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梁桂兆 陈泽聪 杨善彬 梅虎 周原 舒茂 杨力 杨胜喜 郑小林 陈国华 周鹏 田菲菲 廖春阳 吴世容 李根容 李德静 何留 甘孟瑜 高剑坤 陈国平 王贵学 龙莎 景举华 曾晖 张巧霞 张梦军 杨娟 仝建波 王娇娜 刘永红 李波 仇亮加 蔡绍皙 赵娜 杨艳 苏霞利 宋健 陈美霞 陈刚 张雪姣 孙家英 李经纬 邓婕 彭传友 李志 许罗南 廖立敏 吴玉乾 朱万平 苏勤亮 卢大军 李军 黄振虎 周萍 李志良 《中国科学B辑》2007,37(6)
以支持向量机(SVM)和线性判别分析(LDA)对200条禽流感病毒、100条B型流感和100条C型流感病毒蛋白共400条为训练集样本,从表征序列的200个整体与局部变量中以逐步(stepwise)方法选取24个变量作为LDA模型的输入建立线性识别模型,病毒蛋白总识别率达99.8%,留一法交互检验总识别率为99.4%.从原始200变量中经主成分分析得16个主成分作为SVM的输入,以径向基核函数(RBF)SVM建立非线性识别模型,病毒蛋白总识别率为99.8%,留一法交互检验总识别率为99.2%.以100条禽流感、50条B型流感和50条C型流感病毒编码蛋白质共200条为测试集样本,得LDA模型,对其总识别正确率为95.4%,SVM模型对其总识别正确率为96.5%.识别结果表明,两个模型都可较好识别禽流感病毒蛋白,并且SVM对禽流感病毒蛋白的识别结果优于LDA. 相似文献
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采用表征分子内部化学微环境及原子所处杂化状态的结构描述子：原子电性作用矢量(AEIV)和原子杂化状态指数(AHSI),对42个吖啶酮生物碱分子792个共振碳原子进行结构表征,以多元线性回归技术建立13C核磁共振化学位移定量结构波谱关系模型,所得回归模型的复相关系数为R=0.957,标准偏差为SD=12.247. 采用留一法交互检验的结果为Rcv=0.956,标准偏差SDcv=12.331. 对外部样本集预测结果表明,AEIV和AHSI具有表征能力强、物化意义明确等优点,所建模型具有良好的稳定性和估计能力. 相似文献
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一种新多肽表征方法及支持向量机用于肽HPLC定量结构-保留建模预测 总被引：1，自引：0，他引：1
从20种天然氨基酸的1369种性质参数经主成分分析得出一种新多肽序列表征方法——SZOTT. 将其用于71个不同长度肽序列表征, 以偏最小二乘(PLS)和支持向量机(SVM)建立定量结构-保留模型(QSRM). 研究表明, SZOTT能够较好表征71个肽序列特征, 其含信息量大且易操作, 与PLS相比, SVM对lgk建模预测表现出较强的拟合能力和良好外部预测能力, SZOTT表征方法和SVM建模可进一步用于肽HPLC保留行为研究. 相似文献
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