应用分子图形学、分子力学、量子化学及静电势研究农药分子结构与性能的关系(Ⅲ)——一种获得有机分子优势构象的简单方法

通常可采用分子力学计算来得到有机分子的优势构象,但平常使用分子力学程序,由优化分子的构象得到的优化能,往往并不是分子的最低能量,而与分子的最初输入构象有关,是分子的初始输入构象附近的极小值,这给实际应用带来了困难.目前较为常规的求分子最优几何构象的方法是统计方法(Monte Carlo方法),通过模拟退火(The Simulated Annealing)来处理.开始“温度”较高的分子位于能量较高的位置上,这时分子的构象处于少数几个极小区     

“分子轨道对称守恒原理”的自由电子模型

近十多年来,“分子轨道对称守恒原理”在化学上的应用日益广泛。目前国际上关于这方面的理论主要有:“能量相关理论”,“前线分子轨道理论”以及“芳香过渡态理论”。它们讨论的是协同反应的选律,结论基本一致。我国科学家唐敖庆对这三个理论有明确的评价,并在理论上有新的发展。     

用分子动力学模拟方法研究磺酰脲化合物在溶液中构象的变化

农药化合物通常在溶液中起作用 ,由于溶剂的作用 ,其结构与在固体状态下有很大不同 ,因此研究农药化合物分子在溶液中结构的变化 ,对于了解农药作用机理以及与受体的相互作用是非常有意义的 .磺酰脲是一种超高效低毒 ,有着重要用途的除草剂 ,因而得到了广泛的应用与研究 .我们曾对其结构与性能的关系进行了系统的研究 ,并在此基础上建立了一个能解释若干实验规律的初级作用模型 [1] .但是以往有关结构的研究都是针对晶体和真空中的自由构象进行的 .由于在实际溶液中的结构情况会有所不同 ,因此 ,研究分子在不同溶液中的行为具有十分重要的意…     

应用分子图形学、分子力学、量子化学及静电势研究农药分子结构与性能关系(XI)──抗植物病毒病药物──胡椒醛肟醚基-4-喹唑啉的结构特征

测定了标题化合物的晶体结构,它是由2个相似结构的化合物分子组成.晶体属单斜晶系,空间群为P2₁,晶胞参数:a=0.8431(3)nm,b=0.7297(1)nm,c=2.1880(7)nm,β=100.90(3)°,V=1.322(1)nm₃,Z=2.应用分子力学程序MMX及逐步旋转单键法探讨了它的构型和其它可能的优势构象.还应用MNDO方法计算了电荷分布及CNDO/2方法计算了静电势.结果表明,在该化合物中存在3个明显的负电区域,此结构与活性密切相关.     

杯[4]吡咯在不同溶液中的分子动力学模拟研究

运用分子动力学(MD)模拟方法对杯[4]吡咯与不同溶剂之间的相互作用能、杯[4]吡咯在不同溶液中的构象变化以及杯[4]吡咯与溶剂分子之间的氢键相互作用进行了计算研究.模拟发现,杯[4]吡咯与不同溶剂间的相互作用能受溶剂分子偶极矩和杯[4]吡咯-溶剂分子间氢键相互作用影响.杯[4]吡咯在不同溶液中的构象发生翻转的主导因素是杯[4]吡咯与溶剂分子间形成氢键相互作用,溶剂分子的偶极矩不是杯[4]吡咯发生构象转化的主要因素.     

2-乙酰基-5-甲基-1,2,3-二氮磷杂环戊二烯同丙炔醇反应研究

用付里叶变换红外光谱及³¹PNMR,探索了2-乙酰基-5-甲基-1,2,3-二氮磷杂环戊二烯同丙炔醇的动态反应过程,推测了可能的反应机理,并通过对二配位磷化物对应的三配位磷化物(2-乙酰基-3-氯-5-甲基-1,2,3-二氮磷杂环戊烯)同丙炔醇反应的研究,验证了二配位磷化物反应机理的可能性。