尿嘧啶及其5位取代物分子的指纹区间的非谐性振动特征

在B3LYP/6-311++G~(**)水平上利用振动二阶微扰理论对2-吡啶酮,尿嘧啶及其5-取代物:5-溴-尿嘧啶、5-氯-尿嘧啶、5-氟-尿嘧啶、5-三氟甲基-尿嘧啶、5-腈-尿嘧啶、5-羟基-尿嘧啶(排斥式和氢键式)、胸腺嘧啶分子做了非谐性计算,研究这些分子在1 600~1 850 cm-1指纹区间振动模式的非谐性频率,非谐性常数与取代基影响的关系,并计算了费米共振峰,用振动激子模型模拟了耦合常数.和2-吡啶酮中的C=O和C=C伸缩振动相比,不同的5位取代基引起嘧啶分子中C=O跃迁偶极矩波动,取代基的电负性使C=C伸缩的跃迁偶极矩增加,并使得嘧啶分子中C=O和C=C伸缩振动之间的相互作用值改变显著,跃迁偶极耦合常数值和跃迁振动电子立方密度充分说明电子相互作用对模式间的耦合起着关键作用.     

经ORC处理银衬底上核酸碱基的SERS研究

利用天线共振子模型对银的表面增强喇曼散射(SERS)特性进行了计算和分析.结果显示，银增强因子在近红外的1.38 eV处为最大，达140以上；近紫外3.35 eV、3.90 eV、4.30 eV位置处依次减小，分别为60、48、45；而在可见光区，银增强因子的最大值为70. 在经氧化还原过程(ORC)处理的银片上做了核酸碱基腺嘌呤、尿嘧啶的SERS谱，腺嘌呤的SERS谱虽然存在荧光的影响，但SERS效应明显.尿嘧啶的SERS谱出现4个明锐的峰值，1035 cm－1是所出现的最强的模式，该模式应是尿嘧啶在核酸中存在的SERS环呼吸模式，可作为检测尿嘧啶存在的判定依据.     

2′,3′-O-二苯甲酰尿嘧啶核糖核苷U(BZ)_2单晶的制备和晶体结构测定

制备了2＇,3＇-O-二苯甲酰基尿嘧啶核糖核苷U(BZ)_2,并在DMF溶液中培养得到单晶。单晶经X射线衍射测定,属三斜晶系,空间群为Pl。晶胞参数a=5.734(1)(?),b=10.124(3)(?),c=11.905(3)(?),α=73.07(2)°,β=84.36(2)°,γ=81.61(2)°,Z=1。用CAD-4四圆衍射仪收集衍射数据。用直接法解晶体结构,用块对角矩阵最小二乘法修正,对3154个独立反射,最终R=0.070。U(BZ)_2的碱基相对于糖环为β构型,两个苯甲酰基在空间上远离5＇-OH,使5＇-OH周围空隙较大,因而苯甲酰基作为Ur的2＇,3＇-羟基的保护基,对5＇-OH的反应不存在立体障碍。     

Synthesis of Polyphosphonates Containing 5—Flouro—N^1—furanyl—N^3—glyceroalkyl—uracil and Formyl Groups

A series of novel polyphosphonates containing 5-flouro-N^1-furanyl-N^3-glyceroalkyl-uracil and formyl groups was synthesized by the condensation of 3-(ω-(1′-furanyl-5-flourouracil-3-yl) alkoxy)-1,2-dihydroxy propane with phosphonyl dichloride. The products were characterized by IR,^1H NMR,^31P NMR, M,and elemental analysis. The results of bioassay show that compound 8a possesses potential anticancer activity.     

蛋氨酸合成酶催化反应研究VII.5-氨基-6-甲基尿嘧啶的合成研究

报道了5-氨基-6-甲基尿嘧啶简便的合成方法。该化合物以6-甲基尿嘧啶（2） 为起始物，经硝化或重氮化分别得到了中间体5-硝基-6-甲基尿嘧啶（3）和5-偶氮 苯基-6-甲基尿嘧啶(4)，化合物3和4经Na_S_2O_4还原，合成产物5-氨基-6-甲基尿 嘧啶（1）。     

1,3-二甲基尿嘧啶的拉曼光谱及其量子化学从头算(DFT)研究

研究了1,3-二甲基尿嘧啶(DMU)的激光拉曼光谱,并且利用量子化学方法B3PW91／6-31G计算了DMU分子的拉曼光谱。对计算和实验的光谱进行比照以及对DMU分子进行的振动分析结果表明,和尿嘧啶比较而言,利用DMU分子作为生物碱基的模型化合物用于拉曼研究具有一定的优势。本研究的最终目的是以DMU和1,3-二甲基尿嘧啶的环丁烷二聚体(DMUD)为模型化合物,研究它们的拉曼光谱和振动动力学,期望获得的信息能够有助于对DNA和RNA的碱基的紫外光损伤的拉曼光谱分析,并且能够对相应类似体系的拉曼光谱的变化从理论和试验上给出有益的信息。同时该研究也是对已有的关于1,3-二甲基尿嘧啶的拉曼光谱研究的有益补充。     

高效液相色谱法同时测定尿液中4种非蛋白氮的含量

建立了高效液相色谱(HPLC)同时测定尿液中4种常见的非蛋白氮物质--肌酸(Cr)、尿肌酐(Cn)、尿酸(Ua)及假尿嘧啶核苷(Pu)含量的方法。尿液首先经丙酮沉淀法除去大分子化合物,然后冷冻干燥,复溶后直接进行HPLC分析。色谱分离选用Waters RP18 Column (150 mm×4.60 mm,3.5 μm),以10.0 mmol/L磷酸缓冲溶液 (pH 4.78)和乙腈为流动相进行梯度洗脱,流速为0.8 mL/min,于220 nm波长下检测,可在7 min内完成4种非蛋白氮的快速分离分析。结果表明Cr、Cn、Ua、Pu在0.1~250 mg/L范围内线性关系均良好(相关系数均大于0.999),检出限分别为9.31、26.19、4.70、6.30 μg/L,加标回收率为81%~111%,峰高的相对标准偏差(RSD, n=3)为0.23%~2.78%,满足定量要求。该法简便、快速,结果准确可靠,为2型糖尿病(T2DM)患者肾功能损坏的研究提供了检测手段。     

水合铀酰与尿嘧啶及其异构体配位体系的计算研究

运用B3LYP/6-311++G**(RLC ECP)方法研究[UO_2(Uracil)j(H_2O)k]~(2+)(Uijk,i为尿嘧啶6种异构体代号,j+k=5)配位体系的几何结构、振动光谱、结合能等性质,并用极化连续介质模型(PCM)考察了溶剂化效应。结果表明,在U1jk体系中,随着尿嘧啶配体数目的逐渐增加,U-Ouracil配位键和U=O键的键长逐渐伸长,水溶液中U=O键的伸缩振动频率逐渐减小,配离子的总结合能呈增加趋势,且气相中的线性拟合效果较好。在Ui14体系中,U-Ouracil的键长与U-OH_2的键长整体成负相关,与U=O键的伸缩振动频率成正相关,结合能最大的配离子并不是由能量最低的尿嘧啶异构体生成的。电子密度拓扑分析表明U-Ouracil键和U-OH_2键具有离子键性质。原子电荷分析揭示在配位过程中是由配体片段向铀酰发生了电子转移,且尿嘧啶的电荷转移量与该配体数目成负相关,其中Ur6异构体向铀酰离子转移电子数最多。     

3种核酸碱基(胞嘧啶、胸腺嘧啶、尿嘧啶)在银电极表面的吸附形态

通过表面增强拉曼散射研究了胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶在粗糙银电极表面上的吸附形态随电极电位的变化关系.大量的结构信息可从丰富的表面拉曼信号及其随电极电位相应的变化而获得.分析表明在电极电位负移过程中,胞嘧啶一直通过N3位垂直吸附于纳米银颗粒表面;而胸腺嘧啶分子和尿嘧啶分子在表面的吸附状态都随电位改变发生了变化,较正电位下...     

槲皮素与尿嘧啶和胸腺嘧啶氢键的结合位点

深入理解药物分子和核酸碱基间的相互作用机制对合理设计研发新型高效药物有重要意义. 本文运用密度泛函理论B3LYP方法对核酸碱基尿嘧啶和胸腺嘧啶与药物分子槲皮素间的氢键相互作用位点进行了研究. 使用B3LYP/6-31G(d)方法优化得到了30个稳定的氢键复合物结构, 使用B3LYP/6-311++G(3df,2p)方法计算了这些复合物的结合能. 研究结果表明, 槲皮素可以使用5个不同的结合位点与尿嘧啶或胸腺嘧啶形成氢键复合物, 尿嘧啶或胸腺嘧啶可以使用3个不同的结合位点与槲皮素形成氢键复合物. 当槲皮素的结合位点固定时, 槲皮素与尿嘧啶的位点u1或胸腺嘧啶的位点t1形成的氢键作用最强, 与位点u2或位点t2形成的氢键强度最弱; 当尿嘧啶或胸腺嘧啶的作用位点固定时, 二者与槲皮素的位点qu1 形成的氢键作用最强, 与位点qu5 作用强度次之, 与位点qu3的作用强度最弱. 分子中原子(AIM)和自然键轨道(NBO)分析计算结果表明, 轨道作用在氢键中起重要作用.