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分子构象的聚类是搜索分子动力学模拟轨迹中代表构象的主要方法。 它是分析复杂构象改变或分子间相互作用机制的关键步骤. 作为一种基于密度的聚类算法,密度峰值搜索算法因其聚类的准确度而被应用于分子聚类过程中. 但随着模拟时长的增长,密度峰值搜索算法较低的计算效率限制了其应用的可能. 本文提出K-means密度峰值搜索算法的聚类算法,它是密度峰值搜索算法在计算效率方面的一个扩展版本,用于解决密度峰值搜索算法中巨大的资源消耗问题. 在K-means密度峰值搜索算法中,首先,通过高效的聚类算法(例如K-means)进行初始聚类,得到的聚类中心被定义为具有权重的典型点. 然后,对加权的典型点通过密度峰值搜索算法实现二次聚类,并细化点为核心点、边界点、加细光晕点. 在与密度峰值搜索算法具有相似的精度的同时,计算复杂度由O(n2)降至O(n). 通过二面角,二级结构,关联图描述的分子构象,将KFDP用于多个模拟轨迹的聚类过程中. 并通过与K-means聚类算法,DBSCAN聚类算法的比较结果,验证了K-means密度峰值搜索算法的优势. 相似文献
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r×t阶Kirkman三连系构造的一种方法 总被引:9,自引:1,他引:8
侴万禧 《数学的实践与认识》2004,34(9):144-150
发现了 6n+3的高阶 Kirkman三连系构造方法 .阐明了 r× t阶 Kirkman三连系构造的基本理论 .给出了完全三分图的定义 ,并证明了关于 Kirkman三连系构造的命题 .介绍了 1 3 5阶 Kirkman三连系的构造过程 . 相似文献
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应用计算机模式识别技术研究微量元素与健康的关系 总被引:2,自引:2,他引:0
介绍了微量元素检测数据的一般统计方法,着重推荐应用计算机模式识别技术统计数据.文中介绍计算机模式识别技术的原理和作者应用该技术在微量元素科学的研究中取得的部分成果. 相似文献
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雷公滕的药效及毒性与微量元素的研究 总被引:2,自引:1,他引:1
雷公藤是一种药效大、毒性也大的中药。研究了雷公藤的28种无机元素,发现其有益元素铁、锰、锌、硒含量较高,其有害元素铅、砷、镉含量我高,与其药效和毒性一一相对应,雷公藤对风湿性关节炎、肾病、肝脏病、皮肤病的疗效,与铁、锰、锌、硒在人体中生物机理一致。雷公藤对消化道、心血管、肝脏、泌尿系统、造血系统的毒害作用,与铅、砷、镉在人体中的生物学效应一致。所以在使用雷公藤时,应考虑到微量元素作用,可提高雷公藤 相似文献
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两亲性聚酯配体及其钆(Ⅲ)配合物的合成和驰豫性能研究 总被引:2,自引:0,他引:2
通过二乙三胺五乙酸二酐分别与L-N,N-双(2-羟乙基)取代的丙氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸,亮氨酸、异亮氨酸和N,N-双(2-羟乙基)甘氨酸共聚,制备了六个大分子聚酯配体及其钆(Ⅲ)配合物。 相似文献