寡肽Asterin B和C溶液构象的NMR研究1: ^1H NMR归属及构象特征

Asterin B和C是从紫菀中分得的两个寡肽, 本文利用2D-NMR技术归属了它们的^1H NMR谱线, 并讨论了它们的构象特征。为进一步采用NMR和分子动力学(MD)方法研究它们的溶液构象奠定了基础。     

NMR和肽在溶液中的构象

了解肽在溶液中的构象一直是多肽化学家们极感兴趣的一个研究领域,这是因为,肽在溶液中的构象同生物功能之间很可能存在着某种联系,而要了解这种联系,首先必须知道某个肽在溶液中的真实构象。但是,在NMR光谱产生以前,肽在溶液中的构象的研究一直停留在定性的水平上。直到六十年代,高分辨NMR     

采用动态NMR对8-C-glucosyl-prunetin构象研究

采用动态NMR方法,对从海南黄檀中分得的8-C-glucosyl-prunetin及其它7位 上羟基烷基化了的8－C苷异黄酮的构象进行了研究。结果表明,在8－C苷异黄酮中 ,当7位上羟基烷基化了时,由于1"-C(sp~3)-8C(sp~2)单键旋转受阻,产生两种构 象异构体。同时,借助分子力场（MM）计算方法,确定了8-C-glucosyl-prunetin 两种构象异构栓中的优势构象,即为1"-H与7－OCH_3位于同侧。由低能量构象转化 为高能量构象所需活化能为75.66 kJ/mol。这一结果与动态NMR实验计算的71. 48kJ/mol活化自由能数值相符。     

群多普利溶液构象的NMR研究

采用1D和2D NMR技术对血管紧张素转化酶抑制剂群多普利在CDCl₃溶液中存在的两种构象进行了结构解析, 并结合分子动力学和密度泛函理论方法对其进行了结构的几何优化和能量计算. 结果表明, 群多普利因分子中酰胺键的旋转而形成反式构象A和顺式构象B, 两种构象的能量差为6.35 kJ/mol, 且顺式构象为该药物的优势构象.     

寡肽Asterin B和C溶液构象的NMR研究 Ⅱ. NMR及分子动力学模拟

利用NMR和分子动力学方法研究了寡肽Asterin B和C的溶液构象。结果表明,Asterin B在溶液中形成了某种非氢键的转角结构, 并由残基间的疏水相互作用使整个分子具有两亲性, 这种结构特征可能和其生物活性有关。并进一步讨论了这种结构的形成在蛋白质卷曲的起始过程中的意义。而Asterin C在溶液中柔性较大, 存在多种构象的平均。     

寡肽Asterin B和C溶液构象的NMR研究 Ⅱ. NMR及分子动力学模拟

利用NMR和分子动力学方法研究了寡肽Asterin B和C的溶液构象.结果表明,Asterin B在溶液中形成了某种非氢键的转角结构,并由残基间的疏水相互作用使整个分子具有两亲性,这种结构特征可能和其生物活性有关.并进一步讨论了这种结构的形成在蛋白质卷曲的起始过程中的意义.而Asterin C在溶液中柔性较大,存在多种构象的平均.     

NMR测定生物分子的结构和构象

研究分子在溶液中的行为一事主要属于核磁共振波谱学的范畴。NMR可用来测定生物分子的一级结构,可是这一技术最大的用途是研究分子以至于大分子的构象。如分子结构已知,NMR研究工作的第一步也是最关键的一步就是归属全部谱峰。对于中等大小或更大分子的~1H谱说来,即使在高场谱仪上,某些部分仍然     

α-单取代环十二酮构象的研究

利用分子力学计算，单晶X射线分析和~1H NMR技术研究了α-单取代环十二酮 的构象。结果表明，它们的优势构象的环骨架仍是[3333]构象，而羰基则在2-C位 置上。在晶体中，它们的优势构象为α－角顺取代[3333]-2-酮构象，而在溶液中 则取α－角顺取代和α－边外取代[3333]-2-酮两种构象，且两种构象处于动力学 平衡之中，以α－边外取代[3333]-2-酮构象占优势。     

α，α'-顺式二取代环十二酮的构象

利用分子力学计算，1~H NMR，(13)~C NMR和单晶X射线衍射分析技术研究了α -α'-顺式二表明，它们的优势构象骨架仍是[333]-2-酮，在晶体和溶液中，它们 的优势构象均为。α-角顺，α'-边外构象．在溶液中，相同取代基的α，α'-顺 式二取代环十二酮存在两种互为镜象的[3333]-2-酮对映体构象，学平衡之中；不 同取代基的α，α'-顺式二取代环十二酮存在体积较大的基团为边外取代的[3333] -2-酮和角顺取代的[3333]-2-酮两种构象，两种构象也处于动力学平衡之中，以较 大基团为边外取代的[3333]-2酮构象占优势.     

α，α'-顺式二取代环十二酮的构象

利用分子力学计算，1~H NMR，(13)~C NMR和单晶X射线衍射分析技术研究了α -α'-顺式二表明，它们的优势构象骨架仍是[333]-2-酮，在晶体和溶液中，它们 的优势构象均为。α-角顺，α'-边外构象．在溶液中，相同取代基的α，α'-顺 式二取代环十二酮存在两种互为镜象的[3333]-2-酮对映体构象，学平衡之中；不 同取代基的α，α'-顺式二取代环十二酮存在体积较大的基团为边外取代的[3333] -2-酮和角顺取代的[3333]-2-酮两种构象，两种构象也处于动力学平衡之中，以较 大基团为边外取代的[3333]-2酮构象占优势.     

α，α-二取代环十二酮的构象

利用分子力学计算，1~H NMR和单晶X射线衍射分析技术研究了α，α-二取代 环十二酮的构象．结果势构象骨架仍是[3333]-2-酮，在晶体和溶液中，它们的优 势构象均为α-角顺、α-角反-二取代[3333于α-角反位，后上基团处于α-角顺位.     

稀土元素与二缩三乙二醇二甲醚配合物的合成、NMR及其构象研究

合成了15种新的镧系高氯酸盐和二缩三乙二醇二甲醚的配合物, 证明其组成为Ln(Clo4)3·EO3Me2ˉ5H2O(Ln=La-Lu, Y)。由于端基的改变明显影响配位能力, 因而引起配合物组成及物化性质等一系列变化。本文尝试以^1^3C NMR弛豫速率法获取直链聚醚配合物中的结构信息, 并探计其构象问题, 实验证明成配后配体采取全TGT构象。     

稀土元素与二缩三乙二醇二甲醚配合物的合成、NMR及其构象研究

合成了15种新的镧系高氯酸盐和二缩三乙二醇二甲醚的配合物,证明其组成为 Ln(ClO_4)·EO_3Me_2·5H_2O(Ln=La—Lu,Y).由于端基的改变明显影响配位能力,因而引起配合物组成及物化性质等一系列变化.本文尝试以~C NMR 弛豫速率法获取直链聚醚配合物中的结构信息,并探讨其构象问题,实验证明成配后配体采取全 TGT 构象.     

NMR研究cis-Pt(NH_3)_2(Guo)_2~(2+)的溶液构象

本文应用NMR研究了cis-Pt(NH_3)_2(Guo)_2~(2+)的溶液构象。通过质子—质子之间扭转角φ_(HH)计算发现:配位以后糖环的构象有~2E→~3E转变的趋势;C(4′)—C(5′)之间旋转仍主要采取gg构象。通过~1H—~1H NOESY分析,发现碱基构象在Anti-式优势的前提下,存在Anti-Syn-平衡。     

聚肽分子链构象转变研究

聚肽分子链在一定的条件下可发生右旋分子链构象与左旋分子链构象间的构象转变 .文中提出了一个有关这一现象的统计理论解释 ,理论包含了两个重要的参数γ、ρ .γ与右旋和左旋分子链构象间能量差别有关 ;ρ与在左旋分子链段中启始一个右旋构象的结构单元所需能量有关 .进一步考虑了体系中酸分子存在对构象转变的影响 ,以解释新近发现的聚肽左、右旋多重分子链构象转变现象 .此外 ,运用核磁共振 (NMR)手段还对这一现象做了进一步的研究 .通过与实验结果和文献中报告的数据比较 ,证明这一理论可以很好地解释聚肽分子链中发生的左、右旋分子链构象转变     

2－（1，11－十一亚甲基）－5－取代亚胺基－△^3-1,3,4-噻二唑啉的构象

用NMR分子力学计算和单晶X射线衍射的方法对2-(1，11-十一亚甲基)-5-取代 亚胺基-△^3-1，3，4-噻二唑啉（1）的构象进行了分析，结果表明，标题化合物 1的十二员环采取D4对称的[3333]构象，噻二唑啉环与十二员环近似平面几乎垂直 构成螺环，位于[3333]构象的一个角碳，亚胺基上的取代基对母体十二员环内架的 构象及^13C NMR化学位移影响极小。     

胃泌素有关肽溶液构象的2D-NMR研究

用2D NMR深入研究了五肽、四肽胃泌素在 DMSO 中的构象。利用 COSY 谱、Relayed-COSY 谱、DQF-J 分解谱和 NOESY 谱归属了全部共振峰。计算了肽键平面的Φ角、旋转异构体分布和旋转异构体之间自由能差。根据 NOESY 谱得到了距离约束条件。结合Φ角及旋转异构体分布, 推导出五肽胃泌素分子的构象膜型。结果表明, 五肽、四肽胃泌素在 DMSO 中以半角构象存在, 在其主要的旋转异构体中 Trp 的吲哚环和 Met 的 S 原子具有类似5,1-benzothiazocine 三维结构, 可能是具有生物活性的原因。     

细胞色素c咪唑配合物的~1H NMR归属及构象研究

咪唑细胞色素c(Im·cyt c)是碱式细胞色素c(cyt c)及细胞色素c蛋白分子折叠过程的中间体类似物.用二维核磁共振(2D NMR)方法完成了Im·cyt c的主链(Gly-29除外)和绝大部分侧链的质子共振峰归属.归属主要采用主链指向法(MCD)进行.由得到的NOE联结,确定了Im·cyt c的二级结构,阐明了轴向配体Met80和血红素Fe间Fe-S键的断裂以及Met80被Im取代所引起的蛋白三维构象变化.同cyt c相比,Im·cyt c中的50,60及70 s a螺旋存在较大构象变动;Tyr67-Asn70和Ile75-Thr78两个月β-turn已经消失 咪唑的配位也导致了部分氨基酸残基,尤其是血红素疏水腔附近如Trp59,Tyr67,Tyr74等残基侧链的空间位置相对变化     

基于D-Pro-Gly构象限制性模块拟肽的合成

设计了C-端和N-端二肽模块,通过液相合成法经DIC-HOBt缩合、混合酸酐缩合及脱保护等反应高效合成了含有构象限制性模块D-Pro-Gly内核、N-末端为伯胺、且能形成稳定β-转角结构的四肽系列化合物——H-Leu-D-Pro-Gly-Leu-OH,H-Leu-D-Pro-Gly-Val-OH和H-Leu-D-Pro-Gly-Val-OH,总收率分别为49.02%,40.13%和50.88%,其结构经1H NMR,13C NMR,ESI-MS和HR-MS确证。     

1,3-交替构象杯[4]芳烃-香豆素衍生物的合成

以对叔丁基杯[4]芳烃为原料,通过醚化、原位硝化、还原、缩合四步反应合成了三个新型的具有1,3-交替构象的杯芳烃-香豆素衍生物,其结构经1H NMR,13C NMR,IR和MS表征.