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61.
环多肽晶体的浮动电荷极化力场模拟   总被引:2,自引:0,他引:2  
张强  张霞  杨忠志 《物理化学学报》2006,22(10):1243-1247
利用原子键电负性均衡结合分子力场方法(ABEEM/MM)对五种环多肽晶体进行了研究. 与传统力场相比, 该方法中的静电势包含了分子内和分子间的静电极化作用, 以及分子内电荷转移影响, 同时加入了化学键等非原子中心电荷位点, 合理地体现了分子中的电荷分布. 相对其他极化力场模型, 具有计算量较小的特点. 该模型下计算得到的环多肽分子单元相对实验测得的结构的原子位置、氢键长度和二面角的均方根偏差分别为0.009 nm、0.013 nm和5.16°, 能够很好地重复实验结果. 总体上, 其结果优于或相当于其他力场模型, 适用于对实际蛋白质体系的模拟和研究.  相似文献   
62.
盐酸拓扑替康与人血清白蛋白的相互作用及分子模拟   总被引:4,自引:0,他引:4  
用荧光光谱法、分光光度法研究了盐酸拓扑替康(topotecan hydrochloride, 简记为THC)与人血清白蛋白(human serum albumins, HSA)的相互结合反应. 计算了反应的结合常数、结合位点数和热力学常数. 盐酸拓扑替康在人血清白蛋白上的结合位置与色氨酸残基间的距离为3.63 nm. 分子模型研究表明, 盐酸拓扑替康与人血清白蛋白的亚结构域IIA结合, 二者间的作用力主要为疏水作用, 此外, 蛋白质的丙氨酸(Ala-291)残基和天冬氨酸(Asp-256)残基与盐酸拓扑替康之间还存在氢键作用力.  相似文献   
63.
Divinylbenzene-80 (DVB-80) and polar monomer acrylic acid (AA) having hydrogen bonding at a total monomer loading of 5 vol% were precipitated-copolymerized in a variety of organic solvents with 2,2'-azobis(isobutyronitrile) (AIBN) as initiator. The experiments were investigated from a two-dimensional matrix, i.e., the actual crosslinking degree of DVB varying from 0 to 80% and the solvent composition varying from 0 to 100% of toluene mixture with acetonitrile, when the mixture of acetonitrile and toluene was used as the reaction solvent. Under various reaction conditions, six distinct morphologies including soluble polymers, swellable microgels, coagulum, irregular microparticles, and nano-/micrometer microspheres were formed and the structures of these polymer architectures were described. A morphological map was utilized to discuss the effects of both crosslinking degree of DVB and composition of solvent on the transitions between morphology domains. The results demonstrated that the microspheres are formed by an internal contraction due to the marginal solvency of the continuous phase and the crosslinking of the polymer network through the covalent bonding from DVB as well as the interchain hydrogen-bonding between the carboxylic acid units.  相似文献   
64.
{[Cu^Ⅱ(Hpb)(mal)]H=O}n (Hpb=2-2'-pyridylbenzimidazole, mal=maleic acid) is a helical chain-like polymer complex. In order to investigate the electronic structure of the complex, the monomer Cu^Ⅱ(Hpb)(mal) was obturated with different functional groups respectively. For these selective segments, the geometry optimizations were conducted by using hybrid DFT (B3LYP)methods to find that the structure obturated with H2O was better consistent with the experiment, and then this model would be used to latter calculations, such as the frontier molecular orbital and the NBO charge population analysis. In addition the magnetic behaviors of this complex were analyzed by experiments and the weak antiferromagnetic couple between copper(Ⅱ) ions was observed. The exchange coupling constant was calculated by DFT based on the spin broken symmetry formalism. The calculated coupling constants were in good agreement with the experimental data.  相似文献   
65.
无机盐对正负表面活性剂混合体系性质的影响   总被引:4,自引:0,他引:4  
用滴体积法测定了四种离子强度下(μ=0.02, 0.05, 0.1, 0.2 mol·kg~(-1), 支持电解质为NaBr)C_(12)H_(25)SO_4Na/C_6H_(13)(NC_5H_5)Br混合体系在五种比例(10:1, 3:1, 1:1, 1:3, 1:10)时的临界胶团活度cma(25 ℃). 提出了无机盐对正负表面活性剂混合体系临界胶团活度的影响程度的计算式.  相似文献   
66.
希土离子(Ⅲ)与牛血清白蛋白的相互作用   总被引:7,自引:0,他引:7  
在pH,6.30,37℃条件下,用离心超过滤法测定了11种希土离子(Ⅲ)与牛血清白蛋白(BSA)的专一性结合常数K3和非专一性结合常数Kns。并通过CD,UV,IR和荧光光谱研究了Tb(Ⅲ)和Eu(Ⅲ)与BSA作用的机理。结果表明,K3和Kns分别与希土离子(Ⅲ)和二元,一元羧酸形成配合物的稳定常数随希土系列原子序数的变化规律相一致。结合部位分布在BSA的亲水性表面,参与配位的基团只有谷氨酸,...  相似文献   
67.
利用PCR方法对锌指蛋白ZNF191(243~368)的Ile323和Arg327进行定点突变, 成功地获得了突变体蛋白ZNF191(243~368) I323W和R327W; 并利用荧光光谱研究了锌指蛋白和它的突变体蛋白ZNF191(243~368)I323W和ZNF191(243~368) R327W与寡聚核苷酸的相互作用. 以溴化乙锭(EB)为荧光探针, 考察了I323W和R327W的突变对锌指蛋白ZNF191(243~368)结合寡聚核苷酸的影响.并计算了锌指蛋白突变体I323W和R327W与DNA的结合常数KZ. 讨论了可能的结合模式.  相似文献   
68.
TiO2 has been tested to be toxic to DNA under the photo-irradiation of ultraviolet A (UVA). However, in the dark conditions, after several days of treatment with TiO2 in aqueous solution, the interaction between TiO2 and two types of DNA was detected and the mechanisms were studied by the methods of gel-electrophoresis, IR spectroscopy and TEM. The results showed that the DNA would be bound to TiO2; the ratio of binding was related to the concentration and the treating time; the mechanism of binding is related to phosphate groups of DNA. Besides, DNA with different structure showed different degree of binding. These findings showed a new possible way through which the TiO2 nanoparticles interact with DNA.  相似文献   
69.
所有真子环都同构的结合环,称为内同构环,任两不同的子环都不同构的结合环,称为内异环.本文目的是给出内同构环与内异环的一些结构定理,从而基本上解决了Szasz F.A.提出的问题81:怎样的结合环,它的不同子环总不同构?  相似文献   
70.
研究了甲基丙烯酸八氟戊酯单体及其与乙烯基咪唑共聚物的合成与表征 ,以及该共聚物与氧载体钴卟啉配位复合物的氧结合性能 .共聚物分子量和乙烯基咪唑含量分别由GPC和元素分析方法测定 ,结果为5 0× 10 4 和 2 5mol % .共聚物中的咪唑基与钴卟啉在溶液中配位 ,复合物具有快速、可逆的氧结合特性 .溶剂对复合物的氧结合性能影响较大 ,复合物在四氢呋喃中的氧结合亲合力大于在N ,N 二甲基甲酰胺中的亲合力  相似文献   
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