基于顺序形态变换的生物芯片图像网格化

生物芯片图像网格化是对由生物芯片扫描得到的荧光成像中的信号(Foreground)和背景(Background)进行划分,以便提取各点的吸光度值、面积和吸光度比等荧光点的数据。网格化的准确与否决定了数据提取的正确性。提出了一种运用顺序形态变换理论实现生物芯片荧光图像网格化的方法,通过对百分位值在0~1之间的顺序形态进行变换,可实现像素灰度的极小值、中间值等多刻度值的灰度取值运算。理论分析表明,该算法能够识别信号与背景的边界,可去除噪声等非边界信息,能判断信号区域,可确定荧光点的边界和范围,可实现荧光点阵图像的网格化。试验结果表明,该算法对不同信噪比的荧光图像来说有很强的适应性,可用于高密度生物芯片图像的处理。     

2006年国际生物-纳米-信息融合大会暨2006年国际生物芯片技术论坛

会议由清华大学、生物芯片北京国家工程研究中心、科技部、教育部、国家自然基金委等单位共同主办，由生物芯片北京国家工程研究中心具体筹办。     

2006年国际生物-纳米-信息融合大会暨2006年国际生物芯片技术论坛

会议由清华大学、生物芯片北京国家工程研究中心、科技部、教育部、国家自然基金委等单位共同主办，由生物签片北京国家工程研究中心具体筹办。会议主要议题。     

表面等离子体共振成像生物芯片检测系统

根据表面等离子体共振(Surface Plasmon Resonance, SPR)原理,提出基于表面等离子体共振成像(Surface Plasmon Resonance imaging, SPRI)的生物芯片检测系统构建方法.介绍了SPRI生物芯片检测系统的原理、自行组建的SPRI生物芯片检测系统的结构.采用Kretschmann型棱镜耦合结构激励SPR,偏振的平行光经棱镜投射到生物芯片上,发生表面等离子体共振,由CCD摄像机采集反射光芯片图像.以巯基修饰淋病奈瑟氏菌探针为例验证该系统,利用自组装单分子层技术(Self-Assembled Monolayer,SAM)固定探针.应用该检测系统采集了探针共振、非探针处共振、探针和非探针处都不共振时的生物芯片图像.     

韩国研发出小型传感器监测食品污染

韩国研究人员发明了一种小型生物芯片传感器,可快速、准确地对食品和环境污染进行检测。据韩联社报道,由郑奉铉领导的韩国生命科学和生物技术研究所研发的这种生物芯片传感器利用表面等离子体共振技术,即通过接收被扫描物体表面反射的激光共振信号来辨别分子层面的结构,从而检测被测对象的DNA和蛋白质是否受到污染。郑奉铉说,与那些只能用在实验室的笨重检测设备相比,这种可单手提起的新装置可进行“即时检验”,大大提高了检测效率。这种生物芯片传感器经过改造后,还可用于药品、供水系统的检测,甚至可以应用于军事领域。韩国研发出小型传感器监测食品污染     

生物芯片国家分中心落户烟台

通过遗传基因检测判断一个人此生将患何种疾病,从而提前干预治疗,这种先进的生物技术来到了我们身边。6月24日上午,生物芯片北京国家工程研究中心烟台分中心签约仪式在毓璜顶医院隆重举行。该中心是目前全国仅有的四家分中心之一,也是华东地区唯一的分中心。     

A novel strategy for in situ maskless synthesis of biochips： Self-driving micro-fluid porous type printing （SMPTP）

A novel maskless technique,self-driving micro-fluid porous type printing(SMPTP),was reported to in situ synthesize oligonucleotide arrays on glass slide,which has the merits of low cost,high quality and simple craft.In SMPTP for fabricating gene- chips,porous fiber tubes with a number of nanometric or micron channels functioned as“active letters”and were assembled in designed patterns,which are identical to the distribution of monomers in each layer of the array,and four patterns were needed for each layer.By means of capillarity,the synthesis solution was automatically taken into porous tubes assembled in a printing plate and reached the surface.An oligonucleotide array of 160 features with four different 15-mer probes was in situ synthesized using this technique.The four specific oligonucleotide probes,including the matched and the mismatched by the fluorescent target sequence,gave obviously different hybridization fluorescent signals.     

连续流动式聚合酶链式反应生物芯片/微装置中脱氧核糖核酸样品的驱动控制技术进展

介绍国内外连续流动式聚合酶链式反应生物芯片／微装置中脱氧核糖核酸样品的驱碧控制技术进展，主要包括恒流泵（注射泵驱动和蠕动泵驱动）、旋转泵驱动、磁流体动力驱动以及自然对流驱动等。并对这几种驱动方式的优缺点作简要的讨论（引用文献43篇）。     

食品安全现场快速检测技术研究进展及应用

介绍了快速检测技术,包括:化学比色法、酶联免疫法、免疫胶体金试纸、生物芯片、生物传感器、便携式色谱质谱联用仪、生物化学发光检测仪等在食品现场快速检测中的研究进展及应用,探讨了食品快速检测的发展方向.     

拉曼光谱编码的荧光液相生物芯片检测系统研究

随着医疗诊断需求的增加,生物分子检测技术越来越受到人们的重视,液相生物芯片技术作为一种高通量,多通道的分子检测手段在近几年得到了飞速发展。通过层层自组装方法制备以微片为载体的拉曼光谱编码液相生物芯片,并利用自行搭建的一套高灵敏度、高分辨率的光学系统,实现对液相生物芯片的定性与定量分析。光学系统由拉曼光谱检测系统与荧光显微成像系统耦合而成。在拉曼光谱检测系统中激光器发射出785 nm波长的激光,通过二向色镜,带反反射镜与物镜汇聚到样品上,样品产生的拉曼散射光,经物镜,带反反射镜,二向色镜与拉曼滤波片,最后通过凹透镜聚焦到光谱仪的狭缝上,光谱仪色散实现在线阵CCD上拉曼光谱的获取。荧光显微成像系统应用光学成像原理,通过调节凹透镜与405 nm的激发光之间的距离,使激发光通过物镜均匀的照射到样品之上,样品激发出的荧光,通过物镜,带反反射镜,二向色镜,滤波片与相应的凹透镜,最后成像到面阵CCD上。改进传统便携式拉曼光谱检测系统光路并选用相应波段的带反反射镜与焦距20倍的物镜完成拉曼光谱检测系统与荧光显微成像系统的耦合。为了减少两路系统之间的相互影响选用合适的二向色镜以及滤波片,在提高耦合系统获取数据的准确性中有着重要的作用。该系统通过对反应之后的液相生物芯片进行拉曼光谱检测,以完成对每个编码玻片的定性识别,即解码;同时激发反应后液相生物芯片的荧光并采集荧光强度图,根据每个解码玻片上的荧光强度值完成对目标检测物的定量分析。区别于传统荧光编码液相生物芯片, 拉曼光谱编码具有稳定性更强,光谱分辨率更高等优点。该光学系统集拉曼光谱检测系统与荧光显微成像系统于一体,解决了目前未有基于拉曼编码的液相生物芯片的检测系统的问题,并且可同时对多种目标物进行识别和定量分析,提升了实验结果的准确性。