HDAC对接研究:苯甲酰胺类抑制剂结合方式推测

通过计算机模拟的对接过程研究，发现了MS-275— 一种苯甲酰胺类的组蛋白去乙酰酶（HDAC）抑制剂与酶的可能的全新结合方式.这种结合方式与已经阐明的组蛋白去乙酰酶类似蛋白（HDLP）与曲古柳菌素A(trichostatin A, TSA)和suberoylanilide hydroxamic acid(SAHA)形成的复合物晶体结构中配体与酶的作用方式完全不同.从对接结果看，MS-275的作用靶点在酶活性口袋的最狭窄部位，而不是直接作用于锌离子.这似乎能够解释MS-275的低毒性特点，并且为设计和筛选全新的HDAC抑制剂提供了新思路.     

5-[{4-[2-(5,6,7,8-四氢-5,5,8,8-四甲基)萘氧-2-基]乙氧基}苄基]-2,4-噻唑烷二酮的合成

以2,5-二甲基-2,5-己二醇为原料,经氯化、傅一克反应、烷化、Knoevenagel缩合、还原反应制得5-【{4-[2-(5,6,7,8-四氢-5,5,8,8-四甲基)萘氧-2-基]乙氧基}苄基】-2,4．噻唑烷二酮,其结构经元素分析,IR和1H NMR证实。总收率6．3％。