支持向量机和线性判别分析用于禽流感病毒编码蛋白识别

以支持向量机(SVM)和线性判别分析(LDA)对200条禽流感病毒、100条B型流感和100条C型流感病毒蛋白共400条为训练集样本,从表征序列的200个整体与局部变量中以逐步(stepwise)方法选取24个变量作为LDA模型的输入建立线性识别模型,病毒蛋白总识别率达99.8%,留一法交互检验总识别率为99.4%.从原始200变量中经主成分分析得16个主成分作为SVM的输入,以径向基核函数(RBF)SVM建立非线性识别模型,病毒蛋白总识别率为99.8%,留一法交互检验总识别率为99.2%.以100条禽流感、50条B型流感和50条C型流感病毒编码蛋白质共200条为测试集样本,得LDA模型,对其总识别正确率为95.4%,SVM模型对其总识别正确率为96.5%.识别结果表明,两个模型都可较好识别禽流感病毒蛋白,并且SVM对禽流感病毒蛋白的识别结果优于LDA.     

一种新的潜在心肌显像剂[99mTc(CO)3(TBI)3]+的制备及其生物分布研究

以[99mTcO4]-为起始物,在0.1MPa下制备了中间体[99mTc(CO)3(H2O)1]+,通过配体交换反应,叔丁基异腈(TBI)配体取代该配合物中的3个水分子,制得一种标记率大于90%的[99mTc(CO)1(TBI)1]+配合物.该配合物在室温下放置6h以上,标记率无明显变化.在正常昆明小鼠体内的生物分布实验结果表明,[99mTc(CO)3(TBI)3]+具有较高的心肌摄取,且滞留也相当好,在静脉注射5min和60min后时的心肌摄取值分别为(19.07±0.81)%(ID/g)和(18.24±2.41)%(ID/g).该配合物的非靶本底摄取较低,注射60min后的心/肝、心/肺和心/血摄取比值分别为1.02,5.83和23.69,有望发展为一种新的心肌显像剂.     

半导体纳米晶体的光致发光特性及在生物材料荧光标记中的应用

介绍了半导体纳米晶体（亦称量子点）的结构特征和光致发光特点，并与有机荧光染料分子的光致发光性质作了对比。结合本实验室所做的工作，对半导体纳米晶体用于生物材料的连接、标记和检测作了综述。     

转移催化(PTC)反应研究III.1-^1^4C,1,1-二溴-2-苯基环丙烷及其取代物的合成

本文报道了^1^4C-溴仿的制备,并在相转移催化条件下由它合成了五个^1^4C-标记偕二溴环丙烷衍生物2a-e.2a-e与非标记产物3a-e的纯度对照,表明均已达到化学纯.     

A novel detection of single-stranded DNA binding protein based on ss-DNA modified chip using surface plasmon resonance microscopy

An ss-DNA gold chip was prepared based on self-assembly of the thiol-derivatized oligonucleotide,and used for thedetermination of single-stranded binding protein(SSB)by surface plasmon resonance microscopy(SPR).The experiment resultsshowed that SSB binds ss-DNA with high specificity,and relative signal of SPR response is proportional to the concentration of SSBin the range of 0.1-100 ng/mL with a detection limit(S/N=3)of 0.07 ng/mL.     

不同衬底上生物膜与Aβ蛋白的相互作用的研究

固体支撑脂质双层膜能很好的模拟生物膜系统,固体衬底的表面结构和性质会影响双层膜的成膜过程、流动性、微区形成以及化学活性,进而影响蛋白的特性。本文,我们在两种衬底云母和二氧化硅表面,构建了包含神经节苷脂GM1的固体支撑脂质双层膜,用拉曼光谱研究了两种衬底表面脂质膜的分子构象。并且,在脂质膜表面加入淀粉样-beta蛋白,分析两种衬底上淀粉样-beta蛋白的构象差异。     

组蛋白H1序列固有无序特性分析

组蛋白H1对于高阶染色质结构的形成和基因表达调控具有重要作用.为了揭示组蛋白H1在染色质结构形成中的生物学机制,本文对组蛋白H1三个结构域C-terminal domain(CTD)、N-terminal domain(NTD)和Globular domain(GD)及各区域连接位点对应序列氨基酸偏好、复杂度等序列特征进行了系统对比研究,并对各区域进行了固有无序蛋白有序区/无序区预测分析.结果表明,组蛋白H1三个结构中,中间的球状结构域(GD)中的氨基酸序列是非常保守的,NTD富含疏水氨基酸,CTD末端富含碱性氨基酸.进一步的研究表明,CTD和NTD两个结构域普遍具有固有无序特性,因此这些区域具有较大的柔性结构,对其在染色质形成中行使的重要生物学功能具有重要意义.     

胃癌组织中B7-H1的表达及临床意义研究

目的检测人体胃癌组织中B7-H1的表达,探讨其与患者临床病理特征的关系及对预后的影响。方法采用免疫组化染色法检测胃癌组织中B7-H1的表达,分析其在胃癌组织中的阳性表达率与患者临床病理特征之间的关系,并绘制患者术后生存曲线,评价B7-H1表达对预后的影响。结果65例胃癌组织中癌细胞的细胞膜、细胞质以及部分肿瘤组织浸润的淋巴管及淋巴细胞中均有检测到B7-H1的阳性表达,阳性率为36.9%。有淋巴结转移或脉管内有癌栓的患者B7-H1阳性率较高（均P＜0.05）。B7-H1阳性表达的胃癌患者术后5年生存率（25.0%）低于阴性表达的患者（56.1%）（P＜0.05）。结论B7-H1阳性表达的胃癌患者易发生淋巴结转移,预后较差,B7-H1可作为评价胃癌患者预后的指标之一。     

NLR、hs-CRP、MPV与肥胖、非肥胖型PCOS的关系

目的探究中性粒细胞/淋巴细胞比值（NLR）、超敏C反应蛋白（hs-CRP）、血小板平均体积（MPV）与肥胖、非肥胖型多囊卵巢综合征（PCOS）的关系。方法对112例PCOS患者（肥胖型68例,非肥胖型44例）和年龄、BMI配对的90例健康体检女性（健康对照组肥胖型47例,非肥胖型43例）,检测并比较两组及亚组之间MPV、NLR、hs-CRP、生殖内分泌激素及代谢指标。结果PCOS组血清空腹血糖水平（FPG）、空腹胰岛素（FINS）、稳态胰岛素评价指数（HOMA-IR）、NLR、hs-CRP、MPV水平均明显高于健康对照组（均P＜0.05）。肥胖型PCOS组NLR、hs-CRP、MPV高于肥胖型健康对照组（均P＜0.05）。肥胖型PCOS组NLR、hs-CRP、MPV均高于非肥胖型PCOS组（均P＜0.05）。NLR、hs-CRP、MPV的AUC及95%CI分别为0.819（0.763~0.903）、0.982（0.959~1.000）、0.906（0.848~965）。结论肥胖型PCOS患者血清NLR、hs-CRP、MPV水平明显升高,这些指标的变化对肥胖型PCOS代谢异常有较强的诊断价值。     

外源N6-甲基腺嘌呤掺入对细胞mRNA表达的影响(英文)

N⁶-甲基腺嘌呤(m⁶A)是一种真核细胞中最广泛存在且可逆的内源mRNA修饰,它在决定RNA命运中起着至关重要的作用.本文发现外源m⁶A可以通过补救合成途径掺入到细胞mRNA,并评估了外源m⁶A掺入mRNA后所产生的生物学效应.首先,发现用m⁶A核苷处理HeLa细胞会显著改变细胞的形态和活力;然后,合成了同位素标记的d₃-m⁶A(N⁶-甲基-d₃-腺苷),并采用质谱法检测了不同处理时间下细胞mRNA中d₃-m⁶A的掺入率;随后,使用RNA测序(RNA-seq)研究外源m⁶A掺入的生物学效应.结果表明,掺入外源m⁶A后的细胞有数千个基因产生差异表达,并且这些差异表达的基因在核糖体生物发生、 mRNA代谢过程和细胞形态发生分化等途径中显著富集.研究结果表明,外源m⁶A可以通过代谢途径掺入...