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报道了在室温条件下利用pcff力场和Rattlebond法对 β 环糊精 (β CD)和对 甲基苯酚形成的 1∶1CD包结物溶解在 4 2 7个水分子中形成的纳米水滴在 2 0 0 ps时间间隔内进行约束动力学模拟的结果 ,并与真空下的CD包结物进行了比较 .结果表明 ,在模拟时间内 ,CD包结物在水滴中和真空中是稳定的 .通过对径向分布函数 (rdf)的计算发现 ,在模拟时间内 ,没有一个水分子进入环糊精包结物腔体内 ,用约束动力学模拟方法证实了CD腔体确实具有疏水作用 .模拟研究还发现 ,水滴中环糊精的亲水外侧确实存在明显的由氢键引起的水化作用 ,与环糊精的性质相吻合 ;对 甲基苯酚的酚羟基在水滴中与水分子间存在明显的氢键作用 ,而在真空中则与 β CD的宽口处的O3间存在明显的氢键作用 ,这使得客体在水滴中插入CD中的深度要浅于在真空中的情形 .实验模拟结果说明 ,可以利用约束动力学的方法来研究水溶液体系的动力学行为 . 相似文献
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纳米水滴及真空中β-环糊精和对-甲基苯酚1:1包结物的约束动力学模拟研究 总被引:1,自引:0,他引:1
报道了在室温条件下利用pcff力场和Rattle bond法对β-环糊精(β-CD)和对-甲基苯酚形成的1:1 CD包结物溶解在427个水分子中形成的纳米水滴在200ps时间间隔内进行约束动力学模拟的结果,并与真空下的CD包结物进行了比较.结果表明,在模拟时间内,CD包结物在水滴中和真空中是稳定的.通过对径向分布函数(rdf)的计算发现,在模拟时间内,没有一个水分子进入环糊精包结物腔体内,用约束动力学模拟方法证实了CD腔体确实具有疏水作用.模拟研究还发现,水滴中环糊精的亲水外侧确实存在明显的由氢键引起的水化作用,与环糊精的性质相吻合;对.甲基苯酚的酚羟基在水滴中与水分子间存在明显的氢键作用,而在真空中则与β-CD的宽口处的O3间存在明显的氢键作用,这使得客体在水滴中插入CD中的深度要浅于在真空中的情形.实验模拟结果说明,可以利用约束动力学的方法来研究水溶液体系的动力学行为. 相似文献
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正十六烷体系凝固过程的分子动力学模拟 总被引:7,自引:0,他引:7
采用分子动力学模拟的方法,根据体系热容和自扩散系数的突变,计算了正十六烷体系以及正十六烷和降凝剂α-辛基萘、α-十二烷基萘及α-十六烷基萘等α-烷基萘混合体系的凝点,凝点降低结果与实验值相一致.用径向分布函数及末端距离分布对凝固温度附近体系的微观结构变化进行了研究.结果表明,凝固过程中正十六烷分子倾向于转变成为全反式的构象,以利于分子间平行有序的排列,这和熵减小的原理相一致.结合正十六烷的构象变化,探讨了烷基萘降凝的机理. 相似文献
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