氢原子坐标及其各向异性温度因子,对氢原子坐标及其各向同性温度因子进行修正,最后R因子为0.045。本文对于分子的某些结构特征作了讨论。     

杂芳核对(N-N-二烃基胺基)二氯硼烷的三烃基化反应, 二乙胺合三(2-苯并噻唑基)硼烷的合成及其晶体结构

本文报道(N,N-二烃基胺基)二氯硼烷的反常三烃化反应。2-苯并噻唑基Grignard剂与(N,N-二乙胺基)二氯硼烷反应,得到二乙胺合三(2-苯并嚷唑基)硼烷,并讨论了反应机理。分子结构经X单晶结构分析确证。晶体结构属正交晶系,空间群为P2_12_12_1,晶胞参数a=11.570(3),b=12.496(4),c=16.577(4)nm;Z=4,V=2397.3nm~3,D_0=1.348g/cm~3,μ(MoK_a)=3.167cm~(-1)。     

cis-双(氯乙酸)-2,3-二甲基-2,3-丁二胺合铂配合物的晶体结构和电子结构

测定了 cis-双(氯乙酸)-2,3-二甲基-2,3-丁二胺合铂,cis-[Pt DMBA(ClCH_2CO_2)_2]配合物的晶体和分子结构.晶体的空间群为 P2_12_12_1.晶胞参数 a=9.866(4)(?),b=16.356(2)(?),c=19.501(4)(?);Z=8.由 Patterson 函数导出 Pt 原子坐标参数,Fourier 和差值 Fourier 电子密度函数法得到全部非氢原子坐标参数,用块矩阵最小二乘法精修所有的结构参数,最终一致性因子 R值为0.061.每个分子中,Pt(Ⅱ)取四配位平面四边形构型.DMBA 以双齿与 Pt(Ⅱ)螯合成五元环.分子中 N—Pt—N 和 O—Pt—O 的平均键角分别为 80.3°和80.8°.由于 DMBA 螯合配位,使平面正方形畸变,与 Pt 配位的两个氯乙酸根的键合原子间距离为2.6(?).用 CNDO/2方法研究了配合物电子结构,解释了配合物具有较特殊的 O—Pt—O,N—Pt—O 键角的原因.并讨论了配合物的结构与抗癌活性间的关系.     

白鲢鱼胰岛素的晶体学研究

本实验获得了白鲢鱼胰岛素的单晶体并收集了2.8A分辨率的强度数据.确定晶体所属空间群为 P2_12_12_1,晶胞参数是a=96.73(8)A,b=57.74(7)A,c=53.88(9)A.每个不对称单位含有6个胰岛素分子.用旋转函数法揭示出非晶体学三重轴和二重轴的取向,并说明了白鲢鱼胰岛素具有与三方二锌猪胰岛素相似的空间结构和聚合状态.本文讨论了一级结构的变化对胰岛素的结晶行为和堆积方式的影响。     

中药白头翁配基G(C_(30)H_(48)O_4)的晶体和分子结构

白头翁配基G(C_(30)H_(48)O_4)晶体的空间群是P2_12_12_1,晶胞参数为:a=12.5925(2),b=13.245(2),c=15.923(2);Z=4(Dobs=1.12,Dcalc=1.182g·cm~(-3))。晶体结构用直接法和电子密度函数解出。在这个不对称分子中,四个六元环构型均属椅式,并且彼此间通过ee键稠合。晶体中存在三种O-H…O分子间氢键。     

单羟基桥连的双铜(Ⅱ)大环穴醚配合物[Cu_2(OH)(ClO_4)(C_(16)H_(38)N_6)](ClO_4)_2·CHCl_3的合成和结构

本文合成了单羟基桥连的双铜(Ⅱ)大环穴醚配合物[Cu_2(OH)(ClO_4)(C_(16)H_(38)N_6)](ClO_4)_2 ·CHCl_3,并测定与讨论了它的晶体结构.晶体属于正交晶系,空间群为D_2~4 -P2_12_12_1,晶胞参数:a=12.749(4)(?),b=14.361(3)(?),c=18.064(3)(?),V=3307.3(13)(?)~3,Z=4。分子结构中单羟基桥连两个二价铜离子,Cu-O平均键长为1.935(6)(?),Cu-OH-Cu键角为135.2(2)°;铜原子的几何构型为畸变四方锥,配体的底面为穴醚的二乙三胺亚基的三个氮原子和一个羟基桥氧原子;顶点位置为高氯酸根的氧原子,因为该原子同时配位于另一个铜原子,所以分子的双铜中心存在第二个氧桥,即较弱的高氯酸根桥;Cu-O(ClO_3)距离分别为3.005(9)(?)和2.806(8)(?).     

新型混合价态双核钴化合物Co(Ⅰ)Co(Ⅱ)(μ-Ph_2Ppy)_2(μ-CO)_2Cl_3的合成和分子结构

本文合成了新型混合价态双核钴化合物Co(Ⅰ)Co(Ⅱ)(μ-Ph_2Ppy)_2(μ-CO)_2Cl_3[Ph_2Ppy为2-(二苯基膦基)吡啶],并对其分子结构进行了测定,收集到了三维独立的衍射点3569个,晶体空间群为P2_1nb。晶胞参数a=13.32(1),b=14.31(1),c=18.94(2),Z=4。用直接法解出结构,用全矩阵最小二乘法进行结构精修,最终的R值为0.072。结构特征是:不考虑Co—Co键的情况下,一个钻原子是五配位变形三角双锥构型,形式氧化态为+1。另一个钻原子是六配位变形八面体构型,形式氧化态为+2。Co—Co键距为2.685(1)。该分子属C-(2v)点群。该分子进一步还原可得到具有w-框架结构的新混合价态化合物Co(0)Co(Ⅰ)(μ-Ph_2Ppy)_2(μ-CO)(CO)Cl。     

R、S-三[N-(邻-氧α-萘亚甲基)-α-苯乙胺]合钴的合成、晶体结构及分子绝对构型

合成了R,S一三[N-(邻-氧α-萘亚甲基)-α-苯乙胺]合钴。x射线单晶衍射衍射测定了晶体结构及分子的绝对构型。晶体属正交晶系,D_2~4-P2_12_12_1空间群,晶胞参数:α=12.587(3),b=14.166(3),c=25.652(14)(?),v=4574.2(?)~3,z=4。用重原子法及差值Fourier合成解出结构,最后的R值为0.074。利用Co~( )对CuKa反常散射测定了分子的绝对构型。Co~( )为六配位,d~2sp~3杂化近正八面体构型。     

正交晶系天花粉蛋白晶体的X射线研究——5(?)分辨率的三维Fourier综合

本文报道正交晶系的天花粉蛋白晶体系生长自酸性溶液(pH～5.4),其空间群是P_(2_12_12_1),a=38.23,b=76.18,c=79.12。每个不对称单位内含一个分子量为26000,由234个氨基酸残基组成的蛋白分子。用浸泡法获得了两个重原子衍生物:K_2PtCl_4和K_2HgI_4。采用多对同晶置换加反常散射的联合概率法求得母体相角,计算了5分辨率的电子密度图。从图上可分辨出每个独立分子的界面。初步结果表明,与生长自碱性溶液(pH～8.6)的单斜晶体中的分子相比,分子在酸性条件下没有发生剧烈的构象变化。     

苯骈-1-氧-2-磷-3-氮杂环己烷衍生物的研究——2,3-二取代苯骈-1-氧-2-硫(氧)化磷-3-氮杂环己-4-(硫)酮晶体结构和分子结构的测定

C_(17)H_(17)N_2O_2Cl_2PS(NP-8)和C_(17)H_(19)N_2O_2PS(NP-10-II)两个晶体结构是用帕特逊法测定的,它们均属单斜晶系,空间群分别为P2_1/a和P2_1/n.单胞中有四个分子.晶胞参数分别为:a=26.622(7)A,b=7.711(2)A,c=9.461(3)A,β=94.90°(4);a=18.897(3)A,b=10.199(13)A,c=8.948(3)A,β=94.30°(3).经块对角矩阵最小二乘法修正,对NP-8晶体的全部2971个衍射点,偏离因子R=0.046;对NP-10-II 晶体的 1711(I)>3σ(I)衍射点,偏离因子 R=0.076. 文中根据NP-8和 NP-10-II的分子结构,合理地解释了光谱数据,并对结构特点进行了讨论。     

软珊瑚共附生真菌Aspergillus sp.EGF15-0-3的柳珊瑚酸类代谢产物研究（英文）

首次从软珊瑚共附生曲霉属真菌Aspergillussp.EGF15-0-3中分离得到可逆性胆碱酯酶抑制剂环戊烷倍半萜类化合物柳珊瑚酸(1)及其类似物2-脱氧-2β-羟基柳珊瑚酸(2),并确定其结构.根据单菌株多次级代谢产物(OSMAC)策略和富营养化培养,在23种不同的培养基中首次应用全球天然产物分子网络(GNPS)检测1和2是否存在,并选出1和2的最佳培养基组成.结果表明,除马铃薯葡萄糖肉汤(PDB)培养基外,1还存在其他6种培养基中,2的含量在液体和大米培养基中不同,其中GPY+CaCO_3培养基为1和2的最佳培养基.首次证实软珊瑚共附生曲霉属真菌EGF15-0-3是1和2的可能微生物来源,同时也验证了海洋无脊椎动物产生新颖的具有生物活性的次级代谢产物通常来自内生、附生、共生或环境微生物的假说.     

基于[1,2,4]-三唑衍生物的两个镉(Ⅱ)配合物的结构与光谱学表征

合成了2个新的镉髤配合物{[Cd(Htta)_2(H_2O)_2]·2H_2O}n(1)和[Cd(tba)_2(H_2O)_4](2)(H_2tta=2-[1,2,4]-三唑对苯二甲酸,Htba=3-[1,2,4]-三唑苯甲酸),配合物分子结构经X射线单晶衍射分析确认。对配合物1和2进行了X射线粉末衍射、红外光谱、紫外光谱和固体荧光光谱表征。X射线单晶衍射测试表明,配合物1为一维双链高分子聚合物,2为单核零维配合物,中心镉髤离子均采取六配位八面体配位构型。配合物1通过分子间丰富的氢键作用进一步组装成三维超分子结构,配合物2则通过分子间氢键和π-π堆积作用组装成三维超分子结构。固体荧光光谱显示,配合物1和2分别在437和357 nm处有强的荧光发射峰。     

三苯基锡硫代苯甲酸酯的合成、性质和晶体结构

用三苯基氯化锡与硫代苯甲酸在三乙胺存在下反应，合成了三苯基锡硫代苯甲 酸酯，并进行了红外光谱及核磁共振氢谱表征。X射线单晶衍射表明，化合物属正 交晶系，空间群P2_12_12_1，晶胞参数：a = 0.8306(3) nm, b = 1.6906(5) nm, c = 3.1459(10)) nm, V = 4.417(2) nm~3, Z = 8, D_c = 1.465 g/cm~3, R_1 = 0.0472, wR_2 = 0.1012。该化合物的晶体是由孤立的分子所组成，四配位的锡 原子呈畸变的四面体构型，配体羧基上的氧原子和锡原子之间存在弱的配位作用。