| 6-烷基鸟嘌呤与DNA碱基间氢键作用的理论研究 |
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| 引用本文： | 林雪飞,孙成科,姚立峰,陈益山,杨思娅.6-烷基鸟嘌呤与DNA碱基间氢键作用的理论研究[J].化学学报,2010,68(16):1553-1560. |
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| 作者姓名： | 林雪飞 孙成科 姚立峰 陈益山 杨思娅 |
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| 作者单位： | (曲靖师范学院化学与化工学院 曲靖 655000) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，云南省教育厅重点项目 |
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| 摘 要： | 用密度泛函B3LYP方法在6-311＋G**基组水平上对鸟嘌呤及顺(cis-)、反式(anti-)-6-烷基鸟嘌呤(O6-AlkylG)与DNA碱基(胸腺嘧啶T、胞嘧啶C、腺嘌呤A、鸟嘌呤G)的氢键二聚体结构进行了优化. 在MP2/cc-pVXZ(X＝D,T)// B3LYP/6-311＋G**水平上, 采用完全基组外推方法校正了氢键二聚体的相互作用能, 并用完全均衡校正法(CP)校正了基组重叠误差(BSSE). 在B3LYP/6-311＋G**水平上计算了各氢键碱基对的全电子波函数, 并用分子中的原子理论(AIM)分析了碱基间的弱相互作用. 计算结果显示, 鸟嘌呤6-O烷基化改变了碱基间的氢键作用模式, 使碱基对发生了明显的螺旋桨式扭转和不同程度的位移, 碱基间的电子密度分布和氢键作用能明显减小. O6-AlkylG对DNA碱基间的氢键作用是去稳定化的, 去稳定化影响的顺序为GC＞GG＞GA≈GT. 计算结果与文献给出的实验结论基本一致.
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| 关 键 词： | 鸟嘌呤 烷基化 DNA碱基 氢键 分子中原子理论(AIM) |
Theoretical Studies of the Hydrogen-bond Interactions between O6-Alkylguanine and DNA Bases |
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| Lin,Xuefei,Sun,Chengke,Yao,Lifeng,Chen,Yishan,Yang,Siya.Theoretical Studies of the Hydrogen-bond Interactions between O6-Alkylguanine and DNA Bases[J].Acta Chimica Sinica,2010,68(16):1553-1560. |
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| Authors: | Lin Xuefei Sun Chengke Yao Lifeng Chen Yishan Yang Siya |
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| Institution: | (School of Chemistry & Chemical Engineering, Qujing Normal University, Qujing 655000) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | guanine alkylation DNA bases hydrogen-bond atom in molecule (AIM) |
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