丝组二肽对DNA切割作用的QM-MM研究

运用QM-MM方法对丝组二肽切割DNA作用的机理进行了研究．通过计算得到了丝组二肽与DNA形成多氢键作用的有效分子识别模型及相关分子结构参数,从理论上解释了丝组二肽与DNA通过形成五配位磷中间体而使磷酸二酯键发生水解,从而使得DNA被切断的作用机理。     

1,4-二氢吡啶类化合物的微波合成方法改进

利用微波辐射来进行有机反应的研究已成为一个热点[1],如何利用微波提高有机反应的反应规模和认识微波反应的本质是未来微波技术的的研究重点.Strauss[2]利用连续微波反应提高了有机化学反应的反应规模,最近Kabza等[3]也发表了这方面的研究报告.     

基于MPI的分子对接并行算法

基于消息传递接口(Message Passing Interface,MPI),用两种不同的并行程序设计方法对Autodock程序进行修改.将修改后的程序应用于HIV-1蛋白酶(Protease)和小分子抑制剂XK263的对接体系,测试了并行程序的加速比和并行效率.结果表明,两种改进的并行Autodock程序都可以很好地完成计算,尤其是方案Ⅱ并行程序的加速比和并行效率更高.     

多面体烷氯乙基脲的合成新方法研究

运用酰氟为中间体,在离子液体中,以多面体烷二羧酸为原料,研究了多面体烷氯乙基脲的合成新方法.在[bmim][BF4]离子液体中,合成了12个未见文献报道的多面体烷氯乙基脲,结构经核磁共振氢谱、碳谱和质谱确证.该方法与以酰氯为中间体的溶剂反应相比,具有产率高、分离简单和环境友好的特点.     

DNA股间交联及与细胞癌变关系的研究进展

癌症是目前全球共同面临的重大公共卫生问题。流行病学研究显示,大约80%～90%的人类癌症是由环境因素诱导产生的,其中又以化学因素占主导地位。化学致癌机理的双区理论认为,环境致癌物经体内代谢生成特定的双官能团烷化剂,从而诱导DNA双链互补碱基对之间的交联并最终引发癌症。目前针对DNA股间交联的检测方法已有不少研究,然而DNA股间交联如何引起细胞癌变的机理仍悬而未决,这也成为人们关注的焦点。本文旨在通过综述近年来对DNA股间交联的研究,从其结构、体内形成过程和检测方法等方面,探讨DNA股间交联与细胞癌变的关系,为环境致癌机理的研究提供思路。     

位形空间非定域Ward恒等式

从Faddeev Popov(FP)方法对规范理论给出的位形空间生成泛函出发，导出了位形空间非定域变换下的Ward恒等式。应用于非Abel Chern Simons(CS)理论，得到了CS规范场鬼场正规顶角间的Ward恒等，并把此结果与文献［1］做了对比，对规范理论用位形空间路径积分讨论更简便。     

与金精三羧酸抑制剂的相互作用

用分子对接方法(Docking)研究了HIV-1整合酶与其抑制剂金精三羧酸的结合过程．为弄清金属离子在结合中所起的作用，选择含有一个Mg+2或不含Mg+2的两种不同的整合酶受体分别与金精三羧酸对接．结果表明，Mg+2对稳定配体与受体的结合起了重要作用．金精三羧酸配体与含有一个金属Mg+2的整合酶受体对接，最优结合自由能为-45．19kJ／mol.当Mg+2失去后，整合酶的活性中心构象将发生变化，使金精三羧酸抑制剂与整合酶的结合自由能(-24．35kJ／mol)明显增加．预测了未知的HIV-1整合酶与其抑制剂金精三羧酸的复合物结构，并可对基于结构的抗HIV-1整合酶的药物设计提供重要信息．     

污染水产去甲基化表观遗传毒性EGFP评价方法

pEGFP-C3质粒经过体外人工甲基化处理后,被转染进入HepG2细胞以构建重组细胞株．以5-AZA为阳性去甲基化毒物与重组细胞共培养,通过亚硫酸氢钠测序法定量检测EGFP基因启动子区甲基化状态,通过实时定量PCR检测EGFP基因表达,借助流式细胞术和荧光摄片定量检测共培养细胞的绿色荧光强度,在DNA甲基化、EGFP基因mRNA表达、GFP蛋白等多个层次研究5-AZA染毒处理与其去甲基化能力和荧光表达改变的响应关系．对天津污染水产的去甲基化能力进行了实际样品测试．结果表明,5-AZA与重组细胞的DNA甲基化、基因表达、蛋白产物变化之间存在显著关联,具有较低的检出浓度和良好的重复性．天津污染海域的水产去甲基化能力较强．本文初步建立了一种污染物去甲基化表观遗传毒性评价方法．     

反相高效液相色谱双梯度洗脱分离肽混合物及质谱分析

复杂肽段混合物的有效分离是高覆盖率地鉴定蛋白质混合物的前提。“鸟枪法”(Shotgun)蛋白质组学研究策略通常采用蛋白酶切、二维液相色谱-串联质谱分析肽段混合物从而鉴定蛋白质,其中高效率地分离肽段混合物是关键步骤之一。本文通过pH梯度结合有机溶剂梯度的反相高效液相色谱(RP-HPLC)进行一维液相色谱分离,按等时间间隔收集馏分并将一个梯度的前段的一个馏分与后段一个馏分混合,然后进行纳升级液相色谱-质谱联用(nanoRPLC-MS/MS)分析。将该方法应用于酵母蛋白质的分离和鉴定,实验结果为: 与常规的强阳离子色谱-反相液相色谱-质谱分离鉴定方法相比,采用pH梯度结合有机相梯度的RP-HPLC-RPLC-MS分离鉴定方法多鉴定到567个酵母蛋白质(簇,含有3035个唯一肽段);其中鉴定到肽段的pI分布范围为3.42～12.01,相对分子质量范围为587.67～3499.79;蛋白质的pI分布范围为3.82～12.19,相对分子质量范围为3446.55～432905。该结果表明这种方法在复杂体系蛋白质组分离鉴定中具有明显的优势,在蛋白质组学研究中有较好的应用前景。     

促甲状腺激素化学发光免疫分析的研究

抗原、抗体间可发生特异性免疫反应 ,将发光物质标记在抗体上 ,经免疫反应和化学发光反应 ,测量光信号可对待测抗原进行定性、定量分析。本实验以吖啶酯DMAE·NHS标记TSH单克隆抗体 ,建立了TSH化学发光免疫分析方法。该方法分析灵敏度为 0 .0 1mIU/L ,批内相对标准偏差为 4 .2 9%～ 6 71% ,批间相对标准偏差为 4 .36 %～ 8.14 % ;平均回收率为 98%。与TSHIRMA法的相关方程为Y =0 .0 2 +0 .92X ,相关系数为 0 .993;与CibaCorningTSHCLIA测量值的相关方程为Y =- 0 .16 +0 .92X ,相关系数为 0 .986。