一维链状二丁基锡二苯乙醇酸酯的合成、晶体结构及量子化学研究(英文)

由在甲醇中二丁基氧化锡与二苯乙醇酸反应,合成了一个新颖的二烃基锡化合物[nBu2SnO2CC(O)Ph2]n。其结构经IR、元素分析和X-射线单晶衍射表征。该配合物晶体属单斜晶系,空间群Cc,晶胞参数:a=1.84719(8)nm,b=1.20544(5)nm,c=1.03570(4)nm,β=112.571(3)°,V=2.12953(15)nm3,Z=4,Dc=1.431g/cm3,μ(MoKa)=1.217mm-1,F(000)=936,R1=0.0488,wR2=0.0953。晶体结构分析表明,化合物为一维无限链状配位聚合物,中心锡原子为五配位畸变三角双锥构型。两相邻配位聚合链间,通过丁基氢与另一链的苯环发生C—H···π作用,扩展成三维超分子结构。     

活性炭纤维催化氧化NO的量子化学研究

利用密度泛函理论的B3LYP方法,6-31G(d)基组,在zigzag型的四并苯模型上对NO、O2分子在活性炭纤维(ACFs)表面的吸附行为进行研究,并探讨了ACFs催化氧化NO的主要机理路径。研究结果表明,环境气氛中的O2分子可以先吸附于ACFs表面形成两个半醌基(C-O),之后C-O和吸附态的NO(C-NO)发生氧化反应生成-NO2;游离态的O2也可以经过ACFs表面的催化作用形成活性氧原子(O*)从而直接和吸附态的NO反应生成-NO2。与NO相比,O2分子的吸附能大,在同NO的竞争吸附中占据优势,结合统计热力学分析,吸附态的NO和游离态的O2所产生的活性氧原子发生氧化反应是NO转化为NO2的主要途径。     

嗜热蛋白酶PH1704别构中心量子化学计算与突变体动力学简

通过量子化学计算,确定嗜热菌Pyrococcus horikoshii OT3的PH1704蛋白酶别构位点的关键残基为Arg113,Tyr120和Asn129. 其中,Arg113及Asn129与别构抑制剂结合,参与别构调控. Tyr120残基位于亚基交界面附近,并与亲核残基Cys100之间以氢键相连,可通过影响亚基聚合来影响酶的亲核催化. DJ-1超家族的4种构建蛋白的结构显示,120位点位于亚基交界面处,影响亚基的聚合,进而影响蛋白酶的活力,并间接参与别构调控. 分子生物学实验显示,突变体R113T/Y120P/N129D的kcat/km(L·μmol-1·min-1)值是野生型kcat/km值的6倍,h系数由野生型的0.86转变为1.3,负协同效应消失. 113和129位点处阴离子别构剂脱离,从而破坏113,120和129位点间的封闭环结构,使AC交界面α7螺旋(124~129,524~529)间聚合度增强;120位点残基由Tyr转变为Pro,与Cys100间氢键断裂,亲核进攻的阻力减小,从而使酶活力提高,别构负调控消失.     

欢迎订阅《分子催化》

正《分子催化》是由中国科学院主管、科学出版社出版,由中国科学院兰州化学物理研究所主办的向国内外公开发行的学术刊物.主要报导有关分子催化方面的最新进展与研究成果.辟有学术论文、研究简报、研究快报及进展评述等栏目.内容侧重于络合催化、酶催化、光助催化、催化过程中的立体化学问题、催化反应机理与动力学、催化剂表面态的研究及量子化学在催化学科中的应用等.工业催化过程中均相催化     

Relationship between the Biodegradability and Structure of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons

21 Physicochemical and quantum chemical parameters of 17 kinds of polycyclic aromatic hydrocarbons were calculated by using semi-empirical MOPAC AM1 method. By means of Partial Least Squares （PLS）, quantitative structure-biodegradation relationship （QSBR） study was performed with the logarithm of specific biodegradation rates （logKb）. The optimal model was obtained, and the result showed that the first-order molecular connectivity index （^1X）, the energy of the lowest unoccupied molecular orbital （Elumo）, logarithm of n-octyl alcohol/water partition coefficient （logP） and torsion energy （Et） are the dominant factors governing the biodegradability of polyeyelie aromatic hydrocarbons, and the effect of second-order valence molecular connectivity index （^2X^V）, the third-order valence molecular connectivity index （^3X^V） and molar refractivity （Rm） should not be ignored.     

TDNAZ·HNO3和DNAZ·HCl的结构及性能

钝感高能炸药1,3,3-三硝基氮杂环丁烷（TNAZ）可由3,3-二硝基氮杂环丁烷（DNAZ）进行合成．在合成DNAZ的过程中,得到了中间产物N-叔丁基-3,3-二硝基氮杂环丁烷硝酸盐（TDNAZ·HNO3）和3,3-二硝基氮杂环丁烷盐酸盐（DNAZ·HCl）．培养了二者的单晶,并通过X射线单晶结构分析法测定了它们的晶体结构．TDNAZ-HNO3属于正交晶系,Pnma空间群,晶胞参数a=1．2697（3）nm,b=0．8179（2）nm,c=1．1621（3）nm,V=1．2067nm^3,Z=4．DNAZ·HCl属于正交晶系,Cmc21空间群,晶胞参数a=0．6681（2）nm,b=1．0441（2）nm,c=0．9971（2）nm,V=0．6955nm^3,Z=4．用密度泛函理论方法对该二种化合物进行了几何优化和频率计算,获得分子结构、原子上Hirshfeld电荷、原子间Mayer键级和前沿轨道能量及组成．基于分子和电子结构信息从理论上解释了相关反应机理,并对两种化合物的热稳定性进行了比较．     

N-硝基-N,N′-二苯基脲衍生物的合成及抑菌活性

采用“一锅法”设计合成了9个N-硝基脲衍生物,收率50.2%-76.8%。通过红外光谱、核磁共振谱及元素分析等测试技术确证了它们的结构。初步杀菌活性测试表明,当浓度为50mg/L时,部分化合物对水稻纹枯菌具有较好的抑菌活性。     

蝎型钒氧苯甲酸配合物的合成、结构及量化计算

设计合成了两种以聚吡唑硼酸盐、苯甲酸为配体的钒氧配合物VO[HB(pz)3](pzH)(C6H5COO)(1)和VO[HB(3,5-Me2pz)3](3,5-Me2pzH)(C6H5COO)(2)((HB(pz)3: 聚吡唑硼酸钠盐; pzH: 吡唑; HB(3,5-Me2pz)3: 聚甲基吡唑硼酸钠盐; 3,5-Me2pzH: 3,5-二甲基吡唑). 通过元素分析、红外光谱和X射线单晶衍射方法对配合物进行了表征. 并结合从头计算结果进一步分析了配合物的稳定性及分子中配键的共价特征. 分析结果表明, 配合物2的稳定性大于配合物1, 中心钒原子周围的价键类型都属于共价键范畴, 键序分析结果与晶体结构测定的键长结果是一致的.     

有机分子偶氮苯在高岭石表面吸附研究

利用Gaussian 98软件,采用量子化学从头算计算方法,研究有机分子偶氮苯在高岭石表面的吸附作用.不同位置的吸附结果比较表明,吸附后体系稳定性强弱及电子发生转移的可能性大小依次是平行于硅氧烷表面、平行(010)面、平行[AlO4]八面体表面.芳香环上的π键和硅氧烷表面的O原子均相互作用,电子从偶氮苯上的C和N原子流向高岭石表面的O原子.对吸附复合物进行了X射线粉末衍射(XRD)、红外光谱(FTIR)测试及结构分析,结果表明,偶氮苯吸附到高岭石的硅氧烷表面.     

不饱和类碳烯H2C=CLiCI的构型及异构化的理论研

采用量子化学中的DFT理论方法，在B3LYP/6-311G*水平上全优化得到了不饱和类碳烯H2C=CLiCl的平衡结构。结果表明，不饱和类碳烯H2C=CLiCl只有2种平衡结构。对这2种平衡结构之间相互转化的过渡态进行计算，同时，采用统计热力学及过渡态理论，研究了2种平衡结构之间相互转化的热力学及动力学性质，进而讨论了2种平衡结构在不同温度下的稳定性问题，结果表明在所研究的100-600K温度范围内，只有一种平衡结构能够存在，在计算得到振动频率及吸收强度的基础上，模拟了稳定平衡结构的红外光谱图。