应用结构异质性阈模型定位阈性状基因位点:I理论研究(英文)

结构异质性是在定位阈性状基因位点过程中普遍存在的一个问题 .例如 ,数量遗传学家通常根据连锁分子标记推断性状位点基因型 ,由于性状位点基因型的不确定性 ,一个亲折方差组分被引入阈模型 .针对这个问题 ,我们提出了一个新颖的统计模型并推广到多阈值性状 .在这篇理论文章中 ,我们给出了详细的理论推导和计算策略     

基于全基因组的遗传性疾病和性状的关联位点分析

研究发现,通过全基因组关联分析,找出与疾病相关的位点或基因,对于人们防治遗传病,具有重要意义.首先,考虑固定效应(SNP位点)和随机效应(人群中的群体结构和亲缘关系),建立了混合线性模型,并且利用基于FDR标准的BH法对多重检验的P值进行校正,找出最有可能的致病位点.其次,利用Fisher的P值组合方法,将基因所包含的所有SNP位点组合,找出与疾病最可能相关的基因.由于遗传疾病可能与基因所包含的位点的子集关联,我们参考已有的ARTP模型,对模型进行了改进.最后,建立多表型联合模型MultiPhen找出与10个性状有关联的位点.     

基于组LASSO的重组近亲杂交合作小鼠基因位点定位研究

重组近亲杂交合作小鼠品系(CC-RIX)具有很多优点,特别是在复杂疾病的数量性状位点定位方面,具有较高功效.本文在现有研究基础上,考虑了仅含主基因效应的混合线性定位模型,并通过组LASSO惩罚函数法对问题进行转换,然后采用迭代加权最小二乘法对转换后的问题进行求解.从而克服了设计矩阵容易奇异,计算速度慢等计算上的难题.模拟计算表明,本文所提模型和方法在CC-RIX品系的数量性状位点定位中能快速、准确地识别出数量性状位点,并具有较高的真阳性率,以及较低的假阳性率.     

全基因组SNP交互作用中的基因型差异分析

为了描述基因型差异,本文从卡方检验入手求解相关度,并利用多位点连锁不平衡度,建立比较函数来区分个体差异;从1000人基因组计划数据库中收集了25个SNP位点,建立基于遗传算法改进BP神经网络进行人群分类,实现了输入某样本的SNP基因型,输出该样本的地区来源.     

食品卫生安全保障体系数学模型及改进问题研究

论文研究了食品卫生安全保障体系的数学模型,阐述了各种模型的建立方法.在建模过程中,探讨解决了一些改进模型的理论问题.主要工作包括:1、通过改进CAC食品分类标准,给出了一种有效的适用于抽样调查的食物分类方法,在此基础上建立了膳食模型;2、给出了污染物分布模型及建模方法,提出了一种由少量样本数据迭代地外推随机变量整体概率密度函数的算法,讨论了由不同区域的监测数据估计全国总体分布的问题,并给出了一种解决方案;3、建立了风险评估模型,探讨了输入数据不配套时,抽样调查数据的衔接问题.提出了一种新的污染物摄入量的99.999%的右分位点的估计方法.     

门限自回归模型条件异方差的Kolmogorov-Smirnov检验

门限自回归模型被广泛地用于许多领域，当建立或使用这类模型时，一个重要问题是需要知道是否存在条件异方差。在本文中，我们对这个问题提出一个非参数检验，检验的大样本理论被给出，我们还通过数值模拟研究了检验方法的有限样本性质。结果表示检验有好的功效。经验百分位点还被给出。     

基于固定效应的纵向数据分位点回归模型的参数估计及CDM和MSOM的等价性

研究了基于固定效应的纵向数据模分位点回归模型的参数估计及统计诊断问题.首先给出了参数估计的MM迭代算法,然后讨论了统计诊断中数据删除模型(CDM)和均值移模型(MSOM)的等价性问题,最后利用消炎镇痛药数据说明了方法的应用.     

运用基因型统计量对数量性状位点进行关联分析

随着基因分型技术的不断发展,遗传学家可以获得大量遗传标记的基因型和单体型数据,这为鉴定人类复杂疾病基因提供了前所未有的机会。当不能直接获得单体型数据时,可以使用基因型数据的统计方法来进行关联分析．使用基因型数据对疾病基因进行关联分析的统计方法可以扩充到定位数量性状位点（QTL）。本文扩充了对疾病基因进行关联分析的主成份分析统计量PG咒和熵统计量％。到数量性状,利用选择基因型对QTL进行关联分析。计算机模拟考察了两个统计量的I型错误率．基于10个遗传性血色病（Hereditaryhaemochromatosis）单体型频率的计算机模拟调查了两个统计量的统计功效．结果表明两个统计量PCTt和TGE可以有效地对QTL进行关联分析．     

相场模型的非光滑初值有限元分析

相场模型是一类新的相变模型，人们希望能够用它来逼近经典的Ｓｔｅｆａｎ型相变模型，因为对相场模型无论是理论分析还是数值模拟都比对经典模型相对容易的多。在本文中，我们试图通过数值试验来验证这一结果，为此我们给出了相场模型在非光滑初值情形下的有限元误差估计，和经典Ｓｔｅｆａｎ型模型在几种情形下的精确解。我们的数值试验表明：相场模型至少在一维和三维球对称情形是Ｓｔｅｆａｎ型问题的一个很好的逼近。     

ARCH模型及其应用与发展

本文介绍了计量经济学中近期发展较快而又极有应用前景的一类模型－自回归性异条件方差模型，并从经济意义和模型意义两个方面论述了该模型的基本思路。另外我们还给出了ＡＲＣＨ模型的若干种变形，并给出了一个物价指数模型分析应用的例子。最后还提出了未来在理论和应用方面值得进一步研究的方向。