Rietveld法在半结晶聚酯二相共存结构分析中的应用

用Rietveld法对试样的BaF2的实测X射线衍射全谱图(XDWP)数据进行精修，获得正确的结晶相结构参数，重点讨论了如何正确选择衍射峰型函数和评价精修结构参数的可靠性；特别指出，当把Rietveld法和Fourier过滤技术及径向分布函数(radial distribution function，RDF)联用来研究半结晶聚酯(PET)的两相结构参数时，除需用R因子判断结晶相之精修结构参数的可靠性外，还要判断由非品相散射强度数据计算的RDF是否合理；如果忽视后一判据，则有可能导致错误的计算结果。     

芳香族羟肟的合成及其萃取铜的结构-性能研究

合成了一系列不同结构高纯度的芳香族羟肟, 测得了它们的反式羟肟含量和解离常数, 用HMO法计算了配位原子的电荷密度, 并用多元线性回归法研究了这类化合物的结构参数与其萃取铜反应平衡常数的关系。     

量子化学参数对氯代苯理化生物活（毒）性的研究

采用Chemoffice 8.0中的MOPAC-AM1算法对12个氯代苯分子和苯的9种量子化学参数进行计算,并将计算得到的结构参数作为描述符引入定量结构-活性相关(QSAR)研究,运用多元逐步回归法建立了氯代苯的5种理化生物活(毒) 性与量化参数的多元回归方程, 相关系数均大于0.98 , 其计算值与试验值较吻合; 同时对部分无实验数据的氯代苯进行预测.     

原子结构参数的改进Xa法计算

六十年代后期,在Hartree－Fock-Slater法的基础上,提出了Xα法［1］．用于原子结构计算的Xα法与HF（Hartree－Fock）法的主要区别在于：用简单的统计平均交换势替代了HF法中计算最为困难的电子交换势,从而在保持较高理论严谨性和计算精确度的同时,大大减少了计算工作量,近年来获得了广泛的应用．我们尝试用经过适当修改的Xα方法,计算原子参数,解决分子结构中的某些问题．用原子参数解决分子问题,历来是化学和物理工作者常用的方法．本工作的意图是引入一个比HF法简单的容易在微机上实现的某种表现原子参数的计算方法,提供…     

有机磷酸酯农药分子的电子结构和生物活性

本文用CNDO/2法计算了有机磷酸脂农药系列分子的电子结构。引入新参数CB值, 即磷原子的净电荷与最弱的酯键X=P-Y的总键级之比, 表征有机磷酸酯分子生物活性电子效应, 讨论了有机磷酸酯分子生物活性与电子结构的关系。     

人工神经网络用于N-甲基氨基甲酸酯类农药急性毒性的预测

基于拓扑理论计算了N-甲基氨基甲酸酯化合物的电拓扑状态指数(E_n)和分子电性距离矢量(M_k),同时计算了它们理化参数.把2类结构参数用逐步回归分析法进行筛选,确定了4个变量组合E_(31),M_1,M_(60)和SAA.用筛选后的结构参数建立N-甲基氨基甲酸酯农药急性毒性(log1/LD_(50))的神经网络模型,并用模型对log1/LD_(50)值进行了预测,预测结果和实验值比较接近,平均误差为0.071.该方法为开发高效低毒的新型氨基甲酸酯类农药提供理论依据.     

HMO法在萃取剂的化学结构与性能研究中的应用

用Hukell分子轨道法(简称HMO法)对中性磷类、酸性磷类、β-双酮(包括羟基酮),羟肟类等化合物的结构与萃取性能的关系进行了研究。解HMO的高阶久期方程式用Jacobi法求实对称矩阵特征值及特征向量的标准程序。由此计算了电荷密度、最高占据轨道电荷密度(HOMO)、键序、轨道能级、原子间的π-键能、超离域性等结构参数。并讨论了化学结构与萃取性能的关系。一、中性磷化合物的萃取性能主要取决于磷酰氧原子的电荷密度、而后者与取代基团的极性     

7,10-位取代喜树碱衍生物的QSAR研究

利用密度泛函理论(DFT)在杂化泛函B3LYP和基组6-311G(d,p)水平下对7,10-位双取代喜树碱衍生物(CPTs)进行了构型优化,计算出分子的电子结构描述符,利用Chemoffice 8.0软件计算出几个相关的物化描述符;采用逐步多元回归法对该组化合物的抗癌活性与分子描述符之间建立了定量结构-活性关系(QSAR)模型。所建最佳三参数QSAR模型的复相关系数R=0.951;用留一法(leave-one-out,LOO)进行交互检验,得到交互检验系数RCV2=0.778。结果表明,所得QSAR模型具有良好的预测能力,而且影响药物活性的主要因素有化合物分子的结构、最高占据和最低空分子轨道能量差及13-位碳原子的净电荷。     

硝酸酯类分子力学参数的确定和应用

运用MM2(85年版)分子力学程序, 以硝酸甲酯、硝酸乙酯的实验结构为参比, 调试确定了硝酸酯类化合物的伸缩力常数(K~s)、弯曲力常数(K~b)和旋转力常数(V~1、V~2、和V~3)。用这套力场参数计算了硝酸甲酯、硝酸乙酯和硝化甘油的平衡几何构型、生成热和偶极矩, 计算结果与实验值和从头计算结果相一致。还用这套参数计算了结构未见报道的异基硝酸酯、丙烯基硝酸酯和苯基硝酸酯, 所得结果与MNDO全优化几何构型相符。     

B~4元素簇的结构与成键特征

在ab initio 6-31G水平上, 用能量梯度法优化了不同构型B~4元素簇的几何结构参数。用组态相互作用方法对相应于7种几何构型的8个电子态, 进行了相关能计算。通过简正坐标分析, 确证了三种稳定构型, 其对应态的能序为:1^Ag(D~2h)<1^A~1(C~20)<3^A~a(T~d)>1^A~1(T~b)。此外, 用定域化分子轨道方法对稳定态的成键性质进行了讨论。     

环境致癌物的计算机预测研究

环境致癌物可诱发人类或哺乳动物体内的肿瘤,建立环境致癌物的计算机预测模型对环境风险评价和生态安全具有重要的意义．通过构建了3780个化合物的数据集,随机选取其中3024个作为训练集,其余756个作为外部验证集;基于定量构-效关系（QSAR）方法,采用逐步判别分析和主成分分析建立数学模型．结果表明训练集非致癌物预测正确率为86．0％,可能致癌物的预测正确率为88．O％,而采用主成分建模时,非致癌物和可能致癌物的预测正确率分别为74．2％和73．1％．说明逐步判别分析法的结果优于主成分判别分析．同时确定了可能致癌物和非致癌物的分子结构参数,阐明了两者结构差异．以上结果为预测和评估环境致癌物提供参考依据．     

基于地统计学与支持向量回归的QSAR建模

基于主成分分析(PCA)、地统计学(GS)和支持向量回归(SVR), 提出了一种新的定量构效关系(QSAR)个体化预测方法——Weight-PCA-GS-SVR. 其基本思路是: 先以PCA降维并消除自变量间的信息冗余, 继以SVR经非线性主成分筛选去除与因变量无关的主成分, 再以保留主成分计算样本间的加权距离, 然后以高维GS确定公用变程; 每一个待测样本都以自身为中心从训练集中找出加权距离小于公用变程的私有k个近邻, 以SVR训练建模完成个体化预测. Weight-PCA-GS-SVR从行、列两个方向对模型进行了优化, 为自变量提供了一种新的加权方法, 为解决最优k近邻选择难题提供了新的思路, 并具有SVR原来的优点. 经3个化合物活性实例数据集验证, 新方法在所有参比模型中预测精度最高, 且明显优于文献报道结果, Weight-PCA-GS-SVR在QSAR等回归预测领域有较广泛的应用前景.     

ω-芋螺毒素的定量构效关系与虚拟筛选

ω-芋螺毒素属于海洋生物活性多肽,由24-31个氨基酸残基组成.特异性作用于电压敏感的钙离子通道(VGCCs),能够直接开发成药物或作为先导化合物进行新药开发.本文应用新型氨基酸残基结构描述符cscales和遗传偏最小二乘算法,对ω-芋螺毒素进行定量构效关系(QSAR)研究,并设计、构建了容量为2244个化合物的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂虚拟组合多肽库,然后分别采用QSAR模型预测和相似性搜索方法对组合多肽库进行了虚拟筛选.研究结果表明,建立的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂QSAR模型均具有较好的预测能力,交叉验证相关系数(CV-r2)均大于0.89.主成分分析和聚类分析结果表明,虚拟组合多肽库中化合物具有较好的结构多样性和差异性.通过虚拟筛选,得到了具有高预测活性的6个N-型和19个P/Q-型钙离子通道拮抗剂,为进一步的合成和活性评价奠定了理论基础.同时,本文建立的多肽QSAR预测模型和虚拟筛选策略,为其它多肽类化合物的定量构效关系研究和虚拟筛选提供了参考.     

ω-芋螺毒素的定量构效关系与虚拟筛选

ω-芋螺毒素属于海洋生物活性多肽, 由24-31 个氨基酸残基组成. 特异性作用于电压敏感的钙离子通道(VGCCs), 能够直接开发成药物或作为先导化合物进行新药开发. 本文应用新型氨基酸残基结构描述符cscales和遗传偏最小二乘算法, 对ω-芋螺毒素进行定量构效关系(QSAR)研究, 并设计、构建了容量为2244 个化合物的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂虚拟组合多肽库, 然后分别采用QSAR模型预测和相似性搜索方法对组合多肽库进行了虚拟筛选. 研究结果表明, 建立的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂QSAR模型均具有较好的预测能力, 交叉验证相关系数(CV-r²)均大于0.89. 主成分分析和聚类分析结果表明, 虚拟组合多肽库中化合物具有较好的结构多样性和差异性. 通过虚拟筛选, 得到了具有高预测活性的6 个N-型和19 个P/Q-型钙离子通道拮抗剂, 为进一步的合成和活性评价奠定了理论基础. 同时, 本文建立的多肽QSAR预测模型和虚拟筛选策略, 为其它多肽类化合物的定量构效关系研究和虚拟筛选提供了参考.