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蛋白质与小分子结合的研究中,处理单位点结合模型的经典方法在计算解离平衡常数(Kd,Ki)时有缺点;文中推导的两个公式拟解决这个问题.公式直接使用受体总浓度([R]t)、配体总浓度([L]t)和探针分子总浓度([P]t),其适用性不受受体浓度、受体被探针饱和的程度,以及配体活性高低等因素的影响.基于这两个公式使用非线性拟合方法,可以从结合实验求得探针分子的Kd,从竞争实验求得配体的Ki.以CPA为荧光探针,运用推导的公式,则测定了PPARγ和一些配体结合的Ki,并首次报道了PPARγ-LY171883的Ki. 相似文献
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溶剂效应量子化学研究进展 总被引:9,自引:0,他引:9
本文就近年来溶剂效应的量子化学研究状况了综述。介绍了溶剂效应量子化学计算的两种方法-自洽反应场(SCRF)理论计算法和量子力学、分子力学结合模型(QM-MM模型)计算法以及它们的应用,并提出了溶剂效应理论研究今后可能发展的方向。 相似文献
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喹诺酮类N1位定量构效关系研究 总被引:4,自引:1,他引:4
氟隆诺酮类化合物是抗菌药中的重要一类,由于它的许多突出特点,已引起越来越多的研究者的关注山.这类化合物骨架见图1.我们对该类化合物进行过一些研究[’‘l自发现诺氟沙星*以后,几位取代基在寻找高效、广谱峻诺酮类化合物方面起重要作用,但在发现环丙基(1983年)、特丁基(1989年)以后,一直未发现新的有意义的取代基·在NI位定性与定星构效关系的研究中有二种观点:(1)古贺弘等k’]提出的由立体效应决定的观点;(z)Domagala[71、Chu问等主张的立体与电子效应共同起作用的观点·3D-QSAR研究中的比较分子力场分析(Co… 相似文献
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自Hansch等创立QSAR法以来,药物构效关系的研究已获得较大的进展。本文将模式识别法用于芬太尼衍生物构效关系的研究,将该类药物的分子结构看作与生物活性具有对应关系的表现形式——模式,以药物分子结构中有关取代基的多个量子化学参数为数量化的模式向量成分。将已知生物活性的药物作为模式识别训练点,则所得模式识别分类图反映了该类药物的生物活性与其量子化学结构特征参数间的统计学意义的关系。它既可用来探寻高效药物的结构参数,又能预测新设计药物生物活性的等级或类别。 相似文献
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应用量子化学MNDO程序及分子力学MMP2程序,确定了一些未知磺酰胺类常咯啉的分子力学参数。应用这些参数计算了几个晶体结构已知的磺酰胺类化合物,与真实结构比较,计算结果令人满意。由此说明确定的分子力学参数用于计算磺酰胺类化合物时的正确性和可行性。 相似文献
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合成了石杉碱甲-E2020的拼合物(1),并测定了1和中间产物10和11抑制乙酰胆碱酯酶的生物活性,它们的活性均低于E2020。对E2020和其中活性最高的10的8个异构体分别进行了构象分析及与TcAChE分子对接研究,结果表明,10的各异构体中只有RRZ型与AChE的结合能比E2020高,其它异构体的结合能均远小于E2020,这可能是10的活性比E2020低的原因。对异构体RRZ还进行了与TcAChE作用方式的研究,对接结果和结合能都说明10的RRZ型异构体的活性可能比E2020高。 相似文献
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