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| 六钼酸盐有机胺杂化衍生物与SARS-CoV 3CLpro相互作用的分子动力学模拟 | |
| 引用本文： | 邵琛,王建萍,杨国春,苏忠民,胡冬华,孙家锺.六钼酸盐有机胺杂化衍生物与SARS-CoV 3CLpro相互作用的分子动力学模拟[J].高等学校化学学报,2008,29(1):165-169. |
| 作者姓名： | 邵琛 王建萍 杨国春 苏忠民 胡冬华 孙家锺 |
| 作者单位： | 1. 东北师范大学化学学院功能材料化学研究所,长春,130024 2. 东北师范大学化学学院功能材料化学研究所,长春,130024;吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室,长春,130023 3. 吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室,长春,130023 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金 , 教育部长江学者和创新团队发展计划 , 东北师范大学校科研和教改项目 |
| 摘 要： | 采用分子动力学模拟方法, 在分子水平上探讨六钼酸盐有机杂化衍生物潜在的抗SARS病毒活性. 3CLpro主蛋白酶是冠状病毒复制和转录过程中起关键作用的功能蛋白, 因此采用SARS-CoV 3CLpro作为靶标进行抗SARS病毒的药物设计. 使用Insight II软件包中的Biopolymer, Discover 3, Profile-3D和Affinity等模块, 研究 POMs/3CLpro相互作用的结合位点和作用性质. 研究其能量变化规律, 探讨了多酸化合物对SARS病毒可能的抑制机理. 研究结果表明, POMs与3CLpro在酶的催化活性位点处有较强的结合力. 形成的复合物主要以静电相互作用相结合, 氢键相互作用对复合物的相对稳定性有一定影响. 对于POMs/3CLpro复合物, 有机胺基团取代的POMs所带负电荷比未取代体系的高, 比3CLpro的结合能更高, 这与POMs的相关量子化学计算结果吻合. |
| 关 键 词： | SARS 3CLpro 多金属氧酸盐 分子动力学 对接 |
| 文章编号： | 0251-0790（2008）01-0165-05 |
| 收稿时间： | 2006-09-06 |
| 修稿时间： | 2006年9月6日 |
Interactions of [Mo6O19]2- and Its Derivatives Substituted with Organic Groups Inhibitor with SARS-CoV 3CLpro by Molecular Modeling |
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| SHAO Chen,WANG Jian-Ping,YANG Guo-Chun,SU Zhong-Min,HU Dong-Hua,SUN Chia-Chung.Interactions of [Mo6O19]2- and Its Derivatives Substituted with Organic Groups Inhibitor with SARS-CoV 3CLpro by Molecular Modeling[J].Chemical Research In Chinese Universities,2008,29(1):165-169. | |
| Authors: | SHAO Chen WANG Jian-Ping YANG Guo-Chun SU Zhong-Min HU Dong-Hua SUN Chia-Chung |
| Institution: | Institute of Functional Material Chemistry, Northeast Normal University, Changchun 130024, China;;State Key Laboratory of Theoretical and Computational Chemistry, Jilin University, Changchun 130021, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | SARS 3CL~(pro) Polyoxometalate Molecular dynamics Docking |
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