酵母蛋白质网络的动力学性质

蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA相互作用网络决定了细胞中各种关键功能的执行．基于芽殖酵母(budding yeast saccharomyces cerevisiae)的蛋白质-蛋白质相互作用网络数据和相关的实验文献，我们建立了调控细胞周期和生命周期(cell cycle and life cycle)的蛋白质网络，并利用离散模型研究了该网络的动力学性质，研究表明：细胞周期网络的动力学性质具有很强的稳定性，约94％的蛋白质初态将演化到对应于生物学G1基态的稳定态，使其成为惟一的全局吸引点；同时，绝大多数的初态的演化路径都通过由G1激发态到G1基态的细胞周期演化路径，使细胞周期路径成为全局性的“吸引”路径。     

Dynamical Analysis of Protein Regulatory Network in Budding Yeast Nucleus

Recent progresses in the protein regulatory network of budding yeast Saccharomyces cerevisiae have provided a global picture of its protein network for further dynamical research. We simplify and modularize the protein regulatory networks in yeast nucleus, and study the dynamical properties of the core 37-node network by a Boolean network model, especially the evolution steps and final fixed points. Our simulation results show that the number of fixed points N（k） for a given size of the attraction basin k obeys a power-law distribution N（k） χ k^-2.024. The yeast network is more similar to a scale-free network than a random network in the above dynamical properties.     

生物系统中的非线性现象

文章通过用非线性科学的基本概念与系统方法分析了芽殖酵母细胞周期网络的动力学行为，说明非线性科学在定量研究生命过程所可能起到的重要作用，同时说明非线性科学现有的分析手段在研究生命系统中的局限性．这样利用非线性动力学研究生物系统的动力学问题，不但可以为系统生物学的研究提供强大的数学工具，同时也可以推动非线性科学本身的发展．这项研究从另一个角度显示了交叉学科的生命力．     

封面说明

在芽殖酵母 (buddingyeastSaccharomycescerevisiae)的细胞周期过程中 ,大约 80 0个基因的表达水平有明显的变化 .是什么机制保证该过程中大量基因的准确调控 ,并顺利完成DNA复制 (S期 )、纺锤体 (spindle)的形成定位及有丝分裂 (mitosis)的复杂有序的细胞周期过程 ?北京大学理