简化的系统搜索法及其在构象分析中的应用

多肽的构象研究除了可以用X-射线晶体学及二维核磁共振等实验方法外,理论计算的方法有系统搜索法、蒙特卡洛方法、距离几何方法、分子动力学方法及能量极小化等.系统搜索法具有构象空间搜索彻底的特点,相对来说找到系统整体极小值的可能性较大,但由于其计算量较大,对于多肽及蛋白质很难实现.我们对系统搜索法进行了简化,不是同时旋转所有的二面角,而是成对地进行,以迭代的方法达到收敛,最后得到可能的构象.     

两个有抗惊活性的取代吡唑烷酮分子结构

用X射线衍射方法测得两个有抗惊活性的3-吡唑烷酮化合物(1:1-丁基-5-对氟苯基-3-吡唑烷酮, 2:1-丙基-5-对甲基苯基-3-吡唑烷酮)的分子结构, 并用CNDO/2方法计算了它们的原子净电荷。结果表明R^1取代基的推电子能力影响3-吡唑烷酮主体分子骨架五元环中共轭酰胺体系的C-N和C-O键长以及电子云分布。增大R^1的推电子能力有利于抗惊活性的增加。而R^5取代基主要影响分子的疏水性及分子形状。