南美白对虾两养殖群体遗传多样性的比较分析

采用同工酶电泳技术和随机扩增DNA多态技术对浙江省养殖的普通南美白对虾（简称P群体，下同）和SPF南美白对虾子一代（简称S群体，下同）两个群体的遗传多样性进行比较分析．结果表明，编码南美白对虾肌肉7种同工酶的18个基因位点中，EST-1、EST-2、EST-3和MDH-1位点具有多态现象；P群体和S群体的多态位点比例均为22．22％，平均杂合度分别为0．0666和0．0542；两群体间的遗传相似系数为0．9968，Nei遗传距离为0．0032．而利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术，共检测出110个RAPD位点，其中P群体的多态位点数56个，多态位点比例为50．91％，S群体的多态位点数52个，多态位点比例为47．27％；P群体和S群体内个体间平均遗传相似度分别为0．8623和0．8742；两群体间的遗传相似度为0．9815，遗传距离为0．0185．无论是同工酶电泳结果还是RAPD分析结果都表明浙江省养殖的SPF南美白对虾子一代的遗传多样性水平比普通南关白对虾要低．     

濒危植物长叶榧群体不同年龄级遗传多样性的RAPD和ISSR分析

按胸径将浙江省桐庐县白云源森林公园长叶榧群体划分为成体、小树、幼苗3个年龄级,利用RAPD和ISSR分子标记对不同年龄级的遗传多样性及遗传分化进行分析.12个RAPD引物和12个ISSR引物分别扩增出199和180个条带,总多态位点百分率分别为44.72%和56.11%.RAPD和ISSR分析均显示3个年龄级的多态位点百分率、Shannon信息指数、Nei指数以成体最高,小树次之,幼苗最低,表明长叶榧群体遗传变异呈衰退趋势.分子方差分析(AMOVA)表明长叶榧群体不同年龄级内、年龄级间均存在遗传变异,但遗传变异主要存在于年龄级内.RAPD和ISSR分析显示,长叶榧群体不同年龄级间的遗传分化系数(Gst)分别为0.2869、0.3077,基因流(Nm)分别为1.2412、1.1231.长叶榧群体不同年龄级间的遗传相似度以幼苗与小树最高,遗传距离以幼苗与小树间最小.在长叶榧群体不同年龄级中,ISSR能检测到比RAPD更多的遗传变异,经Mantel检验,两种分子标记的分析结果相关性极显著.     

黄颡鱼RAPD标记及其遗传多样性的初步分析

以雌、雄黄颡鱼DNA池为模板,从422个引物中筛选出61个RAPD反应重复性好、带型清晰明亮的引物,这些引物可用于黄颡鱼的分子标记或鉴定.采用10～11个引物先后对两批黄颡鱼（简称群体A和群体B）进行群体RAPD多样性分析.在群体A（21尾）中共检测到95个位点,其中27个为多态位点占总位点数28.42%,其群体Nei&Li氏遗传相似率为90.67%,Shannon信息指数为0.0918比特;在群体B中共检出46个位点,其中多态位点12个占26.09%,其群体Nei&Li氏遗传相似率为93.27%,Shannon信息指数为0.0670比特.黄颡鱼的遗传多样性比已报道的普通鲫鱼和野生稀有鲫的低而高于长江鳙鱼.     

“东海1号”大黄鱼选育F_4代遗传多样性的AFLP分析

应用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对以岱衢洋野生大黄鱼为亲本、通过群体选育方法获得的"东海1号"大黄鱼选育系F4代进行了遗传多样性分析.结果显示:16对AFLP选择性扩增引物组合在选育F4代的20尾个体中共扩增出736个位点,其中多态位点292个,多态率为39.67%;各引物对的Nei’s遗传多样性指数范围为0.090 4~0.203 7,平均值为0.139 9;Shannon多样性范围为0.132 0~0.304 7,平均值为0.209 9;其遗传多样性水平与原始亲本群体相当.表明若群体选育方法得当,多代选育后仍能维持较好的遗传多样性水平.     

人工选育F5代萍乡肉红鲫RAPD遗传分析

萍乡肉红鲫是分布于江西萍乡的具有地方特色的品种,经过人工选育获得了较为稳定的遗传特征。用经过筛选的23个随机引物对25个人工选育F5代萍乡肉红鲫基因组DNA进行RAPD分子标记。结果显示扩增片段大小在250 bp至2 100 bp,共扩增的条带数为229,差异标记条带大多数为弱带,多态位     

长江鳙遗传多样性的研究

运用40 个10 碱基随机引物对长江中游鳙(Aristchthysnobilis)的遗传多样性进行了随机扩增多态DNA(RAPD)分析. 所用引物中,有10 个能对鳙不同个体扩增出多态DNA 带,占总引物数的25% . 据所取长江中游自然繁殖的18条鳙样品的RAPD谱带的分析结果表明,鳙任意两个体间的遗传相似度在0.938 6～0.985 7之间,平均值为0.966 1;遗传变异度则在0.014 3～0.061 4 之间,平均值为0.043 9;所分析样本的Shannon 表型多样性指数(Ho)为7.285 8,Shannon 多样性值(H)为0.053 2. 人工繁殖鳙的遗传变异度和Shannon 表型多样性指数均明显低于长江自然繁殖群体.     

浙江省桃花水母遗传多样性的RAPD分析

应用RAPD技术对浙江省杭州、宁波、温州和金华4个地区桃花水母群体的遗传多样性进行了分析,从80个随机引物中筛选出10个引物对4个群体28个个体的基因纽DNA进行扩增,共检测到230个位点,分子片段在200-2000bp之间,其中多态位点124个,占53．91％;群体间最大的遗传距离为0．6506,最小的遗传距离为0．2451,平均遗传距离为0．4825;各群体的多态位点比例俨）为27．78％-76．47％,平均杂合度（H）为0．0998-0．2977,shannon多样性指数（I）为0．1500-0．4390．整个群体的H,I和遗传分化指数（Gst）分别为0．2610、0．3931和0．2249．研究结果表明：桃花水母的遗传多样性较丰富,其中宁波象山和杭州玉泉群体遗传多样性水平低于整体水平,温州平阳和金华永康群体的遗传多样性水平高于整体水平,且群体内存在较大的遗传分化．     

RAPD分析江西贡江水系鲤鱼种群遗传多样性

用RAPD技术分析了江西贡江水系(瑞金,兴国,赣县,于都,会昌5个县域水域)鲤鱼遗传多样性.在25个随机引物中,筛选了11个多态引物,PCR扩增共得到条带177 2条,其中特异性条带占总条带数百分比达到85.04%.结果表明贡江水系的鲤鱼有较强的遗传多样性.其中,瑞金鲤鱼的遗传多样性最高,Nei's基因多样性指数(He)达到0.291 9.会昌鲤鱼的遗传多样性最低,Nei's基因多样性指数(He)只有0.236 1.5个县域水域的遗传多样性指数(He)排序依次为瑞金(0.291 9),兴国(0.267 6),赣县(0.280 7),于都(0.278 1),会昌(0.236 1).     

西藏近缘野生大麦RAPD和ISSR分子标记的遗传多样性

采用随机扩增多态性分析（RAPD）和简单序列重复区间分析（ISSR）分子标记对110份青藏高原近缘野生大麦材料进行了遗传多样性分析．分别选取30条RAPD引物和10条ISSR引物进行PCR分析．结果表明30条RAPD引物共扩增出195条带，其中多态性位点比率为93．33％；10条ISSR引物共扩增出93条带，其中多态性位点比率为98．92％；研究证明ISSR标记能检测出比RAPD标记更多的遗传多态性．利用POPGNEN32软件对RAPD和ISSR结果进行遗传一致性系数分析，表明各居群的遗传相似性较高．利用算术平均的非加权成对分组法（UPGMA法）对RAPD标记和ISSR标记结果构建西藏近缘野生大麦聚类树状图，可将7个供试大麦居群聚为2组：一组包含所有来自西藏的居群，在ISSR树状图中阿里地区除外；而青海地区的聚为另外一组．结果表明，西藏地区近缘野生大麦具有较高的遗传多样性，为进一步证明西藏是大麦的起源中心之一的理论积累了有益的资料．     

RAPD标记在唇(鱼骨)与花(鱼骨)种质鉴定中的应用

利用RAPD分子标记技术对浙江瓯江溪水性鱼类唇[鱼骨]和花[鱼骨]进行了种质鉴定和遗传分析,从40个10碱基随机引物中筛选出14个多态性高的引物,分别扩增出130条和127条DNA带,多态位点比率达84．62％和66．93％,平均每个引物扩增多态性带9．3条和9．1条．Shannon多样性指数为0．4515和0．3548,Nei＇S指数为0．3037和0．2392．唇[鱼骨]和花蜡群体间的平均遗传距离为0．2880和0．2096．引物S383、S399、S463和S471扩增的6个特异性标记,可用来区分唇[鱼骨]和花[鱼骨]．最后应用UPMGA法对它们进行了聚类分析．结果表明唇[鱼骨]和花[鱼骨]的群体遗传多样性较高,存在较大的遗传变异．RAPD分子标记技术可以方便地应用于[鱼骨]属鱼类的种质鉴定．     

两个不同江豚群体ISSR遗传多样性初步分析

采用ISSR分子标记对中国水域隶属于不同江豚（Neophocaena phocaenoides）亚种的两个群体即长江群体和渤海群体的遗传多样性进行分析。用19条ISSR引物及3对引物组合对两个群体共36个样品的基因组DNA进行PCR扩增，共得到115个清晰的扩增位点，其中多态性位点48个，多态位点百分率（PPL）为41．71％。POPGENE分析结果表明：两个江豚群体的总体遗传多样性水平相对较低（He=0．1643；Ho=0．2413）；长江群体的遗传多样性水平（He=0．1530；Ho=0．2223）稍高于渤海群体（He=0．1402；Ho=0．2059）。Nei＇s遗传多样性分析结果表明群体结构水平较低而基因流水平较高（Gst=0．1049；Nm=4．2676），提示在历史上可能发生过较强的基因交流。我们建议在保护上将两个群体划分为不同的管理单元。     

普通鲫鱼的RAPD标记及其遗传多样性

采用了387个引物对普通鲫鱼进行了RAPD(random amplified polymorphic DNA)分析,筛选出了31个重复性好、可用于普通鲫鱼RAPD标记的引物．另用8个引物对普通鲫鱼(20尾)进行了遗传多样性分析：这8个引物共检出45个位点,其中多态性位点数24个,占总位点数的53．33％;据个体间共有带数和Nei′s遗传相似率计算公式,计算出普通鲫鱼平均遗传相似率为88．68％．上述两项指标的初步分析表明,普通鲫鱼具有较为丰富的遗传多样性．     

基于ISSR-PCR技术的菘蓝种质资源遗传多样性

菘蓝的干燥根板蓝根是重要的中药资源。本研究首次从板蓝根干样中成功提取到DNA,利用正交试验建立并优化了ISSR-PCR体系,对其遗传多样性进行分析。从16条引物中筛选出6条多态性丰富、谱带清晰且重复性好的引物进行ISSR-PCR扩增。6条引物共扩增获得71条带,其中多态性谱带68条,多态位点百分率为95.77%,遗传相似系数变化范围为0.861～1.000。实验结果表明我国菘蓝资源丰富,这为其遗传育种、种质资源评估及品种鉴定提供理论基础。     

鄱阳湖区泥鳅的微卫星DNA多态性分析

应用SSR标记技术对鄱阳湖地区的3种不同斑纹泥鳅的遗传差异进行分析.利用6对特异性引物,在3种斑纹泥鳅中共获得67个微卫星位点,其中在大花斑泥鳅中多态性位点为45个,多态性比例为67.16%,小花斑泥鳅的多态性位点为39个,多态性比例为58.21%,无花斑泥鳅多态性位点为15,多态性比例为22.39%.大、小、无3种斑纹泥鳅的平均期望杂合度分别为0.155 4、0.179 9、0.085 7;平均多态信息含量分别0.273 7、0.362 6、0.198 9.分析显示3种花斑泥鳅间的遗传多样性很低,其中无花斑泥鳅尤甚.从Nei的遗传距离得到的系统聚类树状图显示小花斑泥鳅和无小花斑泥鳅先聚在一起,然后再和大花斑泥鳅聚在一起,结果显示小花斑泥鳅和无花斑泥鳅的亲缘关系更近.分析结果对我们正在开展的泥鳅良种选育具有重要的参考价值.     

利用SRAP和ISSR标记分析五节芒(Miscanthus floridulus)的遗传多样性

对41个来自于梁子岛上4个居群的五节芒(Miscanthus floridulus)进行相关序列扩增多态性(se-quence-related amplified polymorphism,SRAP)和简单重复序列区间标记(inter simple sequence repeat,ISSR)分析.利用POPGENE32version1.32软件计算多样性指数,采用NTSYS.2.10e计算软件,得到相似性系数,并用UPG-MA法进行聚类分析.结果显示6条ISSR多态性引物,共扩增出103条DNA条带,其中98条为多态性条带,占95.15%,样品之间的相似系数为0.67～0.95.6对SRAP引物,共扩增出173条DNA条带,其中147条为多态性条带,占84.97%,样品之间的相似系数为0.75～1.00.两种标记均表明五节芒具有较高的遗传多样性.分别以个体为单位及以群体为单位进行聚类分析,2种标记分别得到了相似但并不完全相同的个体聚类图及群体聚类图.研究结果表明五节芒的遗传多样性水平较高.SRAP与ISSR标记均适用于五节芒的遗传多样性分析.     

23种鸢尾属植物种质资源的AFLP分析

采用AFLP(扩增性片段长度多态性)分子标记技术对23种37份栽培鸢尾属植物种质资源进行遗传多样性分析,将筛选出的4对AFLP分子标记引物对材料进行扩增,共得到205个位点,其中177个为多态位点,多态位点百分率为86.3%;37份材料之间的遗传相似系数在0.23～0.97之间,平均为0.81.通过遗传相似系数计算,样品总体上亲缘关系非常接近,而白花紫苞鸢尾与其他物种有明显差异.本文还利用UPGMA(非加权算术平均法)进行样品聚类,分析了包括23个种的37份样品之间的遗传关系.     

鲫鲤杂交F1及其亲本RAPD标记

用RAPD技术对红鲫(♀)×野鲤(♂)及其F1个体进行了研究．15个引物在鲤鱼中扩增出86条带(33条具多态性),红鲫75条带(24条呈多态性),两者共享25条(16条呈多态性)．F     

湖北大麦品种资源的RAPD分析

在对105份湖北栽培大麦酯酶同工酶研究的基础上,采用RAPD技术对分属于8种酶谱类型的10份湖北栽培大麦品种进行了研究.63个随机引物中有12个引物产生稳定多态性的带,共扩增出73条带,其中46条表现出多态性.将每一条带视为一个独立的性状,按其有无列出二元数据矩阵,计算Nei氏相似性系数(S)和遗传距离(D),列出遗传距离矩阵,采用PHYLIP3.5c软件包进行聚类.讨论了RAPD的稳定性以及RAPD标记与同工酶标记的异同.     

中国珍稀濒危特有蕨类植物--云贵水韭的遗传多样性

采用随机扩增的多态性DNA（RAPD）方法对云贵水韭现存于贵州平坝境内的惟一的自然居群46个样晶进行厂DNA多态性分析．从60个随机引物中l筛选出12个有效引物，共产生95条DNA片段，其巾59条具有遗传多忿性，多态化点百分率（PPB）为62．1％．与其他蕨类植物相比，云贵水韭居群内存仵较高水平的遗传多样性，较高水甲的遗传多样性，一方面可能足由丁遗传变异长期积累的结果，同时也可能是近期生境的破坏还没有较严晕地到使其遗传多样性丧失．随符居群规模的减小，云贵水韭的遗传多样性将会逐渐丧失，建议用现存于平坝居群的云贵水北材料对其居群进行了恢复重建．     

云南南部5种魔芋属植物居群遗传结构的ISSR分析

采用9个ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记对云南南部魔芋属植物5个物种(花魔芋,疣柄魔芋,攸乐魔芋,勐海魔芋和屏边魔芋)105份材料进行了居群遗传多样性分析.通过PCR扩增,9个ISSR引物从5个物种105份样品中共获得95条条带,其中多态性条带占条带总数的100%.每个位点平均等位基因数2.00,有效等位基因数1.40,平均Nei’s基因多样性指数0.255 2,Shannon’s信息多样性指数为0.401 2.在这5个魔芋属植物物种中,花魔芋居群内遗传多样性水平相对较低.居群水平上的UPGMA聚类表明这5个物种可被分为明显的两大组,花魔芋为一组,其余4种构成一组,其中屏边魔芋与疣柄魔芋遗传距离最近.个体水平上的聚类则显示,花魔芋和疣柄魔芋的个体各自聚在一起,其余3种的个体较为分散.本研究结果还认为人工栽培利用的方式对魔芋属植物遗传多样性可能存在一定影响.