脱氧核糖核酸的毛细管无胶筛分电泳迁移规律研究

本文研究了不同因素对脱氧核糖核酸(DNA)毛细管电泳迁移行为的影响.采用毛细管无胶筛分电泳法,对不同片段长度DNA进行分离检测,考察DNA片度长度、电场强度、聚合物浓度及分子量等因素对DNA迁移行为的影响.实验结果显示,DNA迁移时间随其长度的增加而延长;电场强度越高,DNA迁移时间越短,分离效果变差;DNA在高浓度聚...     

无胶筛分毛细管电泳分析几百个碱基对核酸的条件优化

通过正交设计实验综合分析了内充羟丙基甲基纤维素（ＨＰＭＣ）无胶筛分毛细管电泳中的分离场强、ＨＰＭＣ浓度、柱长度和柱内径对核酸分离的影响。结果表明,柱长度越长、柱内径越小、分离场强越小,分离效果越好。考虑实际情况,为能在短时间内使几百个碱基对的核酸得到有效分离,一般选择３７ｃｍ×７５μｍｉ．ｄ．的涂壁毛细管、柱内质量浓度为８ｇ／Ｌ的ＨＰＭＣ、场强为３２４Ｖ／ｃｍ的条件,并在此种条件下分析了ＡｐｏＢ１００基因的低浓度聚合酶链式反应（ＰＣＲ）扩增产物（７１０ｂｐ）。     

用于毛细管电泳DNA分离的合成聚合物*

毛细管电泳的无胶筛分方法在DNA片段分离、DNA 测序方面取得了显著的成绩并已成功应用于人类基因组计划.该法是在毛细管柱中充入一定浓度和组成的线性高分子溶液,利用其对样品组分电泳迁移时的阻滞作用,按分子量大小对DNA等生物大分子进行筛分分离分析.因此,聚合物筛分介质的类型、组成和性质会显著影响分离效果.近年来,由于受到基因组计划的影响,出现了许多用于DNA片段分离和DNA测序的水溶性高分子聚合物,并取得很大进展.本文按照均聚物和共聚物的分类,综述了作为筛分介质的各种合成聚合物及其应用效果,并简要介绍了有关的筛分理论和分离的评价指标.     

毛细管电泳检测神经细胞凋亡

建立了毛细管电泳检测凋亡细胞DNA片段的方法.以DNA相对分子质量标准品为溶质,考察了分离条件(电压、进样时间、温度、聚合物浓度)对分离的影响.在优化条件下,利用毛细管无胶筛分电泳对缺氧缺血过程中不同时间点神经PC12细胞DNA片段进行了分析,并与流式细胞仪结果比较,研究缺氧缺血时胶质细胞凋亡过程.     

含有金纳米粒子的筛分介质对不同长度DNA片段的毛细管电泳分离

探讨了含有金纳米粒子(GNPs)的筛分介质在毛细管电泳(CE)中对不同长度DNA片段的分离.以聚环氧乙烷(PEO)-金纳米粒子(GNPs)-TBE为CE筛分介质,用涂层的毛细管柱(37 cm×75 μm,有效长度27 cm)分离DNA Marker D和1 kbp DNA Ladder Marker标准DNA片段,考察了CE过程中各参数(如筛分介质质量浓度、分离电压、温度和筛分介质pH值)对不同长度DNA片段分离的影响.对比了新型筛分介质与不含GNPs的PEO-TBE筛分介质的分离效果,并将新型筛分介质用于实际样品的检测.结果表明,在筛分介质中添加GNPs后能够改进CE的分离效果,且分离时间短.方法较适于分离较宽范围的DNA片段.     

羟乙基纤维素中毛细管电泳DNA分离特性研究

本实验以羟乙基纤维素(HEC)为筛分介质,以100～1500 bp DNA ladder为分离对象,系统地研究了直流电场下毛细管电泳时DNA分离特性.论文考察了DNA迁移淌度及分离度随HEC溶液浓度和分子量、毛细管两端电场强度(E)、毛细管有效长度(le)及其内径形状、背景电解液(BGE)温度等因素变化规律.研究发现:(1)当筛分介质HEC浓度高于其阈值浓度c*时,HEC分子量越大,相邻DNA片段之间淌度差越大,HEC浓度越高,其迁移淌度越低;(2)对于相邻的DNA片段,le在一定范围内,其分离度随le增大而线性升高;(3)毛细管有效长度一定时,DNA淌度随毛细管侧面积与截面积之比R增大而升高,分离效率提高;(4)BGE温度升高,DNA在筛分介质中扩散效应增强,迁移淌度变大,相邻DNA片段间分离度减小.根据以上结论,在直流电场下毛细管电泳φ×174-Hirc II限制性酶切片段,并实现了其高分离度、快速分离.     

毛细管电泳无胶筛分介质分离DNA的机理

快速、高效而灵敏的分离技术对于DNA的分析是至关重要的.使用无胶筛分介质的毛细管电泳是最重要的DNA分离技术之一,通常使用无交联的高分子溶液作为无胶筛分介质.本文在介绍高分子溶液理论的基础上,综述了DNA在毛细管电泳无胶筛分介质(缠结溶液和稀溶液)中的分离机理,主要包括Ogston筛分模型、各种修正的爬行模型、瞬态缠结偶合机理及其改进机理等.     

样品稀释对毛细管电泳分离检测DNA片段的影响

通过理论推导和实验验证表明;适当稀释DNA样品溶液,采用流体力学进样或电动进样都不会较大地减低峰高,而DNA片段毛细管电泳的分离效率和分离度还能有所提高。采用稀释样品的方法可提高DNA样品的使用效率。采用羟乙基纤维素无胶筛分介质分离了DNA片段。用激光诱导荧光（氩离子激光器,488nm）电荷耦合器件检测。用低浓度的筛分介质（0．4％）分离了分子质量较大的ADNA－HindⅢ全部8个片段（12bp～23130bP）。用高浓度的筛分介质（1．6％）分离分子质量较小的pBR322－HaeⅢ22个片段（18bp～587bp）。     

线性聚丙烯酰胺和聚乙烯吡咯烷酮准互穿网络聚合物溶液用于毛细管电泳紫外检测条件下分离DNA片段的深入研究

线性聚丙烯酰胺(PAA)和聚乙烯吡咯烷酮(PVP)准互穿网络(quasi-IPN)聚合物溶液被成功用于毛细管电泳紫外检测条件下分离双链DNA片段 (对123bp/124bp片段的分离度为0.76)和单链DNA片段(对123b/124b片段的分离度为0.97). 该quasi-IPN筛分介质粘度小（在25^oC 时的粘度为23.5mPa·s）且温度升高粘度下降. 该筛分介质具有动态涂敷能力可直接用于非涂层毛细管柱。根据实验结果，柱温和电场强度会明显影响DNA片段在该介质中的迁移行为。在变性条件下，最长片段为1353碱基的单链DNA样品可以在40分钟内获得分离，其中309/310b 片段的分离度为0.88。     

毛细管电泳紫外检测条件下单碱基分离DNA片段

合成了一种水溶性聚合物,聚N,N-二甲基丙烯酰胺(PDMA)和聚乙烯吡咯烷酮体系(PVP),并用于DNA分离.优选该体系溶液含量为2.0% PDMA+2.0% PVP,在紫外检测的条件下,对标准DNA酶切片段pBR322/Hae Ⅲ样品进行分离,其中123/124碱基对的分离度(R_s)为0.72.加入甲酰胺(φ≥0.10)对DNA样品进行去活处理后,该体系亦能对单链DNA片段中的123/124进行分离,分离度(R_s)为0.75.实验还显示进样时存在浓缩效应.本体系粘度较小,筛分能力强,具备芯片毛细管DNA分离介质的潜力.