3A分辨率绿豆胰蛋白酶抑制剂Lys活力碎片—牛胰蛋白酶(MBILF-BTRY)复合物的晶体结构分析和分子模型

用分子置换法成功地解得了MBILF-BTRY的晶体结构,并得到了它的立体结构模型。绿豆胰蛋白酶抑制剂属于絲氨酸蛋白酶抑制剂中结构最复杂的Bowman-Birk型抑制剂。这一类型抑制剂的立体结构以前尚未见报道。MBILF-BTRY复合物晶体的晶胞参数为a=62.99,b=63.54,c=69.70,α=β=γ=90°,空间群为P2_12_12_1,复合物分子量约为27500daltons。用理学电机的Ru-300型转靶X光机及AFC-5型四园衍射仪收集了分辨率为3范围内的独立衍射点5142个。以蛋白质数据库所取得的牛胰蛋白酶分子的座标为     

芳基汞化合物的性质研究——Ⅹ.氯化邻乙氧羰基苯汞的晶体结构

用Syntex P3四圆衍射仪收集氯化邻乙氧羰基苯汞晶体的三维衍射数据。晶体属单斜晶系;空间群为(C_(2h)~5-P2_1/c;a=10.611(2)■,b=4.987(1)■,c=19.416(5)■,β=95.74(2)°;z=4。利用Patterson法和直接法测定了晶体结构。用块矩阵最小二乘法修正后,最终R值为0.044。晶体结构分析表明,在氯化邻乙氧羰基苯汞分子中存在有分子内配位,Hg…O(1)的间距为2.734■。     

草药牛筋果化学成分的研究IV牛晶V的分子晶体结构

用SYNTEX R_3型四圆衍射仪收集了牛晶V的三维衍射数据,晶体空间群为P2_1/c;a=9.620(6),b=14.660(8),c=10.709(6),β=101.12°;Z=4。分子式为C_(16)H_(14)O_6·H_2O。利用直接法和差值Fourier法解出了晶体结构。经位置坐标参教,各向异性温度因子和比例因子,块矩阵最小二乘修正,R值为0.0522。 结构分析表明,苯环处在分子的中心位置,苯环两侧是两个六员杂环。除个别原子外,大部分非氢原子都处在同一个平面上。分子内存在着一个较大的共轭体系。所有的极性基团都分布在分子的外侧,这种结构可能与抗癌机理有密切的关系。     

银袋内酯乙的乙酰化物的晶体结构和分子结构

本文报道从变色马兜铃(Aristolochia versicolar)的块根中提取的一种新倍半萜内酯-银袋内酯乙的乙酰化物的晶体结构和分子结构.分子式为C~17H~22O~4,分子量290.4,晶体属单斜晶系,空间群为P2~1,a=0.9594(5),b=0.6626(6),c=1.2924(12)um,β=94.48(6)`,V=0.819(1)nm^3,Z=2,Dx=1,18g.cm^-^3,F(000)=266e,μ=0.77cm^-^1(MoKa).结构用直接法解出,经最小二乘法修正后1280个衍射点偏离因子为R=5.5%,Rw=5.2%.分子由椅型.椅型的1,5二烯十员环([2323]矩形)和共用两个相邻DunitzIII型碳C(4),C(5),一个Dunitz II型碳C(6)的五员内酯环组成.十员环与五员内酯环之间夹角为99.该分子骨架拓扑在迄今已知的倍半萜内酯中只与银袋内酯丙相似.所有非氢原子的键长和键角均在实验误差范围内接近理论值。     

0.3 nm分辨率绿豆胰蛋白酶抑制剂Lys活力碎片—牛胰蛋白酶(MBILF-BTRY)复合物的晶体结构分析和分子模型

Crystal structure of MBILF-BTRY complex was successfully solved by molecular replacement method and its 3-dimensional molecular model was thereby derived. Mung bean trypsin inhibitor belongs to Bowman-Birk inhibitor group, which is by far the most complicated among the ten fundamental groups of serine protease inhibitor. Neither the 3-dimensional structure of Bowman-Birk inhibitor group nor the stereoscopic conformation of its complex with protease has ever been reported. The crystallographic data of MBILF-BTRY complex are found to be a=....     

悬滴式蒸气扩散法及晶体重复接种技术培养蛋白质大单晶

X-射线单晶结构分析法是迄今为止测定蛋白质构象的最精确的分析手段,而培养出分辨率高的蛋白质大单晶则是进行结构分析的前提。早期,生物化学家将蛋白质结晶作为鉴定和纯化蛋白质的一种手段,所用的结晶方法主要是整批结晶     

绿豆胰蛋白酶抑制剂Lys活力片段-牛胰蛋白酶复合物的晶体结构测定——分子置换法及3分辨率电子云密度图

本文以修正过的牛胰蛋白酶分子的坐标为模型,应用旋转函数法和平移函数法成功地求得了牛胰蛋白酶分子在绿豆胰蛋白酶抑制剂Lys活力片段(以下简称MBILF)-牛胰蛋白酶(以下简称BTRY)复合物晶体晶胞中的取向和位置。从正确放置于MBILF-BTRY复合物晶胞中的BTRY分子的坐标出发,用Sim权重方法算得的一套相角作为MBILF-BTRY复合物的相角,以2丨F_0|—丨F_(?)丨为系数所得到的3分辨率的电子密度图中,除了投入计算的BTRY分子本身的电子密度外,在BTRY的活性部位附近可以清晰地看到MBILF分子所对应的电子密度及其边界,抑制剂片段的线度约为15×15×25。     

CRYSTAL STRUCTURE DETERMINATION OF MUNG BEAN TRYPSIN INHIBITOR Lys FRAGMENT-BOVINE TRYPSIN COMPLEX——MOLECULAR REPLACEMENT,ELECTRON DENSITY MAP AT 3.0 ■ RESOLUTION

The orientation and position of the trypsin molecule in the complex crystal cell mung bean trypsin inhibitor Lys fragment (MBILF)-bovine trypsin (BTRY) have been successfully determined by molecular replacement method with the model of the refined bovine trypsin molecule.Starting from the BTRY coordinates which were oriented and located in the correct azimuth and position in the complex cell according to the result from rotation function and translation function, sim-weighted Fourier map with coefficients 2|F_o|-|F_c| at 3.0 resolution was calculated.Besides the electron density which is obviously attributed to itself, in the vicinity of the active site of BTRY the dense contour levels corresponding to the MBILF and its boundary could be clearly seen in this map. The size of MBILF was approximately estimated at 15×15×25.     

芳基汞化合物的性质研究;X.氯化邻乙氧羰基苯汞的晶体结构

用Syntex P3四圆衍射仪收集氯化邻乙氧羰基苯汞晶体的三维衍射数据,晶体属单斜晶系;空间群为C2h[5]-P21/c;a=10.611(2)A,b=4.987(1)A,c=19.416(5)A,β=95.74(2);z=4,利用Patterson法和直接法测定了晶体结构,用块矩阵最小二乘法修正后,最终R值为0.044.晶体结构分析表明,在氯化邻乙氧羰基苯汞分子中存在有分子内配位,Hg...O(1)的间距为2.734A。