分子筛模型中非骨架离子位置的研究

从理论上研究了非骨架阳离子可能的分布位置．计算了分子筛晶体基本结构单元在整个空间的静电势分布，找出空间中静电势的各个极小点．在静电势最低点逐个放置钠离子，优化，重新计算模型分子筛的电势分布．研究了阳离子放置过程中静电势变化的趋势．     

MCM-22型分子筛中苯分子吸附行为的分子动力学模拟

用分子动力学方法研究了纯硅ＭＣＭ－２２型分子筛中苯分子的吸附行为。计算结果表明,模拟采用刚性骨架或柔性骨架对苯分子的扩散系数并没有大的差别,这表明在较低吸附值的情况下,分子筛骨架的柔性对苯分子吸附和扩散并没有产生大的影响。     

亮氨酸脑啡肽构象的分子动力学方法研究

采用淬火和模拟退火两种分子动力学的方法对亮氨酸脑啡肽进行了构象搜索，发现了多个Gly－Pheβ－Ⅱ’转角的低能构象．计算结果表明，高温淬火和模拟退火两者结合起来可以有效地寻找低能构象．     

Pt(PPh3)2-η2C60络合物的分子轨道研究

近年来,自Kratschmer 等人采用并不复杂的方法就能制备出宏观量的C_(60),人们对它的兴趣也从结构的研究逐渐转向化学性质的研究.C_(60)是目前自然界已知对称性最高的球状分子,每个C 原子都以接近sp~2杂化轨道和相邻的三个C 原子相联.C_(60)的NMR 化学位移以及闭壳层的电子结构和较宽的HOMO-LUMO 间隙,都说明它具有典型的芳香化合物——苯的某些特性.另外,掺杂(碱金属元素)后,它具有的导电性又表现出石墨具有的某些特点.     

分子力学计算的参数化过程

介绍了如何通过设计模型分子构造参数的方法和过程：首先设计模型分子；在平衡位置附近选择几个点，对模型分子进行分子力学和量子化学的计算；计算出量子化学能量Eqm和分子力学能量Emm的差值；然后对结构参数（健长，键角，二面角）和能量差值进行拟合，得拟合曲线的方程，从方程的系数可求出参数．文章给出了一些实例．     

Y型分子筛中苯分子定域和流动性的蒙特卡罗模拟研究

用巨正则蒙特卡罗模拟方法研究了NaY分子筛中苯的扩散性质。结果表明,在苯分子的扩散过程中,钠Y分子筛中存在两个不同的吸附位点。并且,通过高吸附值下这两个吸附位点附近苯分子粒子分布云图的分析,可以发现这两个吸附位点附近的苯分子具有不同的迁移特性,位点C附近的苯分子基本上是定域的,但位点W附近的苯分子则分散在一个相对较广的区域内,可以在超笼内从一个位点迁移到另一个位点。     

模型分子筛对水分子的吸附

用PM3半经验量子化学方法研究了模型分子筛对水分子吸附的性质.通过模拟计算确定了两个低能吸附位点及相应的吸附热,结果与实验值非常接近.同时,从两个不同低能吸附位点可以看出,大笼内的吸附流动性比β笼内的流动性好,即对水分子的吸附有较宽的区域.     

分子筛结构框架铝取代位置的理论研究

给出寻找分子筛铝取代位置的一种普遍的方法．编制了一程序，可以给出某硅铝比下的各不等价硅铝分布方式．用PM3方法计算了Faujasite型分子筛晶体结构模型各不等价硅锡分布方式的生成热面ΔfH.找到了生成熟和铝原子间里的倒数和之间的规律．     

苯并呋喃／噻吩联二苯类PTP1B抑制剂三维构效关系研究

主要采用比较分子力场分析方法（CoMFA）对苯并呋喃／噻吩联二苯类PTP1B (protein tyrosine phosphatase 1B)抑制剂进行了三维构效关系的研究，考察了 静电场、立体场和氢键场对构效关系的影响，交叉系数q^2的值达到0．58，表明 CoMFA得到的构效关系模型比较理想，同时test set中分子的预测活性也表明，模 型具有较好的预测能力，研究还表明，氢键场的加入不一定有利于模型的改善，通 过对分子场等值面图的分析，可以观察到叠合分子周围立体场和静电场对化合物活 性的影响，为改进原有化合物的结构，提高它们的活性提供了指导，还尝试采用比 较分子相似性指数分析方法（CoMFA）对这一系列化合物作了研究，结果表明虽然 CoMFA中加入了疏水场，但是对于研究的体系，CoMFA的模型质量并没有显著提高。     

逐级累计势诱导原子多极矩分布的AM1半经验方法计算

研究了利用ＡＭ１半经验波函数逐级累计势诱导原子多极矩的方法，计算结果表明：原子多极矩模型有较快的收敛速度，而且比势诱导原子电荷模型更好地描述了分子中原子的电荷分布、运算速度比从头计算法快１０００多倍。