Mpro-C蛋白三维结构域交换的机理:来自分子模拟的线索

SARS coronavirus main protease (Mpro) is a key enzyme involved in the extensive proteolytic processing of the virus? polyproteins. The crystal structure of Mpro reveals that the enzyme exists in two different homo-dimeric forms: a three-dimensional (3D) domain-swapped form; and a non-3D domain-swapped form. The isolated C-terminal domain (Mpro-C) also forms a 3D domain-swapped structure similar to the ful-length protein. Unlike conventional 3D domain-swapped structures, in which the swapped regions are located on the surface, Mpro-C swaps a helix at the core of a folded domain. In this work, we used molecular dynamics simulations and 3D domain-swapping predictions to investigate how a highly buried core helix in the helix bundle structure of Mpro-C can be swapped. We found that both structure-and sequence-based methods failed to predict the location of the hinge loop in Mpro-C and Mpro. Extensive molecular dynamics simulations were performed to investigate the structural properties of the unfolded monomer and the 3D domain-swapped dimer of Mpro-C. We found that, although the swapped region was buried in the native state, it was exposed in the unfolded monomer. Our results suggest that the opening of the swapped region in the ful y or partial y unfolded state may promote interactions between monomers and the formation of domain-swapped dimers.     

浅谈物理教学中学习兴趣的培养

物理学是研究物理最基本的运动形式及物质基本结构一门学科,它是学生学习其他学科的基础。学好物理,对学生进一步学习自然科学和其他学科将有很大的帮助。然而,学生普遍感觉物理比较难,不好学,因此,有不少学生对学习物理产生畏惧和厌倦情绪。若能在教学中培养学生学习物理的兴趣,激发学生求知欲,消除学习障碍,学生就能主动地去学习物理,全身心的投入到物理中去,会怀着一颗求知的心去探索物理这个美妙的世界,从而,为学生学好物理奠定基础。     

桔全爪螨几丁质合成酶基因克隆与序列

以桔全爪螨Panonychus citri(MeGregor)为研究对象,利用RT-PCR和SMART RACE技术克隆获得其几丁质合成酶基因的全长cDNA序列(命名为PcCHS,GenBank登录号为KM242063),并利用生物信息学方法对序列进行分析。结果表明:桔全爪螨几丁质合成酶PcCHS基因的cDNA全长为4 925bp,其中5’非翻译区(5’-UTR)为155bp,3’非翻译区(3’-UTR)为345bp,开放阅读框(ORF)包含4 425bp,编码1 474个氨基酸,预测其蛋白质分子质量约为168.43kD,理论等电点为6.83。其包含EDR和QRRRW这2个几丁质合成酶基因的标签序列。ExPASy在线分析表明,PcCHS具有15个跨膜螺旋、4个糖基化位点。推导的氨基酸序列同源性分析结果表明:桔全爪螨与二斑叶螨相似度为89%,其次为西方盲走螨,相似度为55%。分子系统进化的结果也表明桔全爪螨与二斑叶螨和西方盲走螨的进化关系最近。     

基于聚酰亚胺基底的细胞电融合芯片的研制

基于柔性印刷电路板(flexible printed circuits board, FPCB)技术,通过在聚酰亚胺基底薄膜表面层压的铜箔上刻蚀微电极阵列结构制备了一种细胞电融合芯片.在低电压(≤40 V)条件下实现了细胞电融合,融合效率达37%,远高于聚乙二醇(polyethylene glycol, PEG)法及传统细胞电融合方法.与传统细胞电融合系统相比,此芯片可在低电压条件下工作,具有结构简单、成本低廉、实验过程可观察、融合通量高等优点.另外,聚酰亚胺薄膜基底良好的柔软度可保证此芯片与其它分析模块(如细胞筛选分离模块)的有效集成,具备构造微全分析系统(micro total analytical system, μ-TAS)的巨大潜力.     

温度对普通肉食螨生长发育和存活率的影响

普通肉食螨在16～32℃温度范围内，各螨态的发育历期随着温度的升高而缩短，发育速率随温度的增高而加快；在适宜温区范围内，Logistic模型能较客观地反映普通肉食螨各螨态的发育速率与温度的关系；采用直线回归法和直接最优法，得出普通肉食螨各螨态的发育起点温度和有效积温；在16～24℃之间，从卵发育到成螨的世代存活率随温度的升高而增高，在24～32℃之间，存活率随温度的升高而降低，存活率在24℃最高，为81．3％，在32℃时最低，为17．1％。     

几种粉螨同工酶比较及亲缘关系初探

以5种粉螨为实验材料，以普通肉食螨和桔全爪螨为对照，采用垂直板型聚丙烯酰胺凝胶电泳法（PAGE），对常见同工酶EST、MDH、ADH、CAT等进行比较研究。结果表明：不同种类粉螨间的酶带具有多样性，存在不同程度的相似相异性，为粉螨的分类鉴定提供了佐证，利用相似系数初步分析了几种粉螨间亲缘关系的远近。     

沼螨属一新种描述（蜱螨亚纲：绍螨科）

描述了采自江西的沼螨属1新种：三裂沼螨Limnesia(Limnesia)trifurcata,新种的模式标本保存于南昌大学生物科学工程系。     

中国粉螨属已知种简述及其检索

列出中国粉螨属AcarusL.6个已知种在国内的分布及其食性和栖息地等,并列出成螨检索表。     

东方钝绥螨空间分布型及抽样技术的研究

应用扩散型指标,Taylor幂法则和lwao m——x回归分析法,分析了东方钝绥螨在柑桔园的分布型。结果表明,东方钝绥螨在柑桔园呈聚集分布。其最适抽样数N=7.34+31.357 5 x1/2,利用该螨释放防治叶螨的序贯抽样的上下限T0（N）=4.2276N±6.3663 N1/2 .     

中性线修正型变截面梁类构件压电控制

传统绝对节点坐标法(absolute nodal coordinate formulation,ANCF)在变截面梁类构件建模过程中常以几何中位线等效构造单元中性线,难以对变截面单元位移场状态进行精确描述.为解决此类问题,本文以中细型变截面梁类构件为研究对象,深入考虑变截面结构几何因素及复合材料属性对变截面梁类构件中性...