| 毛细管电泳与MFOLD软件研究单链脱氧核糖核酸分离二级结构 |
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| 引用本文： | 贾海,王荣,贾正平,陈巧云,谢华,马骏,敖燕.毛细管电泳与MFOLD软件研究单链脱氧核糖核酸分离二级结构[J].分析化学,2007,35(9):1347-1350. |
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| 作者姓名： | 贾海 王荣 贾正平 陈巧云 谢华 马骏 敖燕 |
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| 作者单位： | 1. 兰州军区兰州总医院药剂科,兰州,730050;甘肃省人民医院药剂科,兰州,730000;兰州大学药学院,兰州,730000
2. 兰州军区兰州总医院药剂科,兰州,730050 |
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| 基金项目： | 甘肃省自然科学基金(No.ZS031-A25-70-E)，中国博士后基金(No.2005027576)，全军“十一五”医药科研(No.06MB096)资助 |
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| 摘 要： | 从Gene Bank数据库中下载质粒基因序列,用DNAssist软件分析并最终建立了单点碱基突变模型,并以此为研究对象对单链DNA分离机理进行研究探讨。采用高效毛细管电泳-激光诱导荧光检测(CE-LIF)方法,以线性聚丙烯酸胺为筛分介质对模型进行分离分析,并与MFOLD软件所预测的单链二级结构进行对照分析。分离条件为:线性聚丙烯酸胺浓度为6%,负极进样,13kV分离,温度为19℃,λem=488nm、λex=520nm。结果发现毛细管电泳实际分析结果有4个单链峰,而MFOLD软件预测的只有3种二级结构,预测的准确度为75%,MFOLD软件虽然有局限性,但预测DNA二级结构仍有一定的参考价值。
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| 关 键 词： | 毛细管电泳 单链构象多态性 二级结构预测软件 |
| 修稿时间： | 2006-12-25 |
Study of Single Strand Deoxyribonucleic Acid Separation Theory by Capillary Electrophoresis and MFOLD Software |
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| Jia Hai,Wang Rong,Jia Zheng-Ping,Cheng Qiao-Yun,Xie Hua,Ma Jun,Ao Yan.Study of Single Strand Deoxyribonucleic Acid Separation Theory by Capillary Electrophoresis and MFOLD Software[J].Chinese Journal of Analytical Chemistry,2007,35(9):1347-1350. |
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| Authors: | Jia Hai Wang Rong Jia Zheng-Ping Cheng Qiao-Yun Xie Hua Ma Jun Ao Yan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Capillary electrophoresis single strand conformation polymorphism MFLOD software |
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