L-leap-accelerating the stochastic simulation of chemically reacting systems

Presented here is an L-leap method for accelerating stochastic simulation of well-stirred chemically reacting systems,in which the number of reactions occurring in a reaction channel with the largest propensity function is calculated from the leap condition and the number of reactions occurring in the other reaction channels are generated by using binomial random variables during a leap.The L-leap method can better satisfy the leap condition.Numerical simulation results indicate that the L-leap method can obtain better performance than established methods.     

利用提升小波的蛋白质相互作用特征提取

利用提升小波从蛋白质序列中提取出它们相互作用的频谱特征,经支持向量机训练学习后,用于预测蛋白质间的相互作用.模拟计算结果表明,在阳性数据和阴性数据平衡的前提下,利用提升小波获取的低维蛋白质相互作用特征向量可以得到较高预测精度.进一步阐述了不同物种的蛋白质相互作用网络有着不同特征,为了得到更准确的预测结果,需要利用不同的方法提取蛋白质相互作用的特征.     

模拟化学反应系统的快速无偏τ-Leap算法

化学反应系统中的Leap算法可在获得较好精度的同时大幅提高模拟速度.最近提出的无偏Leap方法有效地克服了由Leap时间区间内的反应次数的近似均值与真实均值之间的偏差引起的Leap算法的误差的不足.本文讨论了一个基于物种相对改变估计真实均值的快速无偏T-Leap算法,并将该算法推广到模拟时滞化学系统中.该快速算法具有易于编码、比前者更快等优点.当系统中的反应通道或物种的数目较大时,该方法具有更明显的速度优势.     

模拟时滞化学反应系统的自适应τ-Leap算法

本文发展了一种模拟时滞化学反应系统的自适应τ-Leap算法（DAr—Leap）．该算法将后验τ-Leap算法应用到时滞化学反应系统，能够自动调节τ使得在时间区间[t，t＋τ）内发生多次反应事件并且精确地满足Leap条件，从而避免了负分子数目的产生，较大地提高了模拟速度．     

凝胶渗透色谱结合气相色谱-负化学源质谱法分析鱼肉及鱼油中的多溴联苯醚和得克隆阻燃剂

建立了凝胶渗透色谱(GPC)结合气相色谱-负化学源质谱(GC-NCI/MS)检测鱼肉及鱼油中8种多溴联苯醚(PBDEs)同系物及2种得克隆阻燃剂(DP)的分析方法。试样中加入内标物BDE-77和13C12-BDE-209后进行索氏提取,提取液经自动GPC系统除脂,多层硅胶层析柱净化后,在15 m长的毛细管气相色谱柱上分离,NCI/MS以选择离子监测方式检测目标化合物。以鱼肉样品为基质,当PBDEs的加标水平为0.2 ng/g和2 ng/g、BDE-209和DP的加标水平相应提高10倍时,其平均加标回收率为71.1%～121.4%,相对标准偏差为2.96%～13.31%(n=5);以信噪比(S/N)为3计算方法的检出限(LOD)为2.2～39.8 ng/kg。用该方法检测市售鱼肉及鱼油样品,其中多溴联苯醚总含量为2.18～15.93 ng/g,以BDE-209、BDE-47为主,两种DP均未检出。该方法准确、灵敏度高,能够满足富含脂质的动物性样品中痕量DP和PBDEs残留的分析要求。     

随机模拟化学反应系统的加速L-leap算法

提出了随机模拟化学反应系统的加速L-leap算法,该算法根据leap条件确定具有最大倾向函数的反应通道的反应次数,并利用二项分布随机数生成其它反应通道在当前leap时间区间内的反应次数．L-leap算法可更好地满足leap条件．数值模拟实验表明该算法能取得更好的模拟性能．     

一类带小参数的二维反应扩散型方程组的数值方法

本文讨论了一类带小参数的二维反应扩散型方程组的数值方法，基于奇摄动理论，Ｇｒｅｅｎ函数、分裂方法和半群理论，建立这种类型方程组的计算格式，在误差分析中，运用了不等距步长的可行等距度，并将Ｌｏｒｅｎｚ的技巧用于估计解的性状，最后，得到了不安ｌ１「Ω」模意义下以Ｏ（ｈ＋ｌ＋△ｔ）的速度一致收敛。     

模拟化学反应系统的快速无偏T-Leap算法

化学反应系统中的Leap算法可在获得较好精度的同时大幅提高模拟速度.最近提出的无偏Leap方法有效地克服了由Leap时间区间内的反应次数的近似均值与真实均值之间的偏差引起的Leap算法的误差的不足.本文讨论了一个基于物种相对改变估计真实均值的快速无偏T-Leap算法,并将该算法推广到模拟时滞化学系统中.该快速算法具有易于编码、比前者更快等优点.当系统中的反应通道或物种的数目较大时,该方法具有更明显的速度优势.     

基于CCH的SVM几何算法及其应用

支持向量机(support vector machine(SVM))是一种数据挖掘中新型机器学习方法.提出了基于压缩凸包(compressed convex hull(CCH))的SVM分类问题的几何算法.对比简约凸包(reducedconvex hull(RCH)),CCH保持了数据的几何体形状,并且易于得到确定其极点的充要条件.作为CCH的实际应用,讨论了该几何算法的稀疏化方法及概率加速算法.数值试验结果表明所讨论的算法可降低核计算并取得较好的性能.     

钡原子6s~2、5d~2、6p~2组合的电子相关效应及其组合相互作用

用模型势方法和斯莱特-高登(Slater-Condon)理论计算了钡原子偶宇称6s~2,5d~2,6p~2电子组合、角动量J=0,1,2的双激发能级的激发能和组合相互作用(configuration interaction)。结果表明,6s~2,5d~2和6p~2组合在~1S_0态中强烈地混合,使常规能级标识符号失去意义。另外,我们的结果也从理论上证明了曾引起争议的6p~(21)S_0能级是位于第一电离势之上的自由离能级。