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基于拓扑方法计算了16种嘧啶吗啉苯甲酰胺衍生物的电性距离矢量(Mt)。通过最佳变量子集回归建立其对Hedgehog信号通路抑制活性(IC50)与Mt的最佳三元数学模型(QSAR),其判定系数(R2)及逐一剔除法的交叉验证相关系数(Rcv2)分别为0.832、0.600。经Rcv2、VIF、FIT、AIC等检验,该模型具有良好的稳健性及预测能力。根据进入此模型的M66,M18,M2可知,影响嘧啶吗啉苯甲酰胺衍生物对Hedgehog信号通路抑制活性的主要因素是分子的二维结构特征CH3-、-CHf-、-NHg-、N-和HO-等结构碎片。 相似文献
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一种新型手性分子电性矩边矢量(Vmedc)的设计及其应用 总被引:1,自引:0,他引:1
根据分子中不同类型原子间电相互作用的不同, 文中提出了一种手性分子电矩边矢量(Vmedc), 进一步拓展分子电矩边性矢量(Vmed)使用范围. 为检测该手性描述矢量的结构表达特性和模型预测能力, 分别对32个培哚普利拉类血管紧张素转化酶(ACE)抑制剂的对映结构体和7对苯基哌啶类σ-受体抑制剂进行考察. 32个ACE抑制剂多元逐步回归系数R=0.913 (R2=0.834, SD=0.768, F=33.875), 留一法交互检验为Rcv=0.877 (Rcv2=0.769, SDcv=0.906, Fcv=22.473), 具有较强预测能力; 继而用BP神经网络, 对60组随机样本(23∶9)进行留分法分析取得较好结果, 训练集平均为: RTraining=0.931 (RTraining2=0.967), 预测集为: Rcv=0.918 (Rcv2=0.842); 而对14个σ-受体抑制剂多元回归(R=0.955, Rcv2=0.849)获得与文献一致结果. 再用Fisher线性判别方法和BP神经网络对ACE抑制剂进行判别分析, 其活性分类88.89%正确(仅9号错误), 非活性分类100.0%正确, 总分类正确率为96.87%. 两个数据集测试证明该方法与其它文献方法相当, 这为定量构效关系(QSAR)研究提供一种新选择, 扩充了Vmed描述矢量应用范围. 相似文献
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应用密度泛函理论方法,在B3LYP/6-311G**水平上对25种取代苯酚进行全优化计算获得优势构象,从获得的分子构象模型中提取了多种量子化学参数,结合文献中取代苯酚诱发浮萍萎黄的活性数据(pC),采用多元线性回归方法成功建立了取代苯酚诱发浮萍萎黄活性的定量预测模型.经逐步回归筛选变量后,所建模型的相关系数R为0.972,去一法交叉验证复相关系数Rcv2为0.932,外部预测集交互检验Qext2为0.931,模型具有较高的拟合精度和较好的预测效果.模型结果表明:最低空轨道能ELUMO及分子体积V对取代苯酚的毒性大小有较大的制约作用;取代苯酚对浮萍所表现出来的毒性随着ELUMO的降低和V的增大而增大;所建两变量模型(1)能较好地预测取代苯酚诱发浮萍萎黄活性. 相似文献
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从20种天然氨基酸的41个randic molecular profiles、44个eigenvalue based indices和47个walk and path counts非零描述符分别进行主成分分析,得出一种新的氨基酸描述符——SVREW.将其应用于血管紧张素转化酶抑制三肽结构表征,应用多元线性回归(MLR)及偏最小二乘(PLS)建立定量构效关系模型,同时采用内部与外部双重验证的方法验证模型的稳定性.所建模型复相关系数(Rcum2)、留一法(LOO)交互校验相关系数(Rcv2)和外部样本校验相关系数(Qext2)分别为MLR(0.994,0.974,0.991),P LS(0.949,0.886,0.898).然后利用此多元线性回归方程设计出一系列血管紧张素转化酶抑制三肽化合物并预测了其活性,并且应用分子对接验证所设计药物的合理性.经研究表明SVREW描述符应用于ACE三肽结构表征所建模型的稳定性与预测能力均较好,有望成为多肽定量构效关系研究中一种有效的结构表征方法,并对新药物的发现和研究提供指导. 相似文献
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基于定量结构-性质关系方法预测氨基酸的比旋光度 总被引:1,自引:0,他引:1
运用定量结构-性质关系(quantitative structure-property relationsh ip,QSPR)方法对人体必需的氨基酸比旋光度进行了预测,同时运用交互检验(LOO)方法对所建立的模型进行了检验。应用启发式算法对描述符进行筛选并建立线性回归模型,所建立的模型的相关系数(R2)为0.918,但分别用 1、-1代表左旋和右旋的分子手性后,重新建立多元线性回归模型,其相关系数(R2)变为0.970。本研究所建立的QSPR模型为预测手性化合物比旋光度提供了一种有效的新方法。 相似文献
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检验点激酶1(Chk1)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,可使受损癌细胞发生细胞周期阻滞并促进DNA损伤修复,降低放疗对肿瘤细胞的杀伤作用。抑制Chk1活性可消除细胞周期阻滞,阻碍肿瘤细胞的自我修复,导致其有丝分裂紊乱最终凋亡。本文采用多元线性回归(MLR)和主成分回归分析(PCA)方法,对164个噻吩和三唑酮类Chk1抑制剂分子的698个参数进行回归分析,分别建立定量构效关系预测模型。结果表明,多元线性回归中的逐步回归(stepwise)是最佳建模方法,所建模型的预测能力较强(训练集R=0.85,检验集R=0.88),运用拓扑电荷指数、原子核片段等20个参数直观反映了影响活性的主要因素。此模型的确立对设计和开发新型高效Chk1抑制剂具有指导意义。 相似文献
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检验点激酶1(Chk1)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,可使受损癌细胞发生细胞周期阻滞并促进DNA损伤修复,降低放射治疗对肿瘤细胞的杀伤作用。抑制Chk1活性可消除细胞周期阻滞,阻碍肿瘤细胞的自我修复,导致其有丝分裂紊乱最终凋亡。本文采用多元线性回归(MLR)和主成分回归分析(PCA)法,对164个噻吩和三唑酮类Chk1抑制剂分子的698个参数进行回归分析,分别建立定量构效关系预测模型。结果表明,多元线性回归中的forward法(向前选择法)是最佳建模方法,所建模型的预测能力较强(训练集R=0.851,检验集 相似文献
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介绍了一种由单片机系统控制的薄层色谱自动点样装置,其中喷嘴和机械部分的制作比较实用。采用本文设计,能制出足以与商品仪器媲美的产品,且成本极低。 相似文献
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一种基于介质上电润湿效应的免疫检测芯片研究 总被引:1,自引:0,他引:1
利用微机械加工技术,在ITO玻璃上设计制作了基于介质上电润湿效应的以离散液滴为对象的免疫检测芯片,对芯片的液滴驱动特性、免疫反应参数进行了测试,并对小鼠IgG和羊抗鼠IgG-HRP进行了初步的免疫测试.研究结果表明,在电压<100 V的时候,接触角测量值基本上和预测曲线吻合,在>100 V的情况下出现了接触角饱和现象,在芯片上实现了液滴操纵,120 V时得到最大平均速度为3.75 mm/s;该芯片可以实现免疫反应检测,所需样品体积为0.5 μL,检测时间约为20 min,对于羊抗鼠IgG-HRP实验系统的检测范围为0.1~20 mg/L. 相似文献
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将制备好的氧化铝纳米通道经与3-氨丙基三乙氧基硅烷反应使其表面修饰了氨基后,再在含生物素的缓冲溶液(pH 5.5)中反应12h,制成表面固定了生物素的氧化铝纳米通道,通道孔径约50nm。另取PVC管一段,在其顶端用PVC/THF混合液粘附制备好的聚合物膜,再将上述修饰好的氧化铝纳米通道用有机硅橡胶粘在敏感膜的底部,作为工作电极待用。以生物素-亲和素体系为模型,用经修饰的氧化铝纳米通道为识别载体进行电位法检测,实现了亲和素的检测。亲和素的质量浓度在0.10~0.60mg·L-1范围内与相应的电位变化值之间呈线性关系,检出限(3σ)为0.05mg·L-1。试验结果验证了氧化铝纳米通道电位生物传感器测定生物大分子的可行性。 相似文献
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镍激活EB病毒的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
应用间接免疫荧光法和抗补体免疫荧光技术研究,证实在试管内1~40mg/L NiSO4.6H2O(Ni)显著增强携带Epstein-Barr Virus(EBV)基因组的三株类淋巴母细胞株的VCA、MA、EA、EBNA-2抗原表达.此外还发现1~20mg/L Ni能明显促进EBV转化人脐血B淋巴细胞的作用,当多次加Ni时促进效应更强,前者转化促进率为13.31%~46.6 1%,后者达22.70%~57.04%.以上结果表明,Ni具有激活 EBV的作用.EBV与鼻咽癌(NPC) 密切相关,广东 NPC高发区大米和饮水中 Ni的含量偏高,NPC患者血和头发中 Ni 的水平明显高于健康人.研究结果提示,EBV与 Ni相互作用可能是 NPC发生、发展过程中的一个协同因素. 相似文献
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Scanningtunnelingmicroscope(STM)hasrecentlybeenappliedtothestudyoftheadsorptionoforganicandbiologicalmoleculesinvariousenvironments,includingliquidcrystal(LC),onsurface.Inparticular,4_n_alkyl4′cyanobiphenyls(mCB,wheremisthenumberofcarbonsinthealkylgroup)on… 相似文献