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991.
在启发式亲脂势HMLP(heuristicmolecularlipophilicitypotential)的基础上提出了分子、分子片段和原子的亲水指标和亲脂指标.计算出了20个天然氨基酸侧链的亲水、亲脂指标和亲水、亲脂表面积,并用线性自由能函数表达氨基酸侧链的溶剂化自由能,?Gsol,=b0 b1Li b2Hi b3Si b4Si.应用线性自由能函数和氨基酸侧链的亲水和亲脂! -i指标,计算了20个氨基酸残基的3种相转移自由能(蒸气-水、蒸气-正辛醇、正辛醇-水)和正辛醇-水分配系数logPow,取得了与实验值高度一致的良好效果.HMLP的亲水和亲脂指标是HMLP的指标化,扩展了这一方法的使用范围.氨基酸侧链的亲水、亲脂指标和线性自由能函数有望用于生物大分子受体与配体的结合自由能的估算、蛋白质的结构与功能、蛋白-蛋白相互作用和识别的研究. 相似文献
992.
在Hellmann-Feynman(H-F)力的计算和分解基础上,依据静电力平衡原理,探讨了氟化氢分子中电荷分布的特点,论述了分子形成过程中氟的内层1s电子和2p_π电子运动状态的改变.依据H-F力,建议了划分重叠集居数的方法,以氟化氢和氟化锂为例,讨论了极性键和离子键的特性和区别.把H-F力用于张力分子的研究,提出了计算键弯曲角的方法,定义了弯键和张力分子的胁变能,并计算出环丙烷的C—C键弯曲角为22.32°,弯键的胁变能为0.4181a.u. 相似文献
993.
掺杂Ti02的光催化性能研究进展 总被引:16,自引:0,他引:16
本文综述了掺杂TiO2在可见光范围的内应及其光催化性能的研究状况,讨论了掺杂金属离子的种类、浓度、光催化剂的粒径以及其它因素对TiO2光催化活性的影响。列出了掺杂TiO2的制备方法,并对今后的研究作了展望。 相似文献
994.
995.
本文报道了在Ca(NO3)2溶液中,氧化铝的水悬浮液的电位滴定数据,根据实测表面电荷密度与理论计算值的比较,认为在界面上生成了络合物(S-O)2Ca。电位滴定是在Ca(NO3)2浓度0.0033、0.033、0.33mol/L下进行的,并由此测定了在氧化铝/水界面上三层模型的参数。利用所得参数,计算了表面电荷、电势及各表面组分的浓度随Ca(NO3)2浓度和pH的变化,并将此结果与在NaNO3溶液中的进行比较。结果表明,在Ca(NO3)2溶液中比在NaNO3溶液中,PZNPC向低pH值移动,从7.4降到6.8。 相似文献
996.
依据氨基酸残基的相关性预测蛋白质的结构类型 总被引:2,自引:0,他引:2
作为蛋白质的建筑构件,各种类型的蛋白质的20种氨基酸残基之间存在着特定的相互关联,反映了氨基酸残基之间的制约性,并有深刻的物理和化学的内在因素.某些氨基酸残基对之间的相关系数可以作为一种类型的蛋白质区别于其它类型蛋白质的特征,用于蛋白质结构类型的预测.研究了4种类型的蛋白质204个样品的氨基酸残基对的相关性系数,找出了可作为蛋白质结构类型特征的氨基酸残基的相关对,并用于蛋白质结构类型的预测,对于α型、β型、α/β型和α+β型蛋白质的204个蛋白质样品的交叉测试,正确率分别为94%、89%、79%和89%,平均为88%,高于简单距离法和欧几里德距离法. 相似文献
997.
选用Gaussian03的B3LYP/6-31G(d,p)、DMol3的BLYP/DNP和deMon的BLYP/TZVP等方法计算了甲烷水合物(结构-1)中平面五元水分子簇的结合能和氢键能,作了基组重叠误差(BSSE)和色散能(dispersion)的修正,估算了次级相互作用的贡献.在DMol3程序中使用了大型数值基组DNP,将基组重叠误差降至最低.在Gaussi-an03的B3LYP/6-31G(d,p)计算中,采用平衡法(Counterpoise)校正基组重叠误差.两种计算方法给出了一致的结果,证实了在使用6-31G(d,p)基组时,一对水分子在平衡距离的基组重叠误差高达8 kJ/mol.为估算色散能的贡献,使用了新近发展的包含色散能的密度泛函的DFT程序deMon计算了五元水分子簇.用多种方法计算出了经基组重叠误差和色散能修正的五元水分子簇的分子间结合能和氢键能的较为精确的势能超曲面,为甲烷和其他气体水合物的分子动力学模拟提供了依据. 相似文献
998.
999.
1000.
甲烷水合物分子间势能的量子化学研究 总被引:1,自引:0,他引:1
用Hartree-Fock SCF和密度泛函(BLYP,B3LYP,MPW1PW91)方法对以结构-Ⅰ为单元的甲烷水合物进行了分子间势能的理论研究.该结构单元为正十二面体,其中包括20个水分子,甲烷分子在其中心.采用从头算HF/6-31G(d,p)对甲烷分子进行几何优化,采用ST2模型对水分子作几何优化.水-水间氢键势能Ehb(l)和水-甲烷间范德华势能Evdw(l)作为边长l的函数进行计算,计算时固定水和甲烷分子的几何形状.所有计算中均使用6-31G(d,p)基组.基组重叠误差(BSSE)经校正其上限和下限为水-水氢键能加以确定.由B3LYP经基组重叠误差(BSSE)校正得到的O—O距离为RO—O=0.280 nm,C—O距离RC—O=0.392 nm,比其他方法更接近实验值的0.282和0.395 nm.结果表明,在天然气水合物结构-Ⅰ中水-水分子对的氢键能(30~36 kJ/mol)大于水的二聚体(H2O)2氢键能(-22.6±2.9)kJ/mol,亦大于六角形冰的(-21.7±0.5)kJ/mol,十二面体结构为一稳定单元.以上分子间相互作用势能的结果为得出Lennard-Jones和Kihara势能参数提供了坚实的基础,此参数对分子动力学模拟天然气水合物是非常有用的. 相似文献