Synthesis, Characterization and Weak Intramolecular Interactions of Porphyrins Bearing Nucleobases

5,10, 15-Triphenyl-20-{2- [α- (adenine-9 ) acetylamino]} phenyl porphyrin ( 1 ), 5,10, 15-triphenyl-20-{2-[α-(cytosine-1)acetylamino]} phenyl porphyrin (2), 5, 10, 15-triphenyl-20-{4-[α-(cytosine-1)ethoxy]} phenyl porphyrin (3) and their zinc complexes Zn-1, Zn-2 and Zn-3 have been prepared and characterized by ^1H NMR spectra, elemental analyses, electronic absorption spectra and mass spectra (FAB). Intramolecular π-π interactions and intramolecular metal-~ interaction for 1, 2, Zn-1,and Zn-2 have been investigated by several methods. ^1H NMR studies demonstrate that the porphyrin π-system in 1 and 2 is parallel to the adenine and the cytosine aromatic ring, respectively. The electronic absorption spectral properties of free porphyrin derivatives and their zinc complexes have been compared with those of H2TPP and ZnTPP. The results show that the UV-vis spectra of 1 and 2 are the same as that of H2TPP,whereas the spectra of their zinc complexes show 7 nm red shifts of the Soret bands compared to that of ZnTPP. The emission spectra of Zn-1 and Zn-2 are independent of excitation wavelength. From combination of the evidence of absorption and emission spectra it is suggested the existence of intramolecular metal-π interaction in Zn-1 and Zn-2. The results of conformational analysis agreed quite nicely with that of experiments, thus it was further to validate the experimental conclusions.     

DISCO法构建ALS抑制剂与受体作用的药效团模型

在受体ＡＬＳ三维结构未知的情况下,利用距离比较法（ＤＩＳＣＯ）对四个结构特征判别较大的ＡＬＳ抑制型除草剂进行了研究,构建了该类除草剂与受体作用的可能的药效团模型,为进一步设计开发新型的ＡＬＳ抑制剂及模拟靶蛋白的活性空腔提供有意义的参考。     

光系统II(PSII)抑制剂的比较分子场研究

以光系统II抑制剂DISCO(DIStance COmparisons)模型的活性构象分子作为模板,利用比较分子场分析方法对三类结构不同的化合物进行了三维构效关系的研究.研究结果有助于对DISCO重叠模型的评估和新型PSII抑制剂的设计与合成.     

光系统Ⅱ抑制剂-顺式氰基丙烯酸酯化合物的三维构效关系和电子结构研究

以距离比较法所获得的顺式氰基丙烯酸酯化合物的活性构象为模板,对39个该类化合物采用比较分子场方法进行了三维构效关系的研究.结果表明,所获得的药效团模型具有很好的预测能力.同时采用量子化学的方法对活性构象模板分子电子结构作了讨论.     

光系统Ⅱ(PSⅡ)抑制剂的比较分子场研究

以光系统Ⅱ抑制剂DISCO(DIStanceCOmparisons)模型的活性构象分子作为模板,利用比较分子场分析方法对三类结构不同的化合物进行了三维构效关系的研究。研究结果有助于对DISCO重叠模型的评估的新型PSⅡ抑制剂的设计与合成。     

顺式-二 (乙二胺 )二硝基合钴 (Ⅲ ) (d,l)酒石酸盐的合成与晶体结构

合成顺式 -二 (乙二胺 )二硝基合钴 (Ⅲ )酒石酸盐cis [Co(en) 2 (NO2 ) 2 ]·1/2C4 H4 O6超分子化合物 ,(C6H18N6O7Co ,Mr=345 .2 ) ,用X射线衍射方法确定了晶体结构。晶体学参数 :单斜晶系 ,空间群P2 1/a ,a =13.90 1(3) ,b =6 .5 2 5 (5 ) ,c=14 483(4 ) ,β =10 1.13(2 )°,V =12 89.1(4 ) 3,Z =4,Dc=1.779g/cm3,μ(CuKα) =10 6 .6 9cm- 1,F(0 0 0 ) =72 0。结构由重原法、直接法和Fourier合成法解出 ,最终偏离因子R =0 .117,Rw=0 .0 74。Co(Ⅲ )与 6个N原子形成变形八面体构型 ,酒石酸阴离子处在 4个Co(Ⅲ )正离子所包围的空穴中。     

异质同晶体: 三(2-苯并咪唑亚甲基)胺合钴(Ⅱ)和 锌(Ⅱ)配合物的合成、结构 及量化计算

合成了三(2-苯并咪唑亚甲基)胺合钴(Ⅱ)(化合物a)和三(2-苯并咪唑亚甲基)胺合锌(Ⅱ)(化合物b)配合物,进行了元素分析和红外光谱表征;用单晶X射线衍射方法测定了它们的晶体结构。测定结果表明化合物a和b是一对异质同晶体,配合过程中NTB的两个N原子被去质子化,晶体属立方晶系,I-43d空间群。晶胞参数a=b=c=2.2353(3)nm,V=11.169nm^3,Z=16,最终偏离因子为R~1=0.0686(a)和0.0688(b)。配合物中的金属原子与配体NTB分子中的一个烷胺氮原子、三个sp^2氮原子和一个水分子中的氧形成五配位的扭曲三角双锥构型。用密度泛函的方法进行了量子化学计算,结果表明NTB分子有去质子化的倾向,与配合物晶体结构测定结果(配合物中配体以NTB~2形式存在)相吻合。     

紫杉醇衍生物的三维定量构效关系研究

利用比较分子力场分析(CoMFA)方法对98个紫杉醇衍生物的三维定量构效关系(3D-QSAR)进行了分析,发现影响其活性的立体能与静电能之比为61.6/38.4.进一步分析表明,C-13侧链基团的改变对其活性影响较大,尤其是2'-OH对保持活性是至关重要的;而母环其它位置取代基的改变对活性影响较小.该模型交叉验证r_cv²=0.714,非交叉验证r₂=0.901;以此模型对验证组10个化合物活性进行预测,r_pred²=0.812,表明模型具有很好的预测能力,对紫杉醇的改性或新类似物的合成具有指导意义.     

一个取代的三环1,5-苯并二氮杂卓的晶体结构和构 象分析2

用单晶X射线衍射方法测定了6-苯甲酰基-5-(邻氯苯基)-2,3,3a,4,5,6-六氢-3a-苯基-(1,2,3-三乙酸乙酯基)-1H-吡咯啉[1,2-a][1,5-]苯并二氮杂卓的晶体结构。单斜晶系,空间群P2~1/c,a=1.3235(5)nm,b=1.7142(6)nm,c=1.6204(6)nm,β=100.49(3)°,Z=4,最终偏离因子R=0.062,R~w=0.075。晶体结构测定结果表明分子中二氮杂卓七元环采取船式构象,动力学模拟退火计算结果的最低能量构象为椅式,两者的能量差不大,表明这种船式<－>椅式的变化是非常容易发生的。     

异质同晶体: 三(2-苯并咪唑亚甲基)胺合钴(Ⅱ)和 锌(Ⅱ)配合物的合成、结构 及量化计算

合成了三(2-苯并咪唑亚甲基)胺合钴(Ⅱ)(化合物a)和三(2-苯并咪唑亚甲基)胺合锌(Ⅱ)(化合物b)配合物,进行了元素分析和红外光谱表征;用单晶X射线衍射方法测定了它们的晶体结构。测定结果表明化合物a和b是一对异质同晶体,配合过程中NTB的两个N原子被去质子化,晶体属立方晶系,I-43d空间群。晶胞参数a=b=c=2.2353(3)nm,V=11.169nm^3,Z=16,最终偏离因子为R~1=0.0686(a)和0.0688(b)。配合物中的金属原子与配体NTB分子中的一个烷胺氮原子、三个sp^2氮原子和一个水分子中的氧形成五配位的扭曲三角双锥构型。用密度泛函的方法进行了量子化学计算,结果表明NTB分子有去质子化的倾向,与配合物晶体结构测定结果(配合物中配体以NTB~2形式存在)相吻合。