连接环、末端碱基及一价阳离子对G-四链体结构的影响

研究了G-四链体中的连接环(Loop)、末端碱基和一价阳离子对其结构的影响,发现在K+溶液中Loop短的序列易形成平行结构,无末端碱基时容易形成多聚体,而反平行或混合平行/反平行的G-四链体则难以形成多聚体;一价阳离子K+,NH+4和Na+促进形成平行结构及多聚体的能力依次减弱.在平行G-四链体的3’或5’端增加非G碱基,或改变阳离子使其形成非平行结构,均可抑制多聚体的形成.Loop长度影响G-四链体的热稳定性,Loop短的序列可形成很稳定的分子内结构;无末端碱基的G-四链体多聚体的稳定性低于单个G-四链体,且多聚体随着温度升高而变小.结果表明,在K+溶液中,无末端碱基的平行G-四链体序列首先形成分子内结构,然后通过π-π堆积形成多聚体;末端碱基及反平行或混合平行/反平行G-四链体中的Loop可阻碍末端堆积作用,抑制多聚体的形成.本研究为G-四链体的结构与功能研究提供了有用信息.     

应用于环境分析的切割RNA的脱氧核酶研究进展

切割RNA的脱氧核酶(RNA cleaving DNAzyme, RCD)可在特定因子辅助下对RNA底物进行剪切,产生可被放大的检测信号,是一种既有信号识别元件又有信号输出单元的理想生物传感器。RCD可化学合成,易于修饰且稳定性高,已被用于构建检测有害物质的生物传感器,在环境监测领域中显示出应用前景;然而,相对于核酸适配体来说,人们对RCD的关注较少。本文针对重金属离子、有害细菌、传染性病毒核酸等环境领域关注的对象,综述了可用于检测这些目标的RCD的研究进展,并讨论其所面临的挑战,以期引起人们对RCD的研究兴趣,开发更多性能优异的RCD用于环境分析。