《生物有机质谱》书讯

生物有机质谱是近十几年来发展较快的领域,现已广泛应用于有机化学、生物化学、药物化学、配位化学以及化学生物学和蛋白质组学等领域的研究,尤其在蛋白组学方面的应用,使质谱真正步入生物大分子研究领域。由我国著名有机化学家、中国科学院院士赵玉芬教授编著的《生物有机质谱》一书,已于2005年10月由郑州大学出版社出版。赵玉芬院士在国内率先步入了生物有机质谱的领域,经过近十几年的研究,获得了国内外同行的好评。本书重点介绍了赵玉芬院士在生物有机质谱研究领域取得的最新成果及进展。内容包括氨基酸、核苷酸、肽、蛋白质及它们含磷衍…     

基于碘乙酸功能化树枝状聚合物的硫巯化肽段选择性富集新方法

蛋白质的硫巯化是一种重要的氧化翻译后修饰，在细胞衰老、内质网应激、血管舒张、细胞凋亡等过程中扮演重要角色。利用蛋白质组学技术表征硫巯化修饰具有十分重要的意义。该文发展了一种基于碘乙酸功能化的聚酰胺-胺树枝状聚合物（PAMAM-INS），并结合滤膜辅助的样品预处理技术用于硫巯化肽段的富集（简称FADE策略），利用FADE策略能从100倍质量干扰的牛血清白蛋白酶解产物中选择性地富集出硫巯化标准肽段。将细胞培养稳定同位素标记技术引入到FADE策略中，并将其应用于不同浓度梯度硫氢化钠刺激的SHSY5Y细胞硫巯化蛋白质组分析，共鉴定到163条硫巯化肽段。生物信息学的结果表明，硫巯化修饰可能在中枢神经系统中扮演着重要角色。     

质谱法分析2型糖尿病大鼠神经视网膜差异表达蛋白

采用二维电泳(2DE)分离了正常SD大鼠和2型糖尿病模型大鼠神经视网膜组织总蛋白, 并用Image Master 5.0软件分析比较了正常组和糖尿病组2DE图像, 正常组检测到 3122±37(n=3)个蛋白质点; 糖尿病组检测到2702±21(n=3)个蛋白质点. 约150个蛋白质点的表达水平在两组之间存在明显差异(P<0.05). 在糖尿病组中表达上调的点68个, 下调的点82个. 选择20个差异表达蛋白质点进行肽质量指纹谱(PMF)或串联质谱鉴定, 其中7个蛋白已有报道与糖尿病视网膜病变(DR)相关, 10个蛋白尚未见有报道.     

蛋白质组学在人乳蛋白质研究中的应用

人乳是新生儿最理想的天然食物，蛋白质是人乳中最主要的营养成分之一。随着蛋白质组学技术的发展，利用蛋白质组学的方法研究人乳蛋白质也取得了一些研究成果。本文综述了近年来蛋白质组学技术在人乳蛋白质研究中的应用，分别从人乳蛋白质的组成研究、动态变化、人乳与其他来源乳汁的蛋白质差异比较、人乳磷酸化蛋白和糖基化蛋白研究、人乳内源肽的研究及人乳蛋白与疾病等几个方面进行了阐述。蛋白质组学技术使人乳蛋白质的研究进入了微量营养研究的时代，人乳蛋白质组学的研究成果将为母婴健康提供更好的保障。     

蛋白质组学和代谢组学在微生物代谢工程中的应用

构建微生物细胞工厂是化学品、生物能源以及药物分子可持续生产的可行性策略。然而，微生物的代谢复杂、调控严谨，制约着目标产物高效合成。蛋白质组学和代谢组学可以从系统生物学角度分析酶和代谢物组分，从而理解复杂的生物系统，为微生物代谢工程改造提供重要线索。该文介绍了蛋白质组学和代谢组学在微生物代谢工程中的应用，包括基因组尺度代谢模型构建、菌株生物合成优化、指导菌株耐受性改造、限速步骤预测、植物次级代谢途径挖掘，从而为微生物合成天然产物提供新的基因或途径。在此基础上，该文还展望了生物大数据未来的发展方向。     

定量蛋白质组学新技术新方法研究获新进展

9月3日,中科院大连化学物理研究所邹汉法、叶明亮研究员带领的团队,在定量蛋白质组学新技术新方法方面取得新进展,发展了一种基于胰蛋白酶催化的N端稳定同位素编码的氨基酸标记的相对定量蛋白质组学方法。相关研究成果发表在德国《应用化学》上。蛋白质组学研究的主要内容是蛋白质的表达水平,翻译后修饰,蛋白与蛋白相互作用等,最终的     

18O同位素标记定量肽段串联体蛋白质结合同位素稀释-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法

建立了定量肽段串联体蛋白质(concatamers of Q peptides, QconCATs)结合¹⁸O同位素标记-多反应监测质谱的蛋白质绝对定量新方法。首先对QconCAT重组蛋白质进行了纯度表征,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)表征结果表明重组蛋白质的纯度在99%以上,相对分子质量约为63.4 kDa。对QconCAT重组蛋白质酶切后的肽段混合物进行质谱分析,并经pFind和pLabel软件处理,验证了目标肽段。还考察了QconCAT重组蛋白质的酶切效率和¹⁸O标记效率,并对QconCAT蛋白质结合¹⁸O标记-同位素稀释-多反应监测质谱方法进行了评价。实验结果表明,采用该方法对腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tengcongensis, TTE)中选定蛋白质的肽段进行绝对含量测定时,相对标准偏差小于20%,准确度较高,说明该方法可用于复杂生物样本中蛋白质的绝对定量。更重要的是所建方法不仅解决了细胞培养氨基酸稳定同位素标记(SILAC)技术的重标试剂价格昂贵的问题,也为定量蛋白质组学提供了一种新的方法。     

“组学与个性化治疗”专题研讨会(第二轮通知)

为了积极促进我国蛋白质组学的研究与发展,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会主办、北京蛋白质组研究中心和德国慕尼黑国际博览集团承办的"组学与个性化治疗"专题研讨会定于2014年9月24-26日慕尼黑上海分析生化展期间在上海新国际博览中心召开。一、会议安排本次研讨会主要以大会报告形式进行交流,将邀请国内外蛋白质组学及相关领域的著名专家、教授作