化学基元组学与药物创新

化学基元组学（chemomics）是与化学信息学、生物信息学、合成化学等学科相关的交叉学科．生物系统从内源性小分子（天然砌块）出发,通过酶催化的化学反应序列制造天然产物．生物系统通过化学反应和天然砌块向目标天然产物“砌入”一组原子,这样的一组原子称为化学基元（chemoyl）．化学基元组（chemome）是生物组织中所含有的化学基元的全体．化学基元组学研究各种化学基元的结构、组装与演化的基本规律．在生存压力和繁衍需求的驱动下,生物系统已经进化出有效手段来合成天然产物以应付环境的变化,并产生了丰富多彩的生物和化学多样性．近年来,人们意识到药物创新的瓶颈之一是药物筛选资源的日益枯竭．化学基元组学可以解决这个瓶颈问题,它通过揭示生物系统制备化学多样性的规律,发展仿生合成方法制备类天然化合物库（quasi natural product libraries）以供药物筛选．本文综述了化学基元组学的主要研究内容及其在药物创新各领域中的潜在应用．     

GBHA萃取比色测定铁矿石中的氧化钙

GBHA[乙二醛缩双(2-羚基苯胺)]比色测定钙灵敏度较高,选择性较好,但该试剂及其钙螯合物在碱性水溶液中不稳定是主要缺点。西村雅吉等加人Ze-phiramine(氯化十四烷基二甲基(艹卡)基铵)在乙醇存在下用1,2-二氯乙烷萃取比色来提高稳定性。我们按照该文条件,并未得到良好的重现性和稳定性。Zephiramine的存在有助于螯合物萃入二氯乙烷,但主要问题是两相分层太慢,螯合物和水相接触时间长,致逐渐分解褪色。本文采用氯仿一二氯乙烷(1:3)混合溶剂萃取,分层     

分馏萃取分离稀土的数学模拟—HEH(EHP)-煤油-HNO_3-(Sm-Gd)(NO_3)_3体系

进行了HEH(EHP)-煤油-HNO_3-(Sm-Gd)(NO_3)_3体系的萃取平衡实验与分馏萃取实验。串级实验得到了水相出口Sm的纯度为96.7％,有机相出口Gd的纯度>99％的结果。应用萃取平衡实验数据建立了计算简便、精度较高的半经验两相分配模型:?Hi_3~aXj_(i4)~aYj_(i5)~a(i,j=1,2)。给出了由各级平衡分配模型和物料衡算式组成的非线性方程组—一串级模型。介绍了模拟计算所用的矩阵解法及其FORTRAN程序,计算所得各级金属离子浓度、水相酸度、以及自由萃取剂浓度的分布与实验值符合程度较高。     

磺酰脲类除草剂的三维药效团模型

磺酰脲类除草剂是七十年代末期[1，2]开发的一类超高效除草剂，杀草谱广，用量极低．它通过抑制植物体内乙酰乳酸合成酶（ALS，acetolactatesynthase）的活性[3]，破坏支链氨基酸缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的合成，造成杂草的死亡．本文从三维角度出发，利用先进的三维分子设计软件APEX（ActivityPredictionExpertSystem）－3D[4]，建立破酸豚类除草剂药效团模型（biophoremodel），辅助设计、筛选活性化合物；再由药效团构造出模拟ALS酶活性位点（activesites）的空间结构，以该模拟结构为基点，以期设计出全新结构的ALS酶抑制剂的…     

GABAA五种亚型受体与BZ配基的3D-QSAR研究

GABAA受体是中枢神经系统内重要的抑制性受体,有广泛的神经生理活性.由于镇静/抗惊厥药物在临床上的广泛应用,使得其中苯并二氮杂作用位点尤为重要.我们用比较分子场法(CoMFA)对一系列咪唑苯并二氮杂类化合物（BZ）与五种重组受体亚型的亲和力进行了结构活性关系研究,得到的一组模型都有较高的交叉验证系数.并在此基础上,建立了非交叉验证的一组PLS模型.用该组模型对随机选择的6个化合物组成的测试集进行了预测,都得到了相当满意的结果,表明所建立的一组模型具有良好的预测能力.本研究对于设计高亲和力的BZ受体的配基和研究GABAA受体的模型有指导意义.     

表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂的药效团研究

根据一系列表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂的三维定量构效关系研究，得 到了该类抑制剂的药效团，研究结果与Novartis的药效团模型相当类似．药效团包 括一个氢键受体，一个氢键给体，一个疏水区和一个带有氯或溴原子药效团对于研 究表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂结构与活性的关系具有重要的意义．通过三 维数据库搜索可能会得到新的先导化合物．     

遗传算法及其在化学化工中的应用

本文介绍了遗传算法的基本概念、工作原理和步骤, 综述了它在化学化工领域的应用。     

带有分子轨道能量的3D-QSAR对N-氨基咪唑的研

N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制. 用比较分子场（CoMFA）方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型. 与以往模型不同的是，在偏最小二乘（PLS）分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道能量的关系. 结果得到了几个模型，分子轨道能量对模型的贡献能为21.7%，轨道HOMO5对模型的贡献最大.     

JavaScript在网络化学数据库查询系统中的应用

信息时代日新月异的今天,全球信息网（ＷＷＷ,ＷｏｒｌｄＷｉｄｅＷｅｂ）［１］上的信息资源正以指数级的速度增长。化学同样得益于ＷＷＷ的飞速发展,ＷＷＷ上的各种化学数据库为化学工作者查询化学信息带来了很大的方便。然而,在进行网络化学数据库查询时,查询的结...     

稀土配合物的配位数和配位原子

稀土配位化学在整个配位化学中占有突出的地位.S.P.Sinha等曾对截止到1982年的220个稀土配合物作过统计.??等于1984年曾对稀土元素化合物的晶体结构特征进行过综述.本文利用剑桥数据库的资料在中国科学院化工冶金所的Vax机系统上运行,从七万多个配合物的结构数据中检索到686个稀土配合物的结构数据.它包括1935-1988年全部公开发表了的并已收入数据库的数据.现在分三个问题分述如下: