EHMO方法的分子轨道定域化

用Foster-Boys的定域化准则讨论了EHMO方法的分子轨道定域化问题,提出用双中心重叠积分近似计算双中心轨道偶极矩积分方法,得到的EHMO定域分子轨道与严格定域化结果接近,与从头计算方法的定域化结果定性一致。     

共轭高分子体系的分子轨道理伦V:二维重复单胞体系本征方程的因子分解方法

本文将一维重复单胞体系本征方程的因子分解方法向二维体系作了一般的推广,从而解决了一些重复单胞构成的二维大分子体系的能谱问题 , 利用因子分解法,本文研究了石墨二维平面分子边缘的化学反应活性以及体系的电子结构, 导电性与分子尺度的关系, 结果表明, 对于石墨类分子, 边界效应是非常显著的, 且体系的反应活性, 导电机制与边界的结构紧密相关。     

10-30T恒定磁场下碱金属原子的边界轮廓

孤立原子是具有球对称性的.如果将孤立原子置于磁场中,原子的边界半径必然会发生变化.根据原子边界轮廓理论模型,研究和计算了在10~30 T磁场强度下碱金属原子的边界轮廓,可供有关参考.     

分子轨道成键性质及原子间化学键强度的成键能判据

本文定义了成键能Eb并用作分子轨道成键性质和分子中原子间化学键强度的判据。与Mulliken重叠布居Pb不同, 在成键能Eb中同时包含了原子轨道间的重叠因素和原子轨道的能量因素。对一些分子所作计算结果表明, 成键能判据较Mulliken重叠布居判据所得结论与实验更相符。     

定域分子轨道模型——含H、C、N、O有机小分子的研究

应用STO_(-3)G从头算方法和Fostre-Boys定域化分子轨道程序, 我们研究了20多个有机小分子(含H、C、N,O)的定域化分子轨道, 获得了它们的能量和相互作用参数。采用定域分子轨道模型和统一的参数, 对正醇类分子进行了计算, 与光电子能谱数据比较, 得到的电离能的计算结果是相当令人满意的。     

应用ABEEM/MM模型研究水分子团簇(H2O)n (n=11～16)的性质

应用ABEEM/MM 模型计算了较大的水分子团簇(H2O)n (n=11~16)的各种性质,如：优化的几何构型, 氢键个数, 结合能, 稳定性, ABEEM 电荷分布, 偶极矩, 以及结构参数、平均氢键个数和强度, 增加的团簇结合能等.结果表明,从立方体结构到笼状结构的过渡出现在n=12的水分子团簇中,随着类似于笼状结构特点的不断增强,五元环的富集程度有所增加.     

HIV-1 PR催化水解第3步机理的研究

在B3LYP/6-31G(d)水平下研究了HIV-1 PR催化水解反应关键性的一步,即第3步反应.模型体系包括了活化位点的3个残基,Asp25(25′)-Thr26(26′)-Gly27(27′) 主要参加反应的基团,构建了由69个原子组成的较大模型体系.进一步研究表明Thr26(26′)和Gly27(27′)在水解反应中只起到保持活化位点平面构型的作用,并未直接参与水解反应.另外,详细分析了第3步反应的分子内及分子间氢键.     

关于分子特征形状的理论--Ⅰ. 一种定义分子特征形状的新方法

以分子中电子运动的经典转折点为依据 ,提出了分子的特征边界轮廓模型 ,定义了分子的特征边界轮廓 .借助于MELD从头计算程序 ,同自编程序相结合 ,精密估算了分子中与电子运动有关的一些物理量 ,如分子中一个电子所受到的作用势等 ,从而按此模型和定义绘出了平衡几何构型时分子的特征边界轮廓 ,并且对化学键的形成过程有一个形象直观的描绘     

在分子中单电子受到的作用势的理论研究

分子的所有性质都是由分子内的电子和原子核的相互作用及其运动所决定的 .这种相互作用 ,在讨论各种问题中 ,可以用各种各样的作用势来描写 [1～ 9] .分子静电势为分子间的相互作用研究 ,尤其是药物和受体相互作用的研究 ,提供一种非常有用的手段 [1,2 ] .在 Hartree- Fock[3 ,4 ] 方程中的势能项是某个分子轨道上 1个电子所受到的所有原子核和其余电子的作用势 . Slater[5,6] 提出了平均作用势 .Kohn- Sham[7]把单电子轨道引进密度泛函理论中 ,建立了 Kohn- Sham单电子运动方程 .KS轨道上1个电子所受的有效定域势场为该电子与其余电子…     

鸟嘌呤与氨基酸残基体系的极化力场

发展了应用于鸟嘌呤G和氨基酸残基体系的浮动电荷力场, 该力场明确定义了孤对电子和键的电荷和位置, 通过电荷随着环境的浮动来体现极化效应; 通过氢键拟合函数k_HB描绘了氢键键能. 应用量子化学方法, 对G与氨基酸残基体系从氢键、 几何结构及电荷分布3个方面展开计算及分析, 并以其为基准, 确定参数发展了适用于G与氨基酸残基氢键体系的ABEEMσπ PFF. 采用3种不同力场模拟目标分子的结构和性质. 模拟结果表明, 发展的ABEEMσπ PFF与量子化学方法具有最好的一致性, 可用于模拟生物大分子体系.