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1.
In cancer genomics, gene expression levels provide important molecular signatures for all types of cancer, and this could be very useful for predicting the survival of cancer patients. However, the main challenge of gene expression data analysis is high dimensionality, and microarray is characterised by few number of samples with large number of genes. To overcome this problem, a variety of penalised Cox proportional hazard models have been proposed. We introduce a novel network regularised Cox proportional hazard model and a novel multiplex network model to measure the disease comorbidities and to predict survival of the cancer patient. Our methods are applied to analyse seven microarray cancer gene expression datasets: breast cancer, ovarian cancer, lung cancer, liver cancer, renal cancer and osteosarcoma. Firstly, we applied a principal component analysis to reduce the dimensionality of original gene expression data. Secondly, we applied a network regularised Cox regression model on the reduced gene expression datasets. By using normalised mutual information method and multiplex network model, we predict the comorbidities for the liver cancer based on the integration of diverse set of omics and clinical data, and we find the diseasome associations (disease–gene association) among different cancers based on the identified common significant genes. Finally, we evaluated the precision of the approach with respect to the accuracy of survival prediction using ROC curves. We report that colon cancer, liver cancer and renal cancer share the CXCL5 gene, and breast cancer, ovarian cancer and renal cancer share the CCND2 gene. Our methods are useful to predict survival of the patient and disease comorbidities more accurately and helpful for improvement of the care of patients with comorbidity. Software in Matlab and R is available on our GitHub page: https://github.com/ssnhcom/NetworkRegularisedCox.git.  相似文献   
2.
基于GWR模型的河南省人口分布的影响因素研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
近年来,人口作为一种基本信息已成为目前研究的热点问题之一.人口分布可能受自然,经济,社会,政治等诸多因素的影响.因此,人口分布的研究对于了解不同类型区域的人口资源与经济发展之间的关系,因地制宜地发展本地经济具有重大意义.课题以河南省统计年鉴数据为基础,研究河南省人口分布的影响因素.具体来说,首先利用Surfer软件的可视化技术研究了河南省人口数量的空间变化特征.其次,利用近年来发展起来的地理加权回归模型对河南省人口分布的影响因素进行了定量分析.通过上述分析提取有效信息,从而为制定合理的人口政策和实现人口的有序流动提供必要的理论支持.  相似文献   
3.
应用便携式X射线荧光光谱仪(PXRF)分别在原位和实验室条件下对53个土壤样品中的Cu,Pb,As,Cr,Ni和Zn等重金属进行测定,并与原子吸收/原子荧光法测定值进行对比,建立一元线性回归模型分析PXRF数据质量。通过测定土壤样品原位含水量并选取部分样品进行室内水分定量实验,分析土壤水分对于PXRF测定结果的影响。结果表明,PXRF检出限分别为Cu:10.6mg·kg-1,Pb:8.1mg·kg-1,As:5.7mg·kg-1,Cr:22.5mg·kg-1,Ni:21.6mg·kg-1,Zn:10.4mg·kg-1;原位测定时Pb,Cr,Ni和Zn可以达到定量水平;经过风干磨细处理,Cu,Pb,Cr,Ni和Zn在实验室条件下可以达到定量水平,说明X射线荧光光谱法适用于土壤重金属的快速测定与评价。水分对于PXRF测定结果具有"稀释"作用,原位条件下土壤含水量<15%时与>25%时样品的平均相对误差分别为-17%与-31%;实验室条件下土壤含水量从风干土水平提高到30%,测定的平均相对误差由10%变为-24%。土壤水分升高可能会导致数据质量和准确性降低,建议原位测定时控制土壤含水量在25%以内。  相似文献   
4.
In this paper we introduce the nonparametric AR(1)–ARCH(1) model and show weak consistency of the Nadaraya–Watson estimators for the model. We propose a residual and a wild bootstrap method and prove weak consistency of the bootstrap estimators.  相似文献   
5.
Correlation functions of a driven two‐level system embedded in a photonic crystal are analyzed. The spectral density of the photonic bands near a gap makes this system non‐Markovian. The equations of motion for two‐time correlations are derived by two different methods, the quantum regression theorem and the fluctuation dissipation theorem, and found to be the same.  相似文献   
6.
7.
李萍  郭瓦力 《分析试验室》2011,30(6):103-105
根据实验得出的乙二醛、乙醛酸、草酸三组分混合物中各组分在特定波长下呈现出的良好的线性关系,建立起三组分质量浓度与混合吸光度的回归方程组,形成了多波长线性回归-矩阵法,实现了乙二醛氧化制备乙醛酸体系中反应产物乙二醛、乙醛酸、草酸含量的同时测定.研究结果表明:当乙二醛检测下限为1.024 mg/L时,回收率为94%~98%...  相似文献   
8.
Hydrophilic-interaction liquid chromatography (HILIC), reversed-phase chromatography (RPC) and porous graphitic carbon (PGC) chromatography are typically applied for liquid chromatographic separations of protein N-glycans. Hence the performances of these chromatography modes for the separation of fluorescently labeled standard glycan samples (monoclonal antibody, fetuin, ribonuclease-B) covering high-mannose and a broad range of complex type glycans were investigated. In RPC the retention of sialylated glycans was enhanced by adding an ion-pairing agent to the mobile phase, resulting in improved peak shapes for sialylated glycans compared to methods recently reported in literature. For ion pairing RPC (IP-RPC) and HILIC ultra-high performance stationary phases were utilized to maximize the peak capacity and thus the resolution. But due to the shallow gradient in RPC the peak capacity was lower than on PGC. Retention times in HILIC and IP-RPC could be correlated to the monosaccharide compositions of the glycans by multiple linear regression, whereas no adequate model was obtained for PGC chromatography, indicating the significance of the three-dimensional structure of the analytes for retention in this method. Generally low correlations were observed between the chromatography methods, indicating their orthogonality. The high selectivities, as well as the commercial availability of ultra-high performance stationary phases render HILIC the chromatography method of choice for the analysis of glycans. Even though for complete characterization of complex glycan samples a combination of chromatography methods may be necessary.  相似文献   
9.
提出了一种用紫外光度法同时测定盐酸西替利嗪和苯甲酸钠的方法.在pH 4.56的B-R缓冲溶液中对盐酸西替利嗪和苯甲酸钠两组分混合溶液进行吸光度测定,所得的重叠光谱数据用主成分回归法(PCR)和偏最小二乘法(PLS)等化学计量学方法进行处理,结果表明主成分回归(PCR)的预报误差最小.对实际样品进行测定,回收率为88.8...  相似文献   
10.
彩色打印机特性化多元回归模型的研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
多元回归法是彩色打印机特性化普遍采用的方法,实验对影响多元回归精度的阶数、色空间选择、以及训练样本选取进行了研究.研究结果表明:(1)二、三、四阶的特性化精度分别在10.9±0.3、6.6±0.2、6.0±0.2个CIELAB色差单位;(2)回归模型采用RGB到CIELAB或CIEXYZ的预测精度基本相同,大概相差1个...  相似文献   
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