脱氢延胡索碱氯合物的分子结构和晶体结构

本文证明生物碱脱氢延胡索碱(Dehydrocrydaline)氯合物(C_(22)H_(24)NO_4HCl)的晶体属正交晶系,空间群:D_(2h)~(14)—P_(bcn),晶胞参数:a=8.52_6A,b=23.31_7A,c=24.79_8A,单位晶胞中分子数:z=8.用直接法导出全部非氢原子位置,经最小二乘法修正和差值Fourier逼近发现晶体中每个不对称单位内存在4.5个具有不同占有率的水分子.进一步修正后,最终偏离因子R=0.053. 晶体中的水分子以氯离子为中心缔合成颇为庞杂的水网结构. 文中对脱氢延胡索碱分子的结构特点和水网结构以及两部分结构的关系进行了讨论。     

1.9分辨率(D-Ala)~(B_0)猪胰岛素晶体结构的研究

本文应用差值Fourier技术和制约立体化学参数最小二乘技术以二锌猪胰岛素模型为起点测定了1.9分辨率的(D-Ala)~(B0)猪胰岛素晶体结构,R因子为0.211,键长均方差为0.057。B_0残基的电子密度表现清晰。B_0的引入降低了B链N端肽段构象的运动性,使分子在晶体中的堆积更加紧密。(D-Ala)~(B0)猪胰岛素和二锌猪胰岛素结构的主要差异在于分子可能的受体结合表面中部分极性基团的构象和分子IA链两段螺旋的组装。(D-Ala)~(B0)猪胰岛素B链N端晶体学微环境与(Trp)~(B1)猪胰岛素和去B_1牛胰岛素有很大的差异。本文还简单地讨论了胰岛素分子结构与免疫功能的关系。     

生物分子水溶液的Monte Carlo模拟——丙氨酸溶液

本文对由五十六个水分子包围一个中性的丙氨酸分子所构成的分子集团做了MC模拟计算。求出了水—水和氨基酸—水的平均相互作用能。将丙氨酸分子周围的空间划分为三个区域——羧基区、氨基区和甲基区。分别以羧基碳、氨基氮和甲基碳作为中心原子,统计了各区中水—水和水—氨基酸相互作用能随着水分子中的氧原子和该区中心原子的距离而改变的函数,各区中水分子偶极矩的取向关联函数以及水分子中氧原子和氢原子的径向分布函数。此外,还计算了各区第一个水化层的水分子数和整个丙氨酸分子第一个水化层的水分子数。     

光合细菌Rhodopseudomonas palustris捕光天线LH2中类胡萝卜素分子间三重态能量传递的光谱学证据

紫色光合细菌Rhodopseudomonas (Rps.) palustris的外周捕光天线LH2含有多种类胡萝卜素分子(Car), 研究多种共存的Car的生理学功能具有重要意义. 文中采用纳秒时间分辨吸收光谱手段分别在生理学温度(室温)和低温(77 K)下研究了Car三重激发态(³Car^*)的动力学行为. 在用纳秒光脉冲选择性地激发Car后记录到其宽带、非对称的三重态吸收(T_n←T₁)光谱, 这一光谱特征是由含不同C = C共轭双键数目(N)的Car所致. 不同Car对T_n←T₁吸收谱的贡献在室温下严重交叠, 在低温下却可以清晰辨别. 在室温下T_n←T₁吸收峰的短波侧随探测光延时的增加而变窄, 历经约1 μs达到光谱平衡, 但在低温下同样的光谱动力学却并不显著. 上述光谱动力学变化被解释为不同Car间的激发态平衡过程. 对室温下的时间分辨光谱的全局分析(Global Analysis)分离出峰值波长在545和565 nm的两个主要光谱组分, 分别被指认为N = 11和13的Car的T_n←T₁吸收光谱. 短波长组分的寿命为0.72 μs(空气饱和样品)和1.36 μs(生物除氧样品), 而对应的长波长组分的寿命为2.12和3.75 μs. 这种N小的Car寿命短的反常行为表明不同共轭链长度的Car间可能存在着三重激发态能量传递, 由此推测Rps. palustris的LH2中单个α, β-亚基内存在两种不同共轭长度的Car.     

裸露金属簇状化合物K_4Pb_xSn_(9-x)的~(119)Sn、~(207)Pb多核核磁共振研究

本文对乙二胺溶液中裸露金属原子簇用~(119)Sn及~(207)Pb核磁共振作了研究。对每个峰做了标识。根据谱线强度进行分析,得知溶液中锡与铅的比例大于固体中的比例。从自由能的角度看,Pb_2Sn_7~(4-)是最不稳定的一种原子簇,本文还对谱线中各条线都进行了理论拟合,结果与实验相吻合。     

苝醌类光敏剂构象的分子力学研究

用分子力学方法,计算了苝醌类光敏剂竹红菌甲素(HA),乙素(HB)等不同构象的生成热及酚羟基质子解离前后生成热的变化.发现:(1)1(1)HA,HB4种构象导构体的生成热相近,因而室温下即可相互转化;(2)2(2)HA,HB酚羟基质子解离能力有差别,HA强于HB.(3)3(3)HA,HB存在两个分子内氢键,键能均在8kJ/mol左右,而且Ⅰ型构象键能低于Ⅱ型构象,HA低于HB;(4)4(4)当酚羟基键从形成氢键位置扭转180°左右时存在一能量低点,提示这种构象也是可能存在的;(5)5(5)HBMC的酚羟基氢与相邻的氮原子之问也形成分子内氢键,这是HBMC仍有光敏活性的结构基础.     

分子极性在DNA-蛋白质识别过程中的作用——对λ阻遏蛋白-操纵基因体系的研究

本文证明λ阻遏蛋白的电荷分布显示,分子的静电极性可能加速蛋白质向DNA分子的非特异性结合.分布于阻遏蛋白分子前26个残基的一片正电荷区可能提供一个非特异性结合面.此外,在许多DNA-蛋白质特异性识别过程中,蛋白质以二聚体为活力单位与DNA结合.这很可能也是由于有利于静电作用的缘故。     

2.4埃分辨率去五肽胰岛素结构的X射线研究——用镉反常散射解相角问题和模型结构的导出

本文证明2.4埃分辨率去五肽胰岛素三维结构已经解得.这个结构的测定没有使用重原子衍生物,而只用了由本晶体中镉离子的X射线散射(实部和虚部)获取的相角信息.这一相角信息具有0.56的总品质因数,由它计算的电子密度图可用来建立起蛋白质的初始模型.由于解相角问题所用方法目前仍属于一种新的方法,我们在文中将予以适当阐述。     

一种从人体胚胎中分离纯化的限制性核酸内切酶HsaI

从人、Homo sapiens、胚胎组织及细胞核的抽提物中分离纯化了一种核酸内切酶HsaI。它具有Ⅱ类核酸内切酶的功能、从该酶对λDNA的切割位点来看,它是EcoRI的同功酶,但在洗脱特性上不同于EcoRI。经SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析可得两条考马氏兰染色带,分子量分别为65000和22000 Daltons。     

肌酸激酶在胍溶液中的变性与失活速度的比较

本文以紫外差光谱、荧光光谱为监测手段测定肌酸激酶的变性与失活过程均为一级反应。在3M胍溶液中,30℃测得的失活速度常数为5.9秒~(-1),变性速度常数为1.9秒~(-1)。1M胍变性时,失活速度常数为4.3秒~(-1),而交性速度常数明显降低为0.04秒~(-1)。0.5M胍变性时,失活为两个一级过程,其速度常数分别为3.6秒~(-1)与0.003秒~(-1),此外酶还保持有3.4％的剩余活力;变性速度常数为0.004秒~(-1)。在0.3M胍中,酶的紫外差吸收及荧光变化都很小,但是60％的活力仍然迅速丧失,最后还保持有30％剩余活力。上述结果表明,酶的活性部位可能比较脆弱。酶分子双体的解聚或盐酸胍的抑制作用也可能引起酶的快速失活。低浓度胍变性时,失活过程的多相性意味着可能存在有部分活力的中间态。