新的α/β水解酶W14和W15的三维结构模建及分子对接研究

利用同源模建和分子动力学模拟方法, 模建了两个新发现的α/β水解酶超家族成员W14和W15的三维结构, 并通过与α-醋酸萘酯的对接研究, 从理论上提出Gly82和Val13为形成“氧洞”的关键残基,有利于稳定水解过程中的带负电的过渡态, 以及其它对复合物形成起到重要作用的氨基酸残基.     

以蛋白质为基础模拟谷胱甘肽过氧化物酶

硒元素作为一种生命体中必须的微量元素,与人类的健康和疾病息息相关.硒元素主要以硒代半胱氨酸的形式存在于至少25种硒蛋白中,执行着多种生物功能.在这20多种硒蛋白中,谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)作为一种主要的抗氧化酶,能够有效地利用谷胱甘肽还原氢过氧化物以防止机体的氧化损伤.这里,我们主要介绍以蛋白质为骨架构筑GPx模拟物的一些策略和方法,以期望于能够更好的理解硒蛋白的生物学性质,甚至开拓更为有效的技术去模拟这种抗氧化酶.     

蛋白质功能化新策略:嵌入非天然氨基酸

天然蛋白质由20种天然氨基酸组成,这些蛋白质的构筑基元包含功能基团:羧基、氨基、巯基、硫醚、羟基、碱性胺、烷基和芳基。然而,这些有限的功能基团却不足以完成生物体内所有的生物学功能。为了更好地让生命的体现者--蛋白质完成更加精确和多样的生物学功能,自然界会对蛋白质进行翻译后的修饰,包括:磷酸化,甲基化,乙酰化或者羟基化,甚至在某些情况下,进化出一种新型的翻译机制以便插入硒代半胱氨酸或者吡咯霉素。受此启发,生物化学家发展出各种生物或化学方法来改变或插入新的蛋白质构筑基元,使天然蛋白质完成其相应的生物学功能或者使其具有某些特殊的性质,甚至是创造一种新酶。该文将简单介绍这些蛋白质修饰策略以及该领域的最新进展。     

以蛋自质为基础模拟谷胱甘肽过氧化物酶

硒元素作为一种生命体中必须的微量元素,与人类的健康和疾病息息相关.硒元素主要以硒代半胱氨酸的形式存在于至少25种硒蛋白中,执行着多种生物功能.在这20多种硒蛋白中,谷胱甘肽过氧化物酶( GPx)作为一种主要的抗氧化酶,能够有效地利用谷胱甘肽还原氢过氧化物以防止机体的氧化损伤.这里,我们主要介绍以蛋白质为骨架构筑GPx模...