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紫草素与胞嘧啶相互作用的理论研究
引用本文:王译伟,刘源,蔡延森,郭建敏,宋华.紫草素与胞嘧啶相互作用的理论研究[J].原子与分子物理学报,2013,30(6):723-730.
作者姓名:王译伟  刘源  蔡延森  郭建敏  宋华
作者单位:泸州医学院,泸州医学院,泸州医学院
摘    要:采用密度泛函理论的M06方法在6-311++G**基组水平下对紫草素-胞嘧啶复合物进行了结构优化,得到了14个稳定的紫草素-胞嘧啶复合物。我们还应用了分子中的原子(AIM)理论和自然键轨道(NBO)理论对这14个复合物中的氢键的性质和特征进行了分析。通过基组重叠误差(BSSE)校正后的相互作用能、成键临界点电荷密度、二阶稳定化能的计算和分析,发现复合物1的结构是最稳定的。

关 键 词:紫草素  DNA碱基  胞嘧啶  密度泛函理论
修稿时间:11/2/2012 7:09:59 PM

Theoretical studies on the interaction between shikonin and cytosine
Abstract:Density function M06 method has been used to optimize the geometries of shikonin -cytosine at 6-311++G** basis. Finally, fourteen stabilized complexes have been obtained. Theories of atoms in molecules (AIM) and natural bond orbital (NBO) have been utilized to investigate the hydrogen bonds involved in all the systems. The interaction energies of all the complexes were corrected by basis set superposition error (BSSE). By the analysis interaction energy, charge density and second-order interaction energies E(2) of the complexes, it is found that complex1 is the most stable structure.
Keywords:shikonin  DNA base  cytosine  DFT
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