两种非蛋白氨基酸的新功能: 与丙二醛相互反应的机制

丙二醛(MDA)是生物分子氧化的典型羰基中间体, 是脂质过氧化的典型终末产物. 这类活性羰基中间体引起组织蛋白的老化与恶化及DNA损伤. 牛磺酸在人体内具有非常广泛的生理功能, 而g-氨基丁酸(GABA)是神经系统的一种重要抑制性神经递质, 因此二者是两种很重要的非蛋白氨基酸. 研究了在生理条件下牛磺酸或GABA是否直接诱捕MDA从而保护组织蛋白不受伤害. 将牛磺酸或GABA与MDA在生理条件下温浴48 h, 经高效液相、质谱等分析手段分析, 发现牛磺酸或GABA与MDA直接反应, 通过HPLC分离, 都生成两种主产物, 一种是没有荧光的紫外吸收峰为274～278 nm 的产物, 一种是有荧光的产物, 这种类似脂褐素(Ex. 392～395 nm/Em. 456～364 nm)的荧光产物是1,4-二氢吡啶衍生物. 牛磺酸或GABA与MDA的反应表明它们在生理条件下具有清除活性羰基的功能, 而这种毒性羰基与很多羰基紧张相关的疾病及衰老有关.     

极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的高温分子动力学模拟研究

作为HIV侵染细胞的蛋白质机器,包膜蛋白gp120利用序列变异和结构柔性等策略逃避宿主免疫识别,是病毒呈现出不同中和表型的主要原因.尽管HIV中和表型的分子机制已被初步探索,但其热力学相关的分子基础仍待进一步阐明.本研究利用同源模建的方法构建了极端中和表型HIV毒株(中和抵抗毒株H061.14与中和敏感毒株R2)的gp120结构模型,在逐渐升高的温度梯度下进行了高温分子动力学模拟,以研究二者在结构稳定性、解折叠和构象柔性上的差异.结果表明,HIV中和表型与gp120的热力学性质呈正相关,与解折叠程度无必然关联.各温度下gp120的结构偏差、天然接触含量、构象群体分布,以及单残基柔性的比较清楚地说明,中和敏感比中和抵抗gp120表现出更大的结构偏差、更多的构象状态和更高的构象柔性,但两者具有相似的解折叠程度.由极端中和表型HIV包膜蛋白gp120显著不同的热力学性质可以推断,HIV很可能利用gp120的热力学性质来调节其构象,进而平衡病毒侵染和免疫逃避之间的矛盾.我们的研究不仅揭示了极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的在构象柔性和结构稳定性上的差异,同时还从高温解折叠热力学的角度明确了...     

二维剪切干涉波前的最小二乘法重建

提出了一种可以快捷地重建原始的二维波前的新算法。对于分别在相互垂直方向上横向切干涉获得的两个差分波前,用快速傅里叶变换首先计算出待测原始波前存x和y方向的估计分布,然后利用误差计算的最小二乘法进行二维拟合,可以恢复出待测波前的二维分布。提出的理论可以应用于剪切量大于1个采样间隔的二维波前重建问题,解决了已有的二维剪切干涉波前重建技术中要求剪切量等于采样间隔的限制。研究了剪切量和噪声对重建精度的影响．和其它算法进行了比较．给出了数值实验结果和分析讨沦。结果表明该算法速度快,对噪声有较强的抵抗力．有望在实际的剪切干涉测量中获得应用。