二酰胺吡啶修饰杯[4]芳烃与脂肪二羧酸主客体相互作用的理论研究

本文用分子力学和分子动力学方法对二酰胺吡啶修饰杯[4]芳烃与脂肪二羧酸的主客体相互作用进行了研究.     

α-氨基膦酸酯与N-氯乙酰基甘氨酸乙酯反应机理的研究

用MMX分子力学程序以及分子图形学方法对α-氨基膦酸酯与N-氯乙酰基甘氨酸乙酯反应的机理进行了探讨。结果表明,此类反应热力学因素不起主要作用,动力学因素起主要作用,取代基空间效应是影响反应历程的重要因素。     

新磺酰脲类化合物的合成、结构及构效关系研究（Ⅲ）──N－［2＇－（4，6－二甲基）嘧啶基］－2－甲酸乙酯－苯磺酰脲的晶体及分子结构

新磺酰脲类化合物的合成、结构及构效关系研究（Ⅲ）──Ｎ－［２＇－（４，６－二甲基）嘧啶基］－２－甲酸乙酯－苯磺酰脲的晶体及分子结构李正名，贾国锋，王玲秀，赖城明（南开大学元素有机化学国家重点实验室，南开大学元素有机化学研究所，天津，３０００７１）（南...     

有机金属化合物中二级化学键的理论研究（I）──β－氯乙烯基氯化汞中的共轭键及二级化学键

根据实验数据分析，指出标题分子中存在着包括Ｈｇ的空６ｐｚ轨道在内的共轭键。根据顺、反式分子间性质的差异，说明在顺式分子中能形成弱的二级化学键，而反式则不能形成。并应用ＭＮＤＯ方法对分子进行计算，结果证明上述结论正确。     

应用分子图形学、分子力学、量子化学及静电势研究农药分子结构与性能关系(Ⅸ)──结构参数及计算方法的选择对提高磺酰脲类除草剂活性预报准确性的影响

重点讨论对提高磷酰脲类除草剂分子活性预报准确性有明显影响的两方面因素──结构参数的选择和计算方法的应用．在选择结构参数时兼顾分子的局部活性基团效应和分子的整体性质，并运用了最优化计算方法──人工神经网络方法（ANN）．所得预报结果与实验值吻合较好（预测均方误差msc＝0．073），远优于多元回归所得的结果（msc＝0．82）．     

有机金属化合物中二级化学键的理论研究(Ⅴ)──二级化学键生成的分子力学研究

用分子力学方法对一些金属汞化合物进行了探讨和研究.通过与参考体系对比以及内旋转势垒计算的方式,说明了在诸如cis-ClHgCHCHCl(Ⅰ),o-C₆H₄HgCl₂(Ⅵ),Cl_Hg_CH₂_CH₂_CN(Ⅶa),Cl_Hg_CH₂_CH₂_C₆H₅(Ⅺa)分子中,非相邻的Cl,Hg原子间存在着弱相互作用.     

β-三氰基乙烯取代杯[4]吡咯与阴离子相互作用的密度泛函理论研究

采用密度泛函B3LYP方法对β-三氰基乙烯取代杯[4]吡咯主体分子及其与阴离子(F-、Cl-、CH3COO-、H2PO4-)形成的复合物进行研究。结果表明,β-三氰基乙烯取代杯[4]吡咯可与阴离子以分子间氢键相互作用形成复合物,并且其与阴离子结合能力大小的顺序为F-> CH3COO-> H2PO4-> Cl-,与实验结果基本一致;通过与杯[4]吡咯对比可见,强吸电子取代基的引入增强了主体分子对阴离子的结合能力。本文还从几何构型、振动光谱、NBO分析及前线轨道等方面来阐述β-三氰基乙烯取代杯[4]吡咯与不同阴离子氢键相互作用的本质以及吸电子取代基的引入对杯[4]吡咯与F-和Cl-之间主-客体相互作用的影响。     

酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用的分子模拟研究

采用MCCE, Autodock及密度泛函方法对酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用进行了研究. 计算结果表明, KARI活性位点中的Mg^2＋在活性位点残基的离子化状态、活性位点的静电性质以及与抑制剂结合等方面起重要的作用; 同时, 抑制剂在结合方式、前线轨道布居及静电势等方面与酶促反应中间体(HOIV)具有一定程度的相似性; 可电离的羧基是当前发现的靶向KARI抑制剂一个重要的结构特征, 进一步推广可认为潜在的抑制剂应该拥有可电离成负电荷的功能团. 在药物设计中考虑到以上结论, 将有利于发现和改造靶向KARI的抑制剂.     

应用分子力学、分子图形学以及量子化学方法研究 有机试剂结构及作用机理(Ⅰ)——吡啶偶氮及三苯甲烷类显色试剂的构象问题

应用分子力学方法研究有机试剂尚少见诸报道.由于这类分子培养单晶比较困难,实验几何参数不多;且有机试剂分子与金属离子是在一定pH值的溶液中进行反应,因而溶液中的构象可能与晶体中的分子有所不同,如何了解这种结构上的差异,对于研究有机试剂的性能和作用机理有着重要的意义.本文应用分子力学及分子图形学方法,对吡啶偶氮类型以及三苯甲烷类型有机显色试剂的构象问题进行了探讨.     

开链烷烃13C化学位移统计分析

将开链烷烃的¹³C化学位移与分子中¹³C核邻近原子上的电子集居数及¹³C原子的局部空间能相关联,对14个典型烷烃分子中的72个碳原子的数据用逐步回归方法进行处理,所得结果表明:¹³C化学位移与上述诸因子间存在明显的线性关系.72个碳原子的¹³C化学位移预报值的均方根偏差为0.835ppm,最大偏差为2.232ppm.