尿嘧啶、水合尿嘧啶的结构和振动性质研究

基于从头计算方法和半经验势分子动力学,通过计算尿嘧啶分子及其水合尿嘧啶分子运动轨迹的速度自关联函数的傅立叶变换,给出了这些分子的振动频率。通过求解Hessian矩阵,鉴别出这些分子每一个振动频率的振动模式。对孤立的尿嘧啶分子,计算结果能够和实验数据符合。对水合尿嘧啶分子中,尿嘧啶分子的结构和振动频率的改变做了讨论。Based on an ab initio calculation and a semiempirical method, the structural and vibrational frequencies of Uracil and hydrated Uracil are studied by using the Fourier transform of velocity autocorrelation function of trajectories of molecular dynamics simulations. The finite difference harmonic method is also used to assign the vibrational frequency of each mode. It is found the calculation frequencies are in good agreement with the experiment data. The structural and vibrational frequencies of Uracil in hydrated form is discussed.     

尿嘧啶核苷酸阴离子液相中的过电子附着和电离

本文采用QM/MM方法研究液相尿嘧啶核苷酸阴离子的过电子附着和电离过程. 从分子动力学模拟的轨线抽取了40个采样结构,并计算了在这些采样点的垂直电子亲合势、绝热电子亲合势、垂直电子剥离能、垂直电离能和绝热电离能,分析了过电子附着和电离过程中的过电子及空穴分布. 模拟的垂直电子亲合势和绝热电子亲合势的平均值分别为-0.31 eV和2.13 eV,表明过电子很容易附着到尿嘧啶核苷酸阴离子上. 在尿嘧啶碱基上,垂直和绝热过电子分布的平均值分别为-0.50 eV和-0.62 eV,证明大多数的过电子局域在尿嘧啶碱基上. 双阴离子结构弛豫后,在几个抽样中发现过电子分布也可能会在碱基/糖环或者糖环/磷酸根上非局域化. 2.78 eV的垂直电子剥离能平均值表明,过电子附着后形成的尿嘧啶核苷酸双阴离子非常稳定. 液相尿嘧啶核苷酸阴离子的垂直电离能平均值为8.13 eV,与以前采用溶剂模型模拟的结果一致. 电离中,空穴主要分布在尿嘧啶碱基上,表明其最容易被电离. 在垂直电离中,几个抽样下的空穴会非局域分布在尿嘧啶碱基和糖环上. 绝热的空穴分布表明,在特定结构下,电离后的结构弛豫会导致磷酸根上电子和碱基上空穴转移到糖环上.     

Preparation of Molecular Imprinted Copolymer Membrane for Uracil Recognition

Molecular imprinting is an effective method to create selective recognition sites in synthetic polymers1. Molecular imprinted polymers (MIPs) as tailor made polymer materials are practically applied in the separation of chiral compounds2 and amino acid derivatives3 and in drug assays4. The process of molecular imprinting mainly contains that functional monomer and print molecule (template) is pre-arranged by reversible covalent binding or noncovalent interactions (i.e. ionic, hydrophobic, h…     

含酰胺和尿嘧啶的氢键复合物的三体效应

采用包含BSSE校正的MP2/aug-cc-pVTZ方法对酰胺、二肽、尿嘧啶和水分子形成的氢键复合物的三体效应进行了研究,分析了三体作用能对体系总作用能的贡献.结果表明,在这些氢键复合物中,三体作用能占体系总作用能的10%~20%,三体作用属于近程作用,因此在分子模拟中至少应考虑近处的三体效应.     

新型磷二肽尿嘧啶衍生物的合成(英)

通 过 肽 偶 联 反 应 合 成 了 一 系 列 新 型 的 含 磷 二 肽 的 尿 嘧 啶 衍 生 物， 收 率 为５６．２％ ～７２．６％ ．     

尿核苷和腺核苷的2＇位烯丙基化反应

在核苷酸合成中,核糖2＇位羟基的保护是不易的,主要原因是难以区别2＇位和3＇位的两个羟基。Markiewicz曾提出利用试剂1,3-二氯-1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷(简写为TIPDSiCl_2)作为暂时保护基团的好方法。但是,这种方法不适应醚形式的2＇位羟基的保护。     

氢键构筑的新颖微孔配位聚合物[Co_2(Hisor)_2·(4,4′-bpy)_2(H_2O)_2]·4,4′-bpy的合成与结构

近年来 ,微孔配位聚合物的研究越来越引起人们的重视 .与传统的微孔材料硅酸盐、硅铝酸盐、磷铝酸盐等相比 ,微孔配位聚合物具有独特的优势 :一方面 ,可以将金属离子所特有的磁学、光学、电学和氧化 -还原等特性引入所设计合成的配位聚合物中 ;另一方面 ,有机配体的多样性、可修饰性和与各种金属离子的不同组合 ,为设计合成尺寸可控、形状可控和性质可控的各种配位聚合物提供了可能 .因此 ,微孔配位聚合物在分子磁性、分子识别、信息储存、分离、催化和非线性光学等方面有着广泛的应用前景 .于是 ,设计和合成微孔配位聚合物成为当前具有挑战…     

几种生物碱基的反相高效液相色谱分离及人尿中尿嘧啶和腺嘌呤的…

本文报道在ＳｐｈｅｒｉｓｏｒｂＣ１８柱上，以Ｈ３ＰＯ４－ＫＨ２ＰＯ４溶液作流动相（ｐＨ４．０），同时分离和测定胞嘧啶，尿嘧啶，腺嘌呤和黄嘌呤５种生物碱基，用于人尿分析，标准加入回收率在９２．５～１０５．５％之间。