用于饱和链烃类化合物的结构/性质相关性研究的一种新的拓扑指数

分子的结构决定分子的性质 ,从分子结构提炼出的结构信息进行数值化即得到分子拓扑指数。用拓扑指数来进行定量结构 活性相关性(ＱＳＡＲ)以及定量结构 性质相关性 (ＱＳＰＲ)研究是目前非常活跃的领域。到目前为止 ,已相继提出1 2 0多种拓扑指数[1] 。利用这些拓扑指数来讨论饱和链烃类化合物的性质已经得到了许多有益的结果[2 ] 。本文利用距离矩阵和邻接矩阵 ,提出了一种新的拓扑指数Ｚｈ,对饱和链烃类化合物的性质进行预测和预报 ,结果表明 ,这种拓扑指数具有良好的结构选择性和性质相关性。1　方法以 2 甲基丁烷为例 ,其隐氢图为 :其…     

一种新的分子拓扑指数

本文同时以分子图的距离矩阵和邻接矩阵为基础，提出了一种新的表征有机化合物结构特征的拓扑提数Ｘｚｏ对２－９个碳原子饱和烷烃共７４个分子的计算结果表明，与现有的一些拓扑指数相比较，该指数具有较好的结构选择和性质相关性。     

一个新的分子结构型拓扑索引

描述了一个既具有极低退化度, 又与物性有较好关联的新的分子结构型拓扑索引. 由于基于分子图的邻接矩阵和距离矩阵的信息都包含在这一拓扑索引中, 因此是以不同方式处置邻近顶和非邻近顶. 这样, 索引有很少退化, 同时能很好地与物性相关, 当然, 由于忽略了分子结构的次级信息, 还不可能准确地予测分子的性质.     

拓扑量子方法及其在含C＝O和N＝O化合物性能估算中的应用

综合量子化学与拓扑化学知识, 提出了构建Y＝O (Y表示C, N)键拓扑量子键邻接矩阵的方法. 利用该矩阵特征根和量子化学原理, 计算了表征分子轨道能量、原子电荷和键级等的拓扑量子参数. 将这些参数对含C＝O, N＝O基团的有机分子的紫外吸收能量、红外伸缩振动频率和醛酮C＝O上的亲核加成反应速率等性质进行定量结构-性质相关, 得到的模型均具有良好的估算能力.     

拓扑指数F'与烷基苯标准生成焓相关关系研究

新建议的拓扑指数F'考虑了分子的图形特征,顶点原子的性质,顶点原子与相邻原子的键合情况,并以矩阵的形式把这些特征表达出来。n个原子构成的体系通过矩阵运算可得到包含n项的多项式,其中,每一项对应一个顶点原子对F'的贡献,从而赋予了拓扑指数F'明确的物理意义。用F'研究一些烷基苯的标准生成焓,得到了令人满意的结果。     

Hückel理论中前线分子轨道能量的计算

本文应用变分原理,从邻接矩阵的逆矩阵出发,给出了Huckel矩阵最小本征值(绝对值)的计算方法.本中说明了利用图的直观特征计算逆矩阵的简便原则和选择试探函数的依据。 在上述方法的基础上,给出了一些共轭分子同系列最小本征值的近似计算公式,它们具有封闭的拓扑参量形式,适用于同系列的任一分子.用这些公式对大约80个分子作了数值计算,绝对误差平均小于0.003(单位β)。     

一个新的拓扑指数用于有机化合物的QSPR/QSAR研究

在分子图的邻接矩阵和距离矩阵的基础上提出了一个新的拓扑指数Xu,该拓扑指数易于计算,对C~2-C~1~6饱和烷烃有较高的结构区分能力,通过适当的处理可方便地推广到含多重键杂原子体系。该指数与饱和烷烃的正常沸点等理化性质,不饱和链烃类化合物的热容以及某些脂肪醇的毒性和疏水性参数均具有较好的性质相关性。绝大多数理化性质与Xu指数均能建立简单线性模型,且相关系数均大于0.99,表明该指数有望在QSPR/QSAR研究中作为一个新的参数而获得推广应用。     

脂肪醛和脂肪酮的沸点与分子结构关系的拓扑化学研究

根据分子拓扑学原理,通过采用信息量丰富的染色分子图代替隐氢图,借助于距离矩阵表征分子图中顶点的连接性和标识分子图中顶点性质的差异,发展了一种适用于含杂原子分子体系结构性能研究的新方法,据此探讨了脂肪醛和脂肪酮的沸点与分子结构之间的关系,提出一个既能合理表征结构性能关系、又能预测沸点的定量关系式。结果表明,沸点预测值与实验值的一致性令人满意,平均误差0.21%。     

脱氧异氢化青嵩乙素的晶体结构测定

脱氧异氢化青蒿乙素的晶体属于单斜晶系,空间群为P2_1,晶胞参数α=16.262,b=8.304,c=10.679A,β=108.08°,晶胞内分子数Z=4,D_c=1.519g·cm~(-3)。用MULTAN-78测定其分子粗结构模型,通过块对角矩阵最小二乘法进行修正,最后R=0.073。根据原子在三维空间的分布,确定分子中两个六元环为顺式联接,结构如下式所示:     

取代1-氯蒽醌中分子内卤键的电子密度拓扑分析

运用量子化学密度泛函B3LYP方法,在6-311＋＋G（d,p）基组水平上对邻位和间位取代1-氯葸醌的分子内卤键进行了研究．用电子定域函数和“分子中的原子,,理论对分子内卤键的性质进行了电子密度拓扑分析．通过对计算得到的密度矩阵进行σ-π兀分离,得到了π-键的键径和分子图,并讨论了。电荷密度和兀电荷密度对卤键的影响．结果表明,键鞍点和环鞍点处的电子密度拓扑性质均可作为衡量分子内卤键强度的量度．键鞍点和环鞍点处的电荷密度P越大,键鞍点与环鞍点的距离越大,卤键强度越大．除σ电荷密度外,π电荷密度对分子内卤键的性质也有明显影响．     

原子簇与有关分子的结构规则 Ⅱ.在原子簇化学中的应用

因为对于三片分子,c 最多等于1,故π=6,即 Re_3三元环之间应以三重键相结合,如2式所示,式中 R 代表 CH_2SiMe_3。X 射线结构分析证明三个 Re 原子居于正三角形的顶点,键长特别短,只有2.387(?),而Re 原子的共价单键半径 R_(cov)=1.55(?),金属铼中 Re—Re 键长为2.74(?),由此可见判定此分子中 Re 原子之     

分子连接性指数(mZh)与烷基苯理化性质的相关性研究

定义有机物分子中成键原子点价δiz.基于δiz和分子图的邻接矩阵,建构一种新的分子连接性指数mZh(m=0,1),并研究了0Zh,1Zh与烷基苯的燃烧热、等张比容、沸点、汽化热、标准生成自由能、标准熵、摩尔体积、溶解度、正辛醇/水分配系数等10种物理化学性质的相关性.结果表明:0Zh,1Zh与烷基苯的物理化学性质具有优良的性质相关性,二元相关系数均在0.99以上;以0Zh,1Zh和分子中C原子数NC为自变量的三元线性回归方程对烷基苯理化性质的预测结果相当令人满意.     

领结芳烃: 刺激响应性荧光双环分子

伴随着超分子化学的诞生与发展,大环分子一直是超分子体系的重要构筑基元[1].几十年来,以冠醚、环糊精、杯芳烃、葫芦脲、柱芳烃等为代表大环分子因其优异的客体识别性质而被广泛用于功能超分子体系的设计与构建[2].然而上述大环主体分子的基本分子骨架并不具备荧光基团,因此通常需要依赖客体分子的荧光性质或者通过多步反应对大环结构作进一步化学修饰才能实现荧光主客体体系的构筑[3].鉴于荧光性质在检测、传感、成像等领域的重要用途,发展具有丰富光物理性质的新型大环骨架是一个亟需突破的重要的研究方向.     

[2~3]Cyclophanes电子结构的理论研究

用改造的重叠模型多重散射X~α自洽场方法计算环芳类化合物[2~3]cyclophanes的电子结构, 分析该类分子中分子轨道通过空间和通过键的相互作用,单键连接桥.双键连接桥对通过键相互作用的影响, 用过渡态理论方法计算分子前线分子轨道的电离能,理论结果与紫外光电子能谙符合较好.     

分子极化效应指数与脂肪族醛酮的沸点

建立物质的定量结构—活性相关性(QSAR)和定量结构—性质相关性(QSPR)的研究一直受到化学工作者的关注。用拓扑指数研究饱和烃的各种物理化学性质已经有大量报道1 4。本文讨论了分子极化效应指数[5]与脂肪族醛酮沸点的关系,力求寻找到一个适用范围广,并且具有分子结构特征的计算脂肪族醛酮沸点的计算公式。1　分子结构参数的确定脂肪族醛酮分子中羰基的存在,使相同碳原子数的醛酮沸点比烷烃升高很多。我们以醛酮分子中的烷基极化效应指数(PEI)的差值(ΔPEI)[6]来表示羰基位置对醛酮沸点的影响:ΔPEI=PEIB,N-PEInrm,N(1)式中,…     

烯烃顺反异构的拓扑方法研究

在烯烃的顺式与反式异构体中, 处于碳碳双键两端的顶点间的距离是不同的. 可根据几何原理计算与双键相连的顶点间的空间距离, 并以此构造分子图的修正距离矩阵来区分这种差异.按照我们已报导的顶点度-距离指数(VDI)和边度-距离指数(EDI)的计算方法, 用修正距离矩阵(MD)代替距离矩阵(D), 得到修正的顶点度-距离指数(MVDI)和修正的边度-距离指数(MEDI). 这两个参数能较好地区分烯烃顺反异构体的分子结构信息.对烯烃顺反异构体的沸点(b. p.)、折光率(nD 20)、密度(D20)及摩尔折光率(nM)等物化性质进行定量相关, 得到模型方程的相关系数(R)分别为0.9981、0.9570、0.9884和0.9999. 同时, 交叉验证和随机抽样预测结果表明模型具有良好的稳定性和较强的预测能力.     

六元扩展卟啉的Zn2+,Cd2+,Hg2+单金属配合物的光电性质的理论研究

通过定域密度矩阵方法和含时密度泛函方法研究了六元扩展卟啉及其Zn,Cd和Hg单金属配合物的光电性质.通过计算得到扩展卟啉HP同金属Zn2+,Cd2+和Hg2+发生配位时,分子趋于平面化.配合物在Q带有弱得吸收峰,它们随着中心金属的原子序数的增加产生了红移.在B带有强吸收峰,其特征峰主要来自于中心金属离子的d轨道和同金属配位的C原子所处的吡咯环以及吡咯环两侧的meso-C原子上的苯基的参与.对于扩展卟啉极其配合物,定域密度矩阵方法也可以很好的预测光谱和电子跃迁性质.     

环丙烷与不饱和化合物发生[3+2]扩环反应的研究进展

由于具有较强的环张力,环丙烷能够与多种不饱和化合物发生[3+2]扩环反应构建五元碳环或五元杂环骨架结构.这些五元环化合物是许多药物、天然产物和生物活性分子的核心结构,同时也是一类重要的有机反应中间体,在医药、农业、化工、有机合成等领域具有十分广泛的用途.近年来,许多化学研究者以环丙烷作为三碳合成子,构建了结构复杂的五元碳环和五元杂环结构,促进了环丙烷领域的快速发展.对近十年来烯烃、醛酮、腈等含有不饱和键的化合物与环丙烷发生的[3+2]扩环反应进行了综述,并对该领域的发展方向进行了展望.     

金属卟啉类化合物的催化作用

卟啉是含四个吡咯分子的大环类化合物,母体卟吩自由碱的骨架如图1(1)所示。自然界中分布最广的卟啉化合物是原卟啉Ⅸ(图1(2))、酞菁(图1(3))具有和卟吩核类似的结     

键邻接矩阵特征根与单烯烃生成焓的定量计算

在作者已有工作[1]基础上对烯烃分子的π键、每一C-C σ键和C-H σ键分别构建键邻接矩阵,记为CMπ,CMC-C和CMC-H.求解每个键邻接矩阵CM都可得到一对特征根:X1和X2(令X1＜X2),然后分别对分子中所有C-Cσ键和C-Hσ键邻接矩阵的较小的特征根求和即得∑X 1CC和∑X 1CH.π键邻接矩阵CMπ的特征根记为X1π和X2π(其中X1π＜X2π).