菌类多糖链构象及其表征方法研究进展 （专题报道）

 概述了菌类多糖在溶液中链构象及其表征方法的研究进展.主要报道从各种真菌（香菇、茯苓、灵芝、木耳、黄单胞菌、裂褶菌等）中提取的多糖在溶液中的分子量、分子形态和尺寸,即链构象.同时介绍多糖链构象对生物活性的影响,并且指出多糖刚性链带电基团及适量分子量有利于促进它与免疫细胞上受体结合,从而抑制肿瘤细胞增殖.由此表明,多糖链构象的研究对弄清其生物功能和推动生命科学发展十分重要.多糖在溶液中主要以无规线团、双螺旋、三螺旋、蠕虫状、棒状链以及聚集体构象存在,它取决于单糖组成、糖苷键、支链结构以及分子内和分子间作用力.测定链构象的方法主要包括光散射、黏度、显微技术（透射电镜,扫描电镜以及原子力显微镜）、微量热法和小角X-射线散射等.此外,介绍了多糖溶液理论以及计算链构象参数的表达式.     

DNA分子结构的多态性研究：（Ⅱ）吖啶橙凝聚体变化诱导的质粒DNA？…

利用吸收光谱和荧光光谱方法，研究了吖啶橙（ＡＯ）与质粒ＤＮＡ水溶液，以及含胶束介抽的吖啶橙与质粒ＤＮＡ溶液体系的相互结合作用及减色效应。结果表明：吖啶橙时质粒ＤＮＡ的吸收光谱有减色效应；含十二烷基硫酸钠（ＳＤＳ）的ＡＯ水溶液体中，随着ＳＤＳ浓度的增加，其光谱结果表明由凝聚态向单体的转化。而在含十二烷基硫酸钠（ＤＳ）的ＡＯ与质粒ＤＮＡ溶液体系中，吖啶橙凝聚态随ＳＤＳ浓度的增加，对ＡＯ与质粒ＤＮＡ相互     

How Many Methanol Molecules Can Solvate a Glycine: a PBE1PBE Approach

Microsolvation of glycine in methanol clusters is explored by the use of DFT calculation method. The lowest energy conformations within 16.72 kJ·mol-1 of the glycine clustering with one to six methanol molecules, which are obtained at the B3LYP/6-31+G(d) level of theory, are reoptimized at PBE1PBE/6-311+G(d,p). The calculated results agree with our previous results with B3LYP (Chin. J. Chem. Phys. 22 (2009) 577) that the clusters of two forms (Z-and N-form) tend to be isoenergetic when the number of the solvate molecules reaches six. Furthermore, this result is in good agreement with the experiment of the tryptophan-methanol clusters, implying that the present treatments are reasonable and reliable. The results also indicate that nine methanol molecules are not enough to fully solvate a glycine molecule, and a tentative estimation is obtained that ten methanol molecules may fully solvate a glycine molecule, which consists with the experiment results.     

2004年拉曼光谱学国际会议(Ⅱ)

大会上宣读的论文还有 :(35 )YHuang,应用傅里叶转换 拉曼光谱技术研究沸石主体中客体分子的构象性能 ;(36)HMohaptra ,液 液界面的高分辨率近场测定的初步探索 ;(37)HTori,在氢键合的肽体系中酰胺Ⅰ模式的振动相互作用 ;(38)FRull,缩影图的显微拉曼光谱分析—西班牙Val adolid     

抑前胸腺肽溶液构象的2D NMR初步分析

抑前胸腺肽PTSP是一种重要的新发现的昆虫神经肽,能够在体内和体外条件下抑制促前胸腺素PTTH对蜕皮激素合成的促进作用.实验材料PTSP以固相方法合成.用2D NMR技术来考察PTSP的DMSO-d6溶液,并记录COSY,NOESY和13C HMQC-COSY谱用于构象分析.利用2D COSY和NOESY归属了1H NMR谱的全部共振峰;再利用HMQC-COSY使全部αC和βC共振峰也得到了归属.分析得到肽链的1H和13C的化学位移和质子间的NOE,结果表明PTSP在DMSO-d6中构象最有可能为无规卷曲.此构象可能是PTSP与其受体结合前,邻近前胸腺腺体细胞膜表面时的一种状态,而柔性无规蜷曲或许满足了两者正确结合的条件.     

测定核间距的不对称2D NOESY方法2.Cis-Pt(NH3)2(Guo)2Cl2的不对称2D NOESY实验研究

应用不对称2DNOESHY实验方法研究了顺铂配合物Cis-Pt (NH₃)₂(Guo)₂Cl₂的水溶液中的构象,表明鸟苷同铂配合后其糖环构象发生明显的变化。     

由NMR获取原子间距离约束计算蛋白质三维结构

提出一种以核磁共振(NMR)技术获取蛋白质分子多肽链中原于对(主要是H—H对)的距离约束,来计算蛋白质在溶液中的三维结构的方法。这种方法把肽平面之间的二面角当作独立变量,通过从局部到整体逐渐最优化的方法使适当构造的目标函数最小,计算出这些二面角,以及主链每个残基上六种原子N、H~N、C~α、H~α、C′、O的空间坐标.本方法已编写成计算程序DISNMA,并以碱性胰蛋白酶抑制剂(BPTI)为标准结构,得到了很好的验证.     

二维相关光谱法及其在蛋白类物质分析中的研究进展

二维相关光谱法是将特定形式的微扰作用于样品,通过测定一系列扰动作用下的动态光谱,结合数学相关分析,获取与样品中分子结构及作用力相关的二维相关谱特征。该方法主要基于分子振动光谱,将一维光谱扩展到二维空间,能有效提高光谱分辨率,从而识别原始光谱中重叠的分子振动变化特征,为研究分子内及分子间的化学键变化提供依据,在生物医学、药学、食品科学、环境科学以及高分子材料等领域应用广泛。自1986年Noda提出广义二维相关算法以来,二维相关光谱衍生出了投影二维相关、串联二维相关、基于模型的二维相关、异质谱二维相关、移动窗口二维相关等算法。随着近年来生物技术的迅速发展,多肽、蛋白质、酶等蛋白类物质由于参与人体重要生理化学反应过程,对其结构(尤其是高级构象)的分析是研究蛋白类物质质量及疗效的关键。二维相关光谱方法为生物医药中蛋白类物质结构研究提供了快速、无损的定性定量分析方法,可分析蛋白质类物质高级结构中的细微变化,为生物大分子药物机制机理研究提供有力的支撑。综述了二维相关光谱技术的基本原理、谱图解析方法和技术进展,以及其在蛋白类物质分析中的应用方向和前景,为相关领域研究人员应用二维相关光谱法开展蛋白类物...     

表面增强拉曼散射光谱研究聚苯胺纳米棒的构象转变

采用电化学沉积法制备了聚苯胺(Polyaniline,PANI)纳米棒、树枝状银和纳米颗粒银基体。并利用表面增强拉曼散射光谱技术(Surface-enhanced Raman Scattering,SERS)研究了PANI纳米棒的分子链在Ag金属表面的构象变化。实验结果表明由于Ag金属表面的等离子共振效应,PANI分子中N原子的孤对电子与Ag的自由电子产生共轭效应,使得PANI分子链上的电荷重新分布,结果 C—H面内弯曲振动频率和C—C键的伸缩频率向低波数方向移动(蓝移);拉曼散射频率增强的基团在金属表面倾向垂直于分子链的主轴,拉曼散射频率减弱的基团在金属表面倾向平行于分子链主轴。