基于分子对接和QSAR方法预测B-Raf II型抑制剂活性

B-Raf激酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用,已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标.新型高效B-Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域.本文以结构多样的B-Raf II型抑制剂为研究对象,联合应用分子对接和定量构效关系(QSAR)模型研究其定量构效关系去探讨抑制活性的起源.两个主题作为研究重点:生物活性构象和描述符.首先对分子对接方法(Glide、Gold、LigandFit、Cdocker和Libdock)进行准确性评价,后将研究的对象分子对接到B-Raf活性位点并获得生物活性构象.基于准确的对接结果,计算得到16个打分评价函数和21个能量描述符,以此构建定量构效关系模型. QSAR结果表明模型具有高度精确的拟合和强的预测能力(模型M1: r² = 0.852, r_(CV)² = 0.790, r_pre² = 0.864;模型M2: r² = 0.738, r_(CV)² = 0.812, r_pre² = 0.8605).同时探讨了对抑制活性有重要影响的描述符,结果表明打分评价函数(G_Score, -ECD, Dock_Score, PMF)与能量描述符(S(hb_ext), DE(int), Emodel)对抑制活性影响非常大.通过虚拟筛选和QSAR模型理论预测,一些新的具有潜在抑制活性的化合物作为B-Raf II型抑制剂被获得.上述信息对于进一步设计新颖高效的B-Raf II型抑制剂提供了有用的指导.     

双曲线成双 旋转表示来帮忙

在解有关反比例函数问题时,如果可以找到这样一个合适的点,这个点往往在坐标轴上,而且有垂直于(或者平行于)坐标轴的直线过此点.可设这个点的坐标,再根据题目中的等量关系,依次得到其他点的坐标,然后根据题目需要,将坐标转化为线段的长,从而得到线段之间的关系或者某些图形的面积,为问题的解答提供方便.这种先设某点坐标,然后逐一表示其他点的坐标的方法,叫旋转表示法.这种方法在解决两条双曲线问题中的应用十分广泛.本文以2010年中考试题为例,说明这种方法的应用,供同行参考.     

由“中点”的联想与思考

<正>线段的中点是一个比较特殊的点,初中几何中的很多知识点都是以此为基础展开的,如三角形的中线、垂直平分线、中位线等等.因此,中点的应用十分广泛,解答与之有关的试题的灵活性也很强,同时,这也是深受命题者青睐的原因所在.所以,探究、分析和解决与线     

抓住特征,破解“抛物线牵手图形变换”问题

大家知道,图形变换作为数学课程改革新增的内容,加强对这部分的学习,对学生具有重要的教育价值,有利于发展学生的空间观念.另外,二次函数在初中数学中占有十分重要的地位,所以二次函数的图象和图形变换相结合,综合考查同学们分析、综合、概括、逻辑推理、几何建模以及探究活动的能力,是各级检测中不可多得的好题.本文就以课本中的一道探究题为例,探讨关于这类问题的解法.