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利用Monte-Carlo模型并根据PDB提供的关于朊病毒氨基酸残基的原子坐标,对朊病毒蛋白质121-230位氨基酸的可及表面积(ASA)进行了计算和分析,讨论了相似的三维结构具有相近的可及性,并从PrP^c溶剂表面可及性特点分析了一些从PrP^c转变到PrP^Sc的可能信息。 相似文献
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分子伴侣GroE系统相互作用中结构与功能关系研究 总被引:2,自引:0,他引:2
根据大肠杆菌分子伴侣GroE系统的晶体结构数据,分析了GroEL顶端区域在其靶蛋白和GroES结合前后结构与功能的关系,讨论了GroEL的结构转变对其中心通道可及性和疏水特性的影响.提出了一种用以分析蛋白质之间相互作用趋势的方法,并用该方法分析了GroEL和GroES相互作用的3个氨基酸,得到了很好的结果。在此基础上,进一步用SwissPDBViewer对GroEL的核酸结合口袋进行了分析,结果表明活性中心与ADP磷酸键结合的残基Thr30可能与能量的传递有关. 相似文献
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