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运用PM6量子化学计算方法, 并通过设计配体交换反应, 研究了桑色素与基质金属蛋白酶(MMPs)中催化锌离子(Zn2+)的相互作用机理. 研究发现, 当桑色素分子中A, B, C环上不同部位的基团与MMPs中催化锌离子络合时, 发生了电子从桑色素分子向催化锌离子的转移, 且电子转移越多, 越有利于增强它们之间的络合能力. 进一步研究发现, 在桑色素分子的不同部位基团中, 以4位羰基的氧原子与MMPs中催化锌离子的络合能力最强, 这表明桑色素应主要通过其4位羰基对MMPs产生抑制作用, 而不是其它部位的羟基. 回归分析结果显示, 计算得到的6个配体交换反应的自由能变化(DG298)与反应生成的各络离子中的Zn—O键长、桑色素分子的总原子电荷以及配位O原子的电荷之间均存在着较好的线性相关性. 我们的计算结果与文献中相关的实验和理论结果一致. 有关作用机理的研究结果可为将来通过对桑色素分子进行结构修饰、以设计出生物活性有显著提高的MMPs抑制剂提供重要参考. 相似文献
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通过湿化学法在70℃低温条件下,制备了亚微米棒状ZnO。利用紫外可见吸收光谱(UV-Vis),扫描电镜(SEM),X射线粉末衍射(XRD)以及拉曼光谱对棒状ZnO进行了表征。采用密度泛函(DFT/B3LYP)方法,以6-311G*为基组研究了结晶紫(CV)的理论平衡构型,同时以CV作为探针分子,检测了亚微米棒状ZnO的表面增强拉曼(SERS)活性。结果表明:亚微米棒状ZnO为六方纤锌矿结构,具有很高纯度和结晶度。CV在ZnO表面的拉曼增强因子可达1.2×102,其增强机理主要来源于化学增强。 相似文献
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