| 桑色素与基质金属蛋白酶中催化锌离子相互作用机理的理论研究 |
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| 引用本文： | 张骥,李婷,陆涛,孟卫,余丹妮,陈亚东.桑色素与基质金属蛋白酶中催化锌离子相互作用机理的理论研究[J].化学学报,2011,69(3):253-261. |
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| 作者姓名： | 张骥 李婷 陆涛 孟卫 余丹妮 陈亚东 |
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| 作者单位： | (1中国药科大学物理化学教研室 南京 210009)
(2中国药科大学药学院 南京 210009)
(3中国药科大学有机化学教研室 南京 210009) |
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| 基金项目： | 中国药科大学人才引进基金 |
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| 摘 要： | 运用PM6量子化学计算方法, 并通过设计配体交换反应, 研究了桑色素与基质金属蛋白酶(MMPs)中催化锌离子(Zn2＋)的相互作用机理. 研究发现, 当桑色素分子中A, B, C环上不同部位的基团与MMPs中催化锌离子络合时, 发生了电子从桑色素分子向催化锌离子的转移, 且电子转移越多, 越有利于增强它们之间的络合能力. 进一步研究发现, 在桑色素分子的不同部位基团中, 以4位羰基的氧原子与MMPs中催化锌离子的络合能力最强, 这表明桑色素应主要通过其4位羰基对MMPs产生抑制作用, 而不是其它部位的羟基. 回归分析结果显示, 计算得到的6个配体交换反应的自由能变化(DG298)与反应生成的各络离子中的Zn—O键长、桑色素分子的总原子电荷以及配位O原子的电荷之间均存在着较好的线性相关性. 我们的计算结果与文献中相关的实验和理论结果一致. 有关作用机理的研究结果可为将来通过对桑色素分子进行结构修饰、以设计出生物活性有显著提高的MMPs抑制剂提供重要参考.
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| 关 键 词： | 桑色素 基质金属蛋白酶(MMPs) 机理 PM6 自由能 |
Theoretical Studies on the Mechanisms of Interaction between Morin and the Catalytic Zinc Ion in Matrix Metalloproteinases |
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| Zhang Ji,Li Ting,Lu Tao,Meng Wei,Yu Danni,Chen Yadong.Theoretical Studies on the Mechanisms of Interaction between Morin and the Catalytic Zinc Ion in Matrix Metalloproteinases[J].Acta Chimica Sinica,2011,69(3):253-261. |
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| Authors: | Zhang Ji Li Ting Lu Tao Meng Wei Yu Danni Chen Yadong |
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| Institution: | (1 Department of Physical Chemistry, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009)(2 School of Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009)(3 Department of Organic Chemistry, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PM6 |
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