翘嘴红鲌群体遗传多样性分析

基于RAPD方法对江西(鄱阳湖)、湖北(梁子湖)和江苏(太湖)3个群体的翘嘴红鲌遗传多样性进行分析,以评价它们的群体遗传结构和良种选育的可行性。结果显示从30个随机引物中筛选出了20个多态性较高的引物,既可扩增出3个群体共同的DNA条带,也可扩增出单个群体特有的特征条带。从3个群体实验鱼中共检测到119个扩增片段,长度在0.2~1.7kb之间。鄱阳湖群体多态位点数61个,多态位点比为51.26%,梁子湖群体多态位点数50个,多态位点比为42.02%,太湖群体多态位点数67个,多态位点比为56.30%。3个群体的Shannon多样性指数分别为0.429 2,0.382 8和0.443 1。群体间遗传相似系数依次为:最高是鄱阳湖与梁子湖,为0.8055,其次是鄱阳湖与太湖,为0.801 6,最低是梁子湖与太湖,为0.785 2。结果提示,鄱阳湖与梁子湖亲源关系较近,与太湖稍远;所筛选出的引物应用RAPD技术可以方便地分析不同群体翘嘴红鲌的遗传多样性,并可为良种选育的亲本选择提供依据。     

长江鳙遗传多样性的研究

运用40 个10 碱基随机引物对长江中游鳙(Aristchthysnobilis)的遗传多样性进行了随机扩增多态DNA(RAPD)分析. 所用引物中,有10 个能对鳙不同个体扩增出多态DNA 带,占总引物数的25% . 据所取长江中游自然繁殖的18条鳙样品的RAPD谱带的分析结果表明,鳙任意两个体间的遗传相似度在0.938 6～0.985 7之间,平均值为0.966 1;遗传变异度则在0.014 3～0.061 4 之间,平均值为0.043 9;所分析样本的Shannon 表型多样性指数(Ho)为7.285 8,Shannon 多样性值(H)为0.053 2. 人工繁殖鳙的遗传变异度和Shannon 表型多样性指数均明显低于长江自然繁殖群体.     

23种鸢尾属植物种质资源的AFLP分析

采用AFLP(扩增性片段长度多态性)分子标记技术对23种37份栽培鸢尾属植物种质资源进行遗传多样性分析,将筛选出的4对AFLP分子标记引物对材料进行扩增,共得到205个位点,其中177个为多态位点,多态位点百分率为86.3%;37份材料之间的遗传相似系数在0.23～0.97之间,平均为0.81.通过遗传相似系数计算,样品总体上亲缘关系非常接近,而白花紫苞鸢尾与其他物种有明显差异.本文还利用UPGMA(非加权算术平均法)进行样品聚类,分析了包括23个种的37份样品之间的遗传关系.     

浙江省桃花水母遗传多样性的RAPD分析

应用RAPD技术对浙江省杭州、宁波、温州和金华4个地区桃花水母群体的遗传多样性进行了分析,从80个随机引物中筛选出10个引物对4个群体28个个体的基因纽DNA进行扩增,共检测到230个位点,分子片段在200-2000bp之间,其中多态位点124个,占53．91％;群体间最大的遗传距离为0．6506,最小的遗传距离为0．2451,平均遗传距离为0．4825;各群体的多态位点比例俨）为27．78％-76．47％,平均杂合度（H）为0．0998-0．2977,shannon多样性指数（I）为0．1500-0．4390．整个群体的H,I和遗传分化指数（Gst）分别为0．2610、0．3931和0．2249．研究结果表明：桃花水母的遗传多样性较丰富,其中宁波象山和杭州玉泉群体遗传多样性水平低于整体水平,温州平阳和金华永康群体的遗传多样性水平高于整体水平,且群体内存在较大的遗传分化．     

两个不同江豚群体ISSR遗传多样性初步分析

采用ISSR分子标记对中国水域隶属于不同江豚（Neophocaena phocaenoides）亚种的两个群体即长江群体和渤海群体的遗传多样性进行分析。用19条ISSR引物及3对引物组合对两个群体共36个样品的基因组DNA进行PCR扩增,共得到115个清晰的扩增位点,其中多态性位点48个,多态位点百分率（PPL）为41．71％。POPGENE分析结果表明：两个江豚群体的总体遗传多样性水平相对较低（He=0．1643;Ho=0．2413）;长江群体的遗传多样性水平（He=0．1530;Ho=0．2223）稍高于渤海群体（He=0．1402;Ho=0．2059）。Nei＇s遗传多样性分析结果表明群体结构水平较低而基因流水平较高（Gst=0．1049;Nm=4．2676）,提示在历史上可能发生过较强的基因交流。我们建议在保护上将两个群体划分为不同的管理单元。     

南美白对虾两养殖群体遗传多样性的比较分析

采用同工酶电泳技术和随机扩增DNA多态技术对浙江省养殖的普通南美白对虾（简称P群体，下同）和SPF南美白对虾子一代（简称S群体，下同）两个群体的遗传多样性进行比较分析．结果表明，编码南美白对虾肌肉7种同工酶的18个基因位点中，EST-1、EST-2、EST-3和MDH-1位点具有多态现象；P群体和S群体的多态位点比例均为22．22％，平均杂合度分别为0．0666和0．0542；两群体间的遗传相似系数为0．9968，Nei遗传距离为0．0032．而利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术，共检测出110个RAPD位点，其中P群体的多态位点数56个，多态位点比例为50．91％，S群体的多态位点数52个，多态位点比例为47．27％；P群体和S群体内个体间平均遗传相似度分别为0．8623和0．8742；两群体间的遗传相似度为0．9815，遗传距离为0．0185．无论是同工酶电泳结果还是RAPD分析结果都表明浙江省养殖的SPF南美白对虾子一代的遗传多样性水平比普通南关白对虾要低．     

人工选育F5代萍乡肉红鲫RAPD遗传分析

萍乡肉红鲫是分布于江西萍乡的具有地方特色的品种,经过人工选育获得了较为稳定的遗传特征。用经过筛选的23个随机引物对25个人工选育F5代萍乡肉红鲫基因组DNA进行RAPD分子标记。结果显示扩增片段大小在250 bp至2 100 bp,共扩增的条带数为229,差异标记条带大多数为弱带,多态位     

RAPD分析江西贡江水系鲤鱼种群遗传多样性

用RAPD技术分析了江西贡江水系(瑞金,兴国,赣县,于都,会昌5个县域水域)鲤鱼遗传多样性.在25个随机引物中,筛选了11个多态引物,PCR扩增共得到条带177 2条,其中特异性条带占总条带数百分比达到85.04%.结果表明贡江水系的鲤鱼有较强的遗传多样性.其中,瑞金鲤鱼的遗传多样性最高,Nei's基因多样性指数(He)达到0.291 9.会昌鲤鱼的遗传多样性最低,Nei's基因多样性指数(He)只有0.236 1.5个县域水域的遗传多样性指数(He)排序依次为瑞金(0.291 9),兴国(0.267 6),赣县(0.280 7),于都(0.278 1),会昌(0.236 1).     

罗氏沼虾遗传多样性的RAPD研究

采用RAPD技术,对20世纪70年代从马来西亚引进的7对罗氏沼虾后代的养殖群体(简称NY)和90年代从新加坡引进的天然群体的F1与养殖群体交配繁殖的后代(简称NX)的遗传多样性进行了研究.用OPM组随机引物对两个群体的基因组DNA进行分析的结果表明,扩增的DNA片段大小在0.1～1.5kb之间.NY群体内的平均遗传相似度(simiIarity,S)为0.8819,NX群体内的平均遗传相似度(5)为0.5857.他们的遗传变异度(variability,V)分别是0.1181和0.4143.NY群体的变异度明显小于NX群体.这可能与NY群体长时期的近亲间或在小群体内繁殖导致种群退化有关.     

黄颡鱼RAPD标记及其遗传多样性的初步分析

以雌、雄黄颡鱼DNA池为模板,从422个引物中筛选出61个RAPD反应重复性好、带型清晰明亮的引物,这些引物可用于黄颡鱼的分子标记或鉴定.采用10～11个引物先后对两批黄颡鱼（简称群体A和群体B）进行群体RAPD多样性分析.在群体A（21尾）中共检测到95个位点,其中27个为多态位点占总位点数28.42%,其群体Nei&Li氏遗传相似率为90.67%,Shannon信息指数为0.0918比特;在群体B中共检出46个位点,其中多态位点12个占26.09%,其群体Nei&Li氏遗传相似率为93.27%,Shannon信息指数为0.0670比特.黄颡鱼的遗传多样性比已报道的普通鲫鱼和野生稀有鲫的低而高于长江鳙鱼.     

黄颡鱼属SSR分子鉴定及其遗传多样性

利用13对SSR引物对黄颡鱼属进行遗传多样性和分类研究。结果显示,13对SSR引物中有10对为有效引物,获得93条多态性条带,每对引物扩增条带的数目范围为8~11,扩增片段大小在90~400bp之间,SSR获得的多态性条带所构成各物种的特异性谱系能够用于黄颡鱼属的区分。聚类结果显示,5种黄颡鱼之间的遗传相似系数范围为0.670~1.000,瓦氏黄颡鱼、长须黄颡鱼和中间黄颡鱼亲缘关系较近,之后与光泽黄颡鱼聚为一支,普通黄颡鱼与其它物种差异最大。黄颡鱼属遗传多样性分析结果显示5种黄颡鱼遗传多样性处于水平较高,这将有助于后续深入对黄颡鱼属各物种亲缘关系和系统演化进行分析和理论研究。     

利用SRAP和ISSR标记分析五节芒(Miscanthus floridulus)的遗传多样性

对41个来自于梁子岛上4个居群的五节芒(Miscanthus floridulus)进行相关序列扩增多态性(se-quence-related amplified polymorphism,SRAP)和简单重复序列区间标记(inter simple sequence repeat,ISSR)分析.利用POPGENE32version1.32软件计算多样性指数,采用NTSYS.2.10e计算软件,得到相似性系数,并用UPG-MA法进行聚类分析.结果显示6条ISSR多态性引物,共扩增出103条DNA条带,其中98条为多态性条带,占95.15%,样品之间的相似系数为0.67～0.95.6对SRAP引物,共扩增出173条DNA条带,其中147条为多态性条带,占84.97%,样品之间的相似系数为0.75～1.00.两种标记均表明五节芒具有较高的遗传多样性.分别以个体为单位及以群体为单位进行聚类分析,2种标记分别得到了相似但并不完全相同的个体聚类图及群体聚类图.研究结果表明五节芒的遗传多样性水平较高.SRAP与ISSR标记均适用于五节芒的遗传多样性分析.     

鄱阳湖区泥鳅的微卫星DNA多态性分析

应用SSR标记技术对鄱阳湖地区的3种不同斑纹泥鳅的遗传差异进行分析.利用6对特异性引物,在3种斑纹泥鳅中共获得67个微卫星位点,其中在大花斑泥鳅中多态性位点为45个,多态性比例为67.16%,小花斑泥鳅的多态性位点为39个,多态性比例为58.21%,无花斑泥鳅多态性位点为15,多态性比例为22.39%.大、小、无3种斑纹泥鳅的平均期望杂合度分别为0.155 4、0.179 9、0.085 7;平均多态信息含量分别0.273 7、0.362 6、0.198 9.分析显示3种花斑泥鳅间的遗传多样性很低,其中无花斑泥鳅尤甚.从Nei的遗传距离得到的系统聚类树状图显示小花斑泥鳅和无小花斑泥鳅先聚在一起,然后再和大花斑泥鳅聚在一起,结果显示小花斑泥鳅和无花斑泥鳅的亲缘关系更近.分析结果对我们正在开展的泥鳅良种选育具有重要的参考价值.     

5种不同体色黄鳝RAPD的初步分析

应用RAPD技术对鄱阳湖区5种不同体色黄鳝进行了遗传多样性研究,结果发现,该物种种群总基因多样性(Ht)为0.272 4,各群体内的基因多样性(Hs)为0.1948,占总群体基因变异的71.51%,提示鄱阳湖黄鳝具有较高的遗传多样性,且遗传变异主要存在于群体内.结果还发现,5种不同体色黄鳝群体间的遗传距离在0.040 0-0.180 l之间,其中细花斑群体与黄黑斑群体之间的遗传距离最小,大花斑与隐花斑之间的遗传距离最大;群体间的遗传分化系数(Gst)为0.2849,这表明,5种不同体色群体间存在明显的遗传分化.     

濒危植物长叶榧群体不同年龄级遗传多样性的RAPD和ISSR分析

按胸径将浙江省桐庐县白云源森林公园长叶榧群体划分为成体、小树、幼苗3个年龄级,利用RAPD和ISSR分子标记对不同年龄级的遗传多样性及遗传分化进行分析.12个RAPD引物和12个ISSR引物分别扩增出199和180个条带,总多态位点百分率分别为44.72%和56.11%.RAPD和ISSR分析均显示3个年龄级的多态位点百分率、Shannon信息指数、Nei指数以成体最高,小树次之,幼苗最低,表明长叶榧群体遗传变异呈衰退趋势.分子方差分析(AMOVA)表明长叶榧群体不同年龄级内、年龄级间均存在遗传变异,但遗传变异主要存在于年龄级内.RAPD和ISSR分析显示,长叶榧群体不同年龄级间的遗传分化系数(Gst)分别为0.2869、0.3077,基因流(Nm)分别为1.2412、1.1231.长叶榧群体不同年龄级间的遗传相似度以幼苗与小树最高,遗传距离以幼苗与小树间最小.在长叶榧群体不同年龄级中,ISSR能检测到比RAPD更多的遗传变异,经Mantel检验,两种分子标记的分析结果相关性极显著.     

RAPD标记在唇(鱼骨)与花(鱼骨)种质鉴定中的应用

利用RAPD分子标记技术对浙江瓯江溪水性鱼类唇[鱼骨]和花[鱼骨]进行了种质鉴定和遗传分析,从40个10碱基随机引物中筛选出14个多态性高的引物,分别扩增出130条和127条DNA带,多态位点比率达84．62％和66．93％,平均每个引物扩增多态性带9．3条和9．1条．Shannon多样性指数为0．4515和0．3548,Nei＇S指数为0．3037和0．2392．唇[鱼骨]和花蜡群体间的平均遗传距离为0．2880和0．2096．引物S383、S399、S463和S471扩增的6个特异性标记,可用来区分唇[鱼骨]和花[鱼骨]．最后应用UPMGA法对它们进行了聚类分析．结果表明唇[鱼骨]和花[鱼骨]的群体遗传多样性较高,存在较大的遗传变异．RAPD分子标记技术可以方便地应用于[鱼骨]属鱼类的种质鉴定．     

江西穗花杉自然居群遗传多样性的ISSR分析

采用ISSR分子标记技术对江西5个自然穗花杉居群的遗传多样性水平和居群遗传结构进行了研究。用10个引物对5个居群58个样品进行扩增,共得到61条清晰的扩增带。在物种水平上,多态性百分率(PPB)83.61%,Nei’s基因多样性指数(H)为0.314 6,Shannon’s信息多样性指数(H0)为0.465 4。     

甜槠种群遗传多样性的简单重复序列区间初步分析

应用简单重复序列区间（ISSR）分子标记方法对甜槠种群的遗传多样性和遗传分化进行了初步研究．从100个引物中筛选出12个用于正式扩增的ISSR引物,在9个种群179个个体中共检测到202个位点,其中198个是多态位点,多态位点百分率（P）为98．02％．各种群多态位点百分率在60．40％～70．30％,平均为65．29％．甜槠物种水平的Shannon信息指数（I）为0．5322、Nei指数（h）为0．3597．各种群J平均为0．3635、h平均为0．2468．AMOVA分子差异分析表明,65．96％的变异存在于种群内,34．04％的变异存在于种群间,种群间的基因分化系数（GST）为0．3138．甜槠种群间的基因流（Nm）为1．0933．9个种群的平均遗传距离为0．1849,遗传距离与地理距离呈显著正相关．利用UPGMA法对9个种群进行聚类,结果显示浙江省内的8个种群聚成一类,庐山种群单独成一类．     

以RAPD方法分析岩原鲤分类地位

采用opaopoopq等系列44个随机引物对鲤亚科与亚科的几个种类进行随机扩增多态DNA(RAPD)扩增,通过对电泳结果进行系统分析,得出各种间遗传距离分支图.按节点的遗传距离最大数值0.232可以分出亲缘关系最远的两个群体,即由两种普通鲤为一群体,以及由岩原鲤、倒刺和白甲鱼组成的另一群体.从节点间遗传距离数值叠加计算可以得出岩原鲤与其他各种鱼类亲缘关系,遗传距离由近到远分别是:岩原鲤与倒刺(0.344)<岩原鲤与白甲鱼(0.388)<岩原鲤与普通鲤(0.443),岩原鲤与倒刺的遗传距离最小,这一结果表明岩原鲤更偏向于亚科,而不是鲤亚科.     

大花无柱兰遗传多样性的SRAP标记分析

大花无柱兰是一种珍稀兰科植物,具有一定的观赏和药用价值,但数量十分稀少,该物种亟待保护。本研究采用SRAP分子标记技术,对10个居群的115份DNA样品进行PCR扩增,并开展遗传多样性分析。从81对引物中筛选出9个条带清晰、多态性好、重复性高的引物组合,共扩增得到305条谱带。在物种水平上,多态性比率（PPB）为100%,Nei’s基因多样性指数（H）为0.209 8,Shannon’s指数（I）为0.340 2;在居群水平上,PPB为24.59%～52.13%,H为0.079 6～0.165 5,I为0.120 9～0.252 3。居群水平上,基因分化度（Gst）为0.520 9,基因流（Nm）为0.459 9,遗传距离为0.091 9～0.198 4。UPGMA聚类结果表明,10个居群可分为3大类,地理距离相近的居群优先聚集。大花无柱兰的遗传多样性较为丰富,居群间存在一定的遗传分化和基因交流,可采用就地保护和人工栽培等方式加以保护。